MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_002578	ATC	2	6	1340232	1340237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25002	NC_002578	T	6	6	1340241	1340246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_002578	ATTATA	2	12	1340329	1340340	50 %	50 %	0 %	0 %	16082283
25004	NC_002578	TGT	2	6	1340345	1340350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082283
25005	NC_002578	ATT	2	6	1340415	1340420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
25006	NC_002578	TTG	2	6	1340566	1340571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082283
25007	NC_002578	TAT	2	6	1340603	1340608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
25008	NC_002578	AGA	3	9	1340650	1340658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082283
25009	NC_002578	AAT	2	6	1340859	1340864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
25010	NC_002578	ATA	2	6	1340870	1340875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
25011	NC_002578	CGG	2	6	1340974	1340979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082283
25012	NC_002578	AT	3	6	1341146	1341151	50 %	50 %	0 %	0 %	16082283
25013	NC_002578	ACA	2	6	1341186	1341191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082283
25014	NC_002578	GA	3	6	1341221	1341226	50 %	0 %	50 %	0 %	16082283
25015	NC_002578	ATT	2	6	1341270	1341275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082283
25016	NC_002578	ATC	2	6	1341288	1341293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082283
25017	NC_002578	AAT	2	6	1341417	1341422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082283
25018	NC_002578	GAAC	2	8	1341428	1341435	50 %	0 %	25 %	25 %	16082283
25019	NC_002578	GCC	2	6	1341519	1341524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082283
25020	NC_002578	TCA	2	6	1341547	1341552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082283
25021	NC_002578	ATG	2	6	1341722	1341727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25022	NC_002578	TAG	2	6	1341768	1341773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25023	NC_002578	AT	3	6	1341775	1341780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25024	NC_002578	ATT	2	6	1341783	1341788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25025	NC_002578	TAT	2	6	1341814	1341819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25026	NC_002578	GGA	2	6	1341839	1341844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25027	NC_002578	T	6	6	1341891	1341896	0 %	100 %	0 %	0 %	16082284
25028	NC_002578	AAG	2	6	1342004	1342009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082284
25029	NC_002578	AAG	2	6	1342012	1342017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082284
25030	NC_002578	GAT	2	6	1342061	1342066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082284
25031	NC_002578	TGG	2	6	1342092	1342097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082284
25032	NC_002578	CAG	2	6	1342139	1342144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082284
25033	NC_002578	AG	3	6	1342191	1342196	50 %	0 %	50 %	0 %	16082284
25034	NC_002578	GCA	2	6	1342210	1342215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082284
25035	NC_002578	AC	3	6	1342218	1342223	50 %	0 %	0 %	50 %	16082284
25036	NC_002578	AGATC	2	10	1342273	1342282	40 %	20 %	20 %	20 %	16082284
25037	NC_002578	CCG	2	6	1342308	1342313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082284
25038	NC_002578	ATCGG	2	10	1342343	1342352	20 %	20 %	40 %	20 %	16082284
25039	NC_002578	GAAG	2	8	1342408	1342415	50 %	0 %	50 %	0 %	16082284
25040	NC_002578	GAG	2	6	1342454	1342459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082284
25041	NC_002578	AGG	2	6	1342527	1342532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082284
25042	NC_002578	A	6	6	1342538	1342543	100 %	0 %	0 %	0 %	16082284
25043	NC_002578	AT	3	6	1342557	1342562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25044	NC_002578	CT	3	6	1342769	1342774	0 %	50 %	0 %	50 %	16082606
25045	NC_002578	AAG	2	6	1342777	1342782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082606
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25047	NC_002578	CA	3	6	1342944	1342949	50 %	0 %	0 %	50 %	16082606
25048	NC_002578	AGAT	2	8	1342990	1342997	50 %	25 %	25 %	0 %	16082606
25049	NC_002578	CAG	2	6	1343008	1343013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082606
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25052	NC_002578	AGG	2	6	1343154	1343159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082606
25053	NC_002578	CCG	2	6	1343202	1343207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082606
25054	NC_002578	AGA	2	6	1343240	1343245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082606
25055	NC_002578	TAT	2	6	1343294	1343299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25056	NC_002578	A	7	7	1343356	1343362	100 %	0 %	0 %	0 %	16082285
25057	NC_002578	TGC	2	6	1343366	1343371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082285
25058	NC_002578	ACA	2	6	1343429	1343434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082285
25059	NC_002578	ATT	2	6	1343438	1343443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082285
25060	NC_002578	TGT	2	6	1343487	1343492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082285
25061	NC_002578	TA	3	6	1343509	1343514	50 %	50 %	0 %	0 %	16082285
25062	NC_002578	GGA	2	6	1343627	1343632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082285
25063	NC_002578	GCG	2	6	1343813	1343818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082285
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25065	NC_002578	GCC	2	6	1343923	1343928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082285
