MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_002578	ACC	2	6	1288565	1288570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082229
24003	NC_002578	GTG	2	6	1288572	1288577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082229
24004	NC_002578	AT	3	6	1288618	1288623	50 %	50 %	0 %	0 %	16082229
24005	NC_002578	GTT	2	6	1288641	1288646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082229
24006	NC_002578	CGG	2	6	1288693	1288698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082229
24007	NC_002578	AGA	2	6	1288699	1288704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082229
24008	NC_002578	GA	3	6	1288731	1288736	50 %	0 %	50 %	0 %	16082229
24009	NC_002578	AAG	2	6	1288748	1288753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082229
24010	NC_002578	TTC	2	6	1288785	1288790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082229
24011	NC_002578	AGAA	2	8	1288827	1288834	75 %	0 %	25 %	0 %	16082229
24012	NC_002578	TAT	2	6	1288853	1288858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082229
24013	NC_002578	GAA	2	6	1288963	1288968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082229
24014	NC_002578	GCCT	2	8	1288969	1288976	0 %	25 %	25 %	50 %	16082229
24015	NC_002578	TGC	2	6	1288981	1288986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082229
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24017	NC_002578	TA	3	6	1289027	1289032	50 %	50 %	0 %	0 %	16082229
24018	NC_002578	GAA	2	6	1289256	1289261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082229
24019	NC_002578	GTA	2	6	1289279	1289284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082229
24020	NC_002578	ATAGA	2	10	1289285	1289294	60 %	20 %	20 %	0 %	16082229
24021	NC_002578	GCA	2	6	1289386	1289391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082229
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24027	NC_002578	GCCGG	2	10	1289728	1289737	0 %	0 %	60 %	40 %	16082230
24028	NC_002578	TGT	2	6	1289828	1289833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082230
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24036	NC_002578	ATC	2	6	1290235	1290240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082230
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24039	NC_002578	TTA	2	6	1290325	1290330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24040	NC_002578	ATT	2	6	1290337	1290342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24041	NC_002578	TAA	2	6	1290346	1290351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24042	NC_002578	ATT	2	6	1290363	1290368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_002578	TA	3	6	1290381	1290386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24044	NC_002578	AAT	2	6	1290391	1290396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24045	NC_002578	ATT	2	6	1290401	1290406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24046	NC_002578	TCAA	2	8	1290430	1290437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24047	NC_002578	ATTT	2	8	1290496	1290503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24048	NC_002578	ATA	3	9	1290568	1290576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24049	NC_002578	TGCA	2	8	1290592	1290599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24052	NC_002578	ATA	2	6	1291015	1291020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_002578	T	7	7	1291071	1291077	0 %	100 %	0 %	0 %	16082231
24054	NC_002578	T	8	8	1291079	1291086	0 %	100 %	0 %	0 %	16082231
24055	NC_002578	TGG	2	6	1291256	1291261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082231
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24058	NC_002578	GCA	2	6	1291396	1291401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082231
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24066	NC_002578	AATC	2	8	1291809	1291816	50 %	25 %	0 %	25 %	16082231
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24068	NC_002578	T	6	6	1291892	1291897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24069	NC_002578	ACCAT	2	10	1291961	1291970	40 %	20 %	0 %	40 %	16082232
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24072	NC_002578	GAAG	2	8	1292148	1292155	50 %	0 %	50 %	0 %	16082232
24073	NC_002578	ATC	2	6	1292177	1292182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082232
24074	NC_002578	TCT	2	6	1292186	1292191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082232
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24076	NC_002578	AGG	2	6	1292261	1292266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082232
24077	NC_002578	CATC	2	8	1292272	1292279	25 %	25 %	0 %	50 %	16082232
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24081	NC_002578	GTC	2	6	1292368	1292373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082232
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24083	NC_002578	CGGC	2	8	1292447	1292454	0 %	0 %	50 %	50 %	16082232
24084	NC_002578	CATC	2	8	1292459	1292466	25 %	25 %	0 %	50 %	16082232
24085	NC_002578	GAT	3	9	1292476	1292484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082232
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24088	NC_002578	CG	3	6	1292540	1292545	0 %	0 %	50 %	50 %	16082232
24089	NC_002578	CTG	2	6	1292602	1292607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082232
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24092	NC_002578	GAT	2	6	1292730	1292735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082232
24093	NC_002578	AAGAT	2	10	1292812	1292821	60 %	20 %	20 %	0 %	16082232
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24101	NC_002578	AAG	2	6	1293332	1293337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082233
24102	NC_002578	TTG	2	6	1293342	1293347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082233
24103	NC_002578	TC	3	6	1293415	1293420	0 %	50 %	0 %	50 %	16082233
24104	NC_002578	ATG	2	6	1293440	1293445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082233
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24106	NC_002578	GAT	2	6	1293586	1293591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082233
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24109	NC_002578	GCT	2	6	1293707	1293712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082233
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24114	NC_002578	ATT	2	6	1294223	1294228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082234
24115	NC_002578	AG	3	6	1294234	1294239	50 %	0 %	50 %	0 %	16082234
24116	NC_002578	TCA	2	6	1294275	1294280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082234
24117	NC_002578	AG	3	6	1294304	1294309	50 %	0 %	50 %	0 %	16082234
24118	NC_002578	CAG	2	6	1294408	1294413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082234
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24120	NC_002578	ACC	2	6	1294462	1294467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082234
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24123	NC_002578	CCTTC	2	10	1294567	1294576	0 %	40 %	0 %	60 %	16082234
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24478	NC_002578	GT	3	6	1313620	1313625	0 %	50 %	50 %	0 %	16082254
24479	NC_002578	CTT	2	6	1313662	1313667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082254
24480	NC_002578	TCC	2	6	1313798	1313803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082254
24481	NC_002578	CT	3	6	1313828	1313833	0 %	50 %	0 %	50 %	16082254
24482	NC_002578	CTT	2	6	1313908	1313913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082254
24483	NC_002578	CAA	2	6	1313948	1313953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082254
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24486	NC_002578	TCT	2	6	1314007	1314012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082602
24487	NC_002578	CTT	2	6	1314074	1314079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082602
24488	NC_002578	TCT	2	6	1314173	1314178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082602
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24499	NC_002578	CTTTAT	2	12	1314772	1314783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16082255
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