MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_002578	CCTG	2	8	1314813	1314820	0 %	25 %	25 %	50 %	16082255
24502	NC_002578	GGC	2	6	1314823	1314828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082255
24503	NC_002578	GTA	2	6	1315083	1315088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082256
24504	NC_002578	ATGC	2	8	1315098	1315105	25 %	25 %	25 %	25 %	16082256
24505	NC_002578	CCG	2	6	1315112	1315117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082256
24506	NC_002578	CTT	2	6	1315218	1315223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082256
24507	NC_002578	TCTTGA	2	12	1315277	1315288	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082256
24508	NC_002578	TCA	2	6	1315306	1315311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082256
24509	NC_002578	GTA	2	6	1315481	1315486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082257
24510	NC_002578	GAA	2	6	1315525	1315530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082257
24511	NC_002578	ACC	2	6	1315541	1315546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082257
24512	NC_002578	TGT	2	6	1315635	1315640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082257
24513	NC_002578	GTT	2	6	1315684	1315689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082257
24514	NC_002578	TGC	2	6	1315713	1315718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082257
24515	NC_002578	GGT	2	6	1315792	1315797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082257
24516	NC_002578	CTTC	2	8	1315845	1315852	0 %	50 %	0 %	50 %	16082257
24517	NC_002578	TCA	2	6	1315932	1315937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082258
24518	NC_002578	TGT	2	6	1315945	1315950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082258
24519	NC_002578	AGTATA	2	12	1315955	1315966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082258
24520	NC_002578	CGG	2	6	1315977	1315982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082258
24521	NC_002578	CGC	2	6	1316046	1316051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082258
24522	NC_002578	TTAT	2	8	1316054	1316061	25 %	75 %	0 %	0 %	16082258
24523	NC_002578	TGC	2	6	1316173	1316178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082258
24524	NC_002578	TC	4	8	1316193	1316200	0 %	50 %	0 %	50 %	16082258
24525	NC_002578	CAT	2	6	1316238	1316243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082258
24526	NC_002578	TTC	2	6	1316255	1316260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082258
24527	NC_002578	TTCC	2	8	1316363	1316370	0 %	50 %	0 %	50 %	16082259
24528	NC_002578	TCT	2	6	1316403	1316408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082259
24529	NC_002578	AT	3	6	1316433	1316438	50 %	50 %	0 %	0 %	16082259
24530	NC_002578	TTC	2	6	1316463	1316468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082260
24531	NC_002578	ATCCT	2	10	1316527	1316536	20 %	40 %	0 %	40 %	16082260
24532	NC_002578	CT	3	6	1316541	1316546	0 %	50 %	0 %	50 %	16082260
24533	NC_002578	CGCCT	2	10	1316557	1316566	0 %	20 %	20 %	60 %	16082260
24534	NC_002578	GAAT	2	8	1316678	1316685	50 %	25 %	25 %	0 %	16082260
24535	NC_002578	TCTT	2	8	1316742	1316749	0 %	75 %	0 %	25 %	16082260
24536	NC_002578	CTT	2	6	1316810	1316815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082260
24537	NC_002578	CCT	2	6	1316958	1316963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082261
24538	NC_002578	TGG	2	6	1317021	1317026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082261
24539	NC_002578	CCT	2	6	1317033	1317038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082261
24540	NC_002578	CCTT	2	8	1317065	1317072	0 %	50 %	0 %	50 %	16082261
24541	NC_002578	TTG	2	6	1317134	1317139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082261
24542	NC_002578	TAT	2	6	1317154	1317159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082261
24543	NC_002578	CGT	2	6	1317243	1317248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082261
24544	NC_002578	TCA	2	6	1317336	1317341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082261
24545	NC_002578	TAC	2	6	1317367	1317372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082261
24546	NC_002578	CTT	2	6	1317424	1317429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082261
24547	NC_002578	CT	3	6	1317430	1317435	0 %	50 %	0 %	50 %	16082261
24548	NC_002578	GCC	2	6	1317482	1317487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082261
24549	NC_002578	AGC	2	6	1317533	1317538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082261
24550	NC_002578	TGAT	2	8	1317544	1317551	25 %	50 %	25 %	0 %	16082261
24551	NC_002578	ATGC	2	8	1317559	1317566	25 %	25 %	25 %	25 %	16082261
24552	NC_002578	TATCAT	2	12	1317649	1317660	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082261
24553	NC_002578	TCC	2	6	1317675	1317680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082661
24554	NC_002578	CTT	2	6	1317688	1317693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082661
24555	NC_002578	CCG	2	6	1317712	1317717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082661
24556	NC_002578	TTC	2	6	1317768	1317773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082661
24557	NC_002578	GCA	2	6	1317777	1317782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082661
24558	NC_002578	TTATC	2	10	1317790	1317799	20 %	60 %	0 %	20 %	16082661
24559	NC_002578	ACG	3	9	1317906	1317914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082661