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25068	NC_002578	CAA	2	6	1344022	1344027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082285
25069	NC_002578	CAGG	2	8	1344101	1344108	25 %	0 %	50 %	25 %	16082286
25070	NC_002578	GGAT	2	8	1344124	1344131	25 %	25 %	50 %	0 %	16082286
25071	NC_002578	CATA	2	8	1344135	1344142	50 %	25 %	0 %	25 %	16082286
25072	NC_002578	GGA	2	6	1344149	1344154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082286
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25079	NC_002578	CGG	2	6	1344495	1344500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082286
25080	NC_002578	AGG	2	6	1344540	1344545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082286
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25082	NC_002578	GATAT	2	10	1344656	1344665	40 %	40 %	20 %	0 %	16082286
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25085	NC_002578	GTGA	2	8	1344744	1344751	25 %	25 %	50 %	0 %	16082286
25086	NC_002578	CAG	2	6	1344767	1344772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082607
25087	NC_002578	TTCT	2	8	1344776	1344783	0 %	75 %	0 %	25 %	16082607
25088	NC_002578	CGA	2	6	1344849	1344854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082607
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25091	NC_002578	CG	3	6	1345079	1345084	0 %	0 %	50 %	50 %	16082607
25092	NC_002578	GAT	2	6	1345113	1345118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082607
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25094	NC_002578	ATG	2	6	1345193	1345198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082607
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25101	NC_002578	AAGG	2	8	1345607	1345614	50 %	0 %	50 %	0 %	16082287
25102	NC_002578	AGA	2	6	1345636	1345641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082287
25103	NC_002578	AAG	3	9	1345668	1345676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082287
25104	NC_002578	AG	3	6	1345675	1345680	50 %	0 %	50 %	0 %	16082287
25105	NC_002578	TGG	2	6	1345736	1345741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082287
25106	NC_002578	CTG	2	6	1345836	1345841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082664
25107	NC_002578	AGTGCG	2	12	1345848	1345859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082664
25108	NC_002578	A	6	6	1345896	1345901	100 %	0 %	0 %	0 %	16082664
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25113	NC_002578	CATATA	2	12	1346398	1346409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16082288
25114	NC_002578	ACT	2	6	1346529	1346534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082288
25115	NC_002578	GGA	2	6	1346554	1346559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082288
25116	NC_002578	AAAT	2	8	1346655	1346662	75 %	25 %	0 %	0 %	16082288
25117	NC_002578	ATG	2	6	1346709	1346714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082288
25118	NC_002578	ATG	2	6	1346754	1346759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082288
25119	NC_002578	GTT	2	6	1346797	1346802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082288
25120	NC_002578	GCAT	2	8	1346807	1346814	25 %	25 %	25 %	25 %	16082288
25121	NC_002578	A	6	6	1346827	1346832	100 %	0 %	0 %	0 %	16082288
25122	NC_002578	TGGT	2	8	1346913	1346920	0 %	50 %	50 %	0 %	16082288
25123	NC_002578	AT	3	6	1346968	1346973	50 %	50 %	0 %	0 %	16082288
25124	NC_002578	CAC	2	6	1347036	1347041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082288
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25127	NC_002578	CATAGA	2	12	1347216	1347227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082289
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25140	NC_002578	A	6	6	1347903	1347908	100 %	0 %	0 %	0 %	16082291
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25157	NC_002578	AT	3	6	1348861	1348866	50 %	50 %	0 %	0 %	16082608
25158	NC_002578	AT	3	6	1348870	1348875	50 %	50 %	0 %	0 %	16082608
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25176	NC_002578	TAT	2	6	1349967	1349972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25179	NC_002578	AGAA	2	8	1350090	1350097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25180	NC_002578	CAT	2	6	1350098	1350103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25182	NC_002578	ATG	2	6	1350224	1350229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25184	NC_002578	TTG	2	6	1350305	1350310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25187	NC_002578	AT	3	6	1350393	1350398	50 %	50 %	0 %	0 %	16082293
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25200	NC_002578	TTCTC	2	10	1350783	1350792	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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25205	NC_002578	ATC	2	6	1351009	1351014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082294
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25227	NC_002578	TTA	2	6	1352007	1352012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25228	NC_002578	A	6	6	1352042	1352047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25229	NC_002578	GTT	2	6	1352126	1352131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082295
25230	NC_002578	CGC	2	6	1352166	1352171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082295
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25232	NC_002578	GAG	2	6	1352336	1352341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082295
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25235	NC_002578	CGG	2	6	1352521	1352526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082295
25236	NC_002578	TCCG	2	8	1352638	1352645	0 %	25 %	25 %	50 %	16082295
25237	NC_002578	GAA	2	6	1352692	1352697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082295