24560	NC_002578	T	6	6	1318025	1318030	0 %	100 %	0 %	0 %	16082661
24561	NC_002578	GA	3	6	1318046	1318051	50 %	0 %	50 %	0 %	16082661
24562	NC_002578	CT	3	6	1318133	1318138	0 %	50 %	0 %	50 %	16082262
24563	NC_002578	GCA	2	6	1318197	1318202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082262
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24566	NC_002578	CTT	2	6	1318304	1318309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082262
24567	NC_002578	GCG	2	6	1318341	1318346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082262
24568	NC_002578	TTC	2	6	1318351	1318356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082262
24569	NC_002578	CCATG	2	10	1318365	1318374	20 %	20 %	20 %	40 %	16082262
24570	NC_002578	TGT	2	6	1318411	1318416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082262
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24572	NC_002578	CTT	2	6	1318597	1318602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082263
24573	NC_002578	CTTT	2	8	1318615	1318622	0 %	75 %	0 %	25 %	16082263
24574	NC_002578	CTG	2	6	1318639	1318644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082263
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24576	NC_002578	GACA	2	8	1318717	1318724	50 %	0 %	25 %	25 %	16082263
24577	NC_002578	CT	3	6	1318763	1318768	0 %	50 %	0 %	50 %	16082263
24578	NC_002578	CCT	2	6	1318814	1318819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082662
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24580	NC_002578	CAA	2	6	1318888	1318893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082662
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24582	NC_002578	CGAT	2	8	1319032	1319039	25 %	25 %	25 %	25 %	16082662
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24584	NC_002578	TCATT	2	10	1319071	1319080	20 %	60 %	0 %	20 %	16082662
24585	NC_002578	CGCT	2	8	1319084	1319091	0 %	25 %	25 %	50 %	16082603
24586	NC_002578	TCC	2	6	1319156	1319161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082603
24587	NC_002578	CCT	2	6	1319162	1319167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082603
24588	NC_002578	CTT	3	9	1319190	1319198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082603
24589	NC_002578	TCT	2	6	1319213	1319218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082603
24590	NC_002578	GAT	2	6	1319250	1319255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082603
24591	NC_002578	TCCC	2	8	1319322	1319329	0 %	25 %	0 %	75 %	16082603
24592	NC_002578	T	6	6	1319381	1319386	0 %	100 %	0 %	0 %	16082663
24593	NC_002578	CCTC	2	8	1319387	1319394	0 %	25 %	0 %	75 %	16082663
24594	NC_002578	GAA	2	6	1319455	1319460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082663
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24597	NC_002578	TCTG	2	8	1319543	1319550	0 %	50 %	25 %	25 %	16082663
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24601	NC_002578	CTG	2	6	1319992	1319997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082264
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24603	NC_002578	TC	3	6	1320169	1320174	0 %	50 %	0 %	50 %	16082264
24604	NC_002578	CTT	2	6	1320264	1320269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082265
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24607	NC_002578	GCT	2	6	1320365	1320370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082265
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24609	NC_002578	TG	3	6	1320422	1320427	0 %	50 %	50 %	0 %	16082265
24610	NC_002578	TTG	2	6	1320469	1320474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082265
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24620	NC_002578	AAC	2	6	1321016	1321021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082266
24621	NC_002578	TTA	2	6	1321071	1321076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082266
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24624	NC_002578	TGG	2	6	1321128	1321133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082267
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24736	NC_002578	GAT	2	6	1326529	1326534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082273
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24980	NC_002578	GCGTA	2	10	1339177	1339186	20 %	20 %	40 %	20 %	16082282
24981	NC_002578	GAT	2	6	1339277	1339282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082282
24982	NC_002578	TC	3	6	1339284	1339289	0 %	50 %	0 %	50 %	16082282
24983	NC_002578	CTTT	2	8	1339390	1339397	0 %	75 %	0 %	25 %	16082282
24984	NC_002578	GAA	2	6	1339398	1339403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082282
24985	NC_002578	GAG	2	6	1339425	1339430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082282
24986	NC_002578	TA	3	6	1339493	1339498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24987	NC_002578	GATT	2	8	1339505	1339512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24988	NC_002578	GAT	2	6	1339623	1339628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082605
24989	NC_002578	GTG	2	6	1339726	1339731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082605
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24991	NC_002578	AG	3	6	1339762	1339767	50 %	0 %	50 %	0 %	16082605
24992	NC_002578	GAG	2	6	1339782	1339787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082605
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24996	NC_002578	AG	3	6	1339850	1339855	50 %	0 %	50 %	0 %	16082605
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