25238	NC_002578	CGTGG	2	10	1352807	1352816	0 %	20 %	60 %	20 %	16082295
25239	NC_002578	TCA	2	6	1352850	1352855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082295
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25241	NC_002578	CGG	2	6	1352905	1352910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082295
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25360	NC_002578	TATGA	2	10	1359465	1359474	40 %	40 %	20 %	0 %	16082300
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25362	NC_002578	CTTC	2	8	1359529	1359536	0 %	50 %	0 %	50 %	16082300
25363	NC_002578	CTC	2	6	1359587	1359592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082300
25364	NC_002578	TC	3	6	1359591	1359596	0 %	50 %	0 %	50 %	16082300
25365	NC_002578	TTC	2	6	1359768	1359773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082300
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25367	NC_002578	ATG	2	6	1359912	1359917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082300
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25384	NC_002578	TTTA	2	8	1360697	1360704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25385	NC_002578	CAT	2	6	1360795	1360800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25387	NC_002578	ATTA	2	8	1360869	1360876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25388	NC_002578	GAT	2	6	1360901	1360906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082301
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25394	NC_002578	T	6	6	1361126	1361131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25395	NC_002578	AAG	2	6	1361352	1361357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082302
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25423	NC_002578	TCG	2	6	1362552	1362557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082303
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25431	NC_002578	CAT	2	6	1363235	1363240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25435	NC_002578	ATGG	2	8	1363403	1363410	25 %	25 %	50 %	0 %	16082304
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25454	NC_002578	TTCC	2	8	1364199	1364206	0 %	50 %	0 %	50 %	16082305
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25460	NC_002578	TGCT	2	8	1364468	1364475	0 %	50 %	25 %	25 %	16082305
25461	NC_002578	TTC	2	6	1364515	1364520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082305
25462	NC_002578	CCA	2	6	1364548	1364553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082305
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25464	NC_002578	AGC	2	6	1364889	1364894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082305
25465	NC_002578	T	6	6	1364936	1364941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25466	NC_002578	AGTA	2	8	1364995	1365002	50 %	25 %	25 %	0 %	16082306
25467	NC_002578	CT	3	6	1365007	1365012	0 %	50 %	0 %	50 %	16082306
25468	NC_002578	ATA	2	6	1365038	1365043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082306
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25471	NC_002578	GA	3	6	1365093	1365098	50 %	0 %	50 %	0 %	16082306
25472	NC_002578	ATG	2	6	1365127	1365132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082306
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25474	NC_002578	AT	3	6	1365249	1365254	50 %	50 %	0 %	0 %	16082306
25475	NC_002578	CAA	2	6	1365279	1365284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082306
25476	NC_002578	ATG	2	6	1365394	1365399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082306
25477	NC_002578	TAT	2	6	1365501	1365506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25478	NC_002578	CAT	2	6	1365631	1365636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25479	NC_002578	ATGC	2	8	1365772	1365779	25 %	25 %	25 %	25 %	16082666
25480	NC_002578	GCT	2	6	1365780	1365785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082666
25481	NC_002578	AAG	3	9	1365848	1365856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082666
25482	NC_002578	GGCA	2	8	1365865	1365872	25 %	0 %	50 %	25 %	16082666
25483	NC_002578	AAT	2	6	1365873	1365878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082666
25484	NC_002578	ACC	2	6	1365887	1365892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082610
25485	NC_002578	TCC	2	6	1365904	1365909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082610
25486	NC_002578	ACAA	2	8	1365921	1365928	75 %	0 %	0 %	25 %	16082610
25487	NC_002578	T	7	7	1365942	1365948	0 %	100 %	0 %	0 %	16082610
25488	NC_002578	TGC	2	6	1365998	1366003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082610
25489	NC_002578	ATG	2	6	1366027	1366032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082610
25490	NC_002578	TCA	2	6	1366183	1366188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082610
25491	NC_002578	ACTGAC	2	12	1366220	1366231	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082610
25492	NC_002578	TATT	2	8	1366547	1366554	25 %	75 %	0 %	0 %	16082610
25493	NC_002578	ACG	2	6	1366573	1366578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082610
25494	NC_002578	ATATC	2	10	1366626	1366635	40 %	40 %	0 %	20 %	16082610
25495	NC_002578	GTG	2	6	1366639	1366644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082610
25496	NC_002578	CGGA	2	8	1366715	1366722	25 %	0 %	50 %	25 %	16082307
25497	NC_002578	AAG	2	6	1366738	1366743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082307
25498	NC_002578	ACAT	2	8	1366802	1366809	50 %	25 %	0 %	25 %	16082307
25499	NC_002578	CGG	2	6	1366878	1366883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082307
25500	NC_002578	CAT	2	6	1366973	1366978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082307

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