MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_002578	CTC	2	6	1262325	1262330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082200
23503	NC_002578	TAA	2	6	1262344	1262349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082200
23504	NC_002578	CCA	2	6	1262363	1262368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082200
23505	NC_002578	TCC	2	6	1262458	1262463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082200
23506	NC_002578	CGC	2	6	1262621	1262626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082200
23507	NC_002578	A	6	6	1262685	1262690	100 %	0 %	0 %	0 %	16082200
23508	NC_002578	TTA	2	6	1262744	1262749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082201
23509	NC_002578	CAA	2	6	1262756	1262761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082201
23510	NC_002578	GTA	2	6	1262811	1262816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082201
23511	NC_002578	TGC	2	6	1262831	1262836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082201
23512	NC_002578	TCC	2	6	1262851	1262856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082201
23513	NC_002578	TAT	2	6	1262898	1262903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082201
23514	NC_002578	ACG	2	6	1262989	1262994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082201
23515	NC_002578	CT	3	6	1263022	1263027	0 %	50 %	0 %	50 %	16082201
23516	NC_002578	TCA	2	6	1263031	1263036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082201
23517	NC_002578	CCT	2	6	1263041	1263046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082201
23518	NC_002578	TCT	2	6	1263098	1263103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082201
23519	NC_002578	TC	3	6	1263134	1263139	0 %	50 %	0 %	50 %	16082201
23520	NC_002578	TATGA	2	10	1263151	1263160	40 %	40 %	20 %	0 %	16082201
23521	NC_002578	CAG	2	6	1263309	1263314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23522	NC_002578	AAT	2	6	1263350	1263355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23523	NC_002578	TA	3	6	1263369	1263374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23524	NC_002578	TTTC	2	8	1263484	1263491	0 %	75 %	0 %	25 %	16082202
23525	NC_002578	GGC	2	6	1263492	1263497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082202
23526	NC_002578	GATA	2	8	1263557	1263564	50 %	25 %	25 %	0 %	16082202
23527	NC_002578	GAC	2	6	1263593	1263598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23528	NC_002578	GAG	2	6	1263672	1263677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082202
23529	NC_002578	CAC	2	6	1263686	1263691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082202
23530	NC_002578	GCA	2	6	1263698	1263703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23531	NC_002578	CAA	2	6	1263800	1263805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082202
23532	NC_002578	GAT	2	6	1263812	1263817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082202
23533	NC_002578	GGA	2	6	1263860	1263865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082202
23534	NC_002578	CTG	2	6	1263937	1263942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23535	NC_002578	CAC	2	6	1263944	1263949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082202
23536	NC_002578	AGC	2	6	1263970	1263975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23537	NC_002578	TCCA	2	8	1264058	1264065	25 %	25 %	0 %	50 %	16082202
23538	NC_002578	GAA	2	6	1264301	1264306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082202
23539	NC_002578	CGG	2	6	1264373	1264378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082202
23540	NC_002578	TC	4	8	1264393	1264400	0 %	50 %	0 %	50 %	16082202
23541	NC_002578	TCG	2	6	1264543	1264548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23542	NC_002578	GAG	2	6	1264581	1264586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082202
23543	NC_002578	GTC	2	6	1264593	1264598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082202
23544	NC_002578	AT	3	6	1264639	1264644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23545	NC_002578	TTC	2	6	1264649	1264654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23546	NC_002578	GAT	2	6	1264670	1264675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082203
23547	NC_002578	G	6	6	1264686	1264691	0 %	0 %	100 %	0 %	16082203
23548	NC_002578	GCT	2	6	1264724	1264729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082203
23549	NC_002578	GTT	2	6	1264758	1264763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082203
23550	NC_002578	CGA	2	6	1264778	1264783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082203
23551	NC_002578	A	6	6	1264790	1264795	100 %	0 %	0 %	0 %	16082203
23552	NC_002578	AGAT	2	8	1264888	1264895	50 %	25 %	25 %	0 %	16082203
23553	NC_002578	GATCAG	2	12	1264985	1264996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082203
23554	NC_002578	ATC	2	6	1265019	1265024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082203
23555	NC_002578	ATA	2	6	1265076	1265081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082203
23556	NC_002578	GA	3	6	1265086	1265091	50 %	0 %	50 %	0 %	16082203
23557	NC_002578	CCA	2	6	1265137	1265142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082203
23558	NC_002578	AGG	2	6	1265181	1265186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082203
23559	NC_002578	GAA	2	6	1265192	1265197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082203
23560	NC_002578	CAG	2	6	1265238	1265243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082203
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23564	NC_002578	ACG	2	6	1265365	1265370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082203
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23567	NC_002578	ATAG	2	8	1265388	1265395	50 %	25 %	25 %	0 %	16082203
23568	NC_002578	AGC	2	6	1265421	1265426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082203
23569	NC_002578	GAG	2	6	1265564	1265569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082203
23570	NC_002578	AC	3	6	1265644	1265649	50 %	0 %	0 %	50 %	16082203
23571	NC_002578	TGCA	2	8	1265675	1265682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23572	NC_002578	AGA	2	6	1265785	1265790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082204
23573	NC_002578	ACC	2	6	1265883	1265888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082204
23574	NC_002578	TCC	2	6	1265890	1265895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082204
23575	NC_002578	ATT	2	6	1265919	1265924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082204
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23578	NC_002578	CTCC	2	8	1266108	1266115	0 %	25 %	0 %	75 %	16082204
23579	NC_002578	CGA	2	6	1266280	1266285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082204
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23581	NC_002578	GCCTAT	2	12	1266332	1266343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082204
23582	NC_002578	CATA	2	8	1266427	1266434	50 %	25 %	0 %	25 %	16082204
23583	NC_002578	GGAAC	2	10	1266449	1266458	40 %	0 %	40 %	20 %	16082204
23584	NC_002578	GAT	2	6	1266503	1266508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082204
23585	NC_002578	GCGAT	2	10	1266511	1266520	20 %	20 %	40 %	20 %	16082204
23586	NC_002578	A	6	6	1266521	1266526	100 %	0 %	0 %	0 %	16082204
23587	NC_002578	AGA	2	6	1266531	1266536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082204
23588	NC_002578	TAT	2	6	1266539	1266544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082204
23589	NC_002578	GGC	2	6	1266551	1266556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082204
23590	NC_002578	ATA	2	6	1266577	1266582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23591	NC_002578	TC	3	6	1266632	1266637	0 %	50 %	0 %	50 %	16082205
23592	NC_002578	CCT	2	6	1266641	1266646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082205
23593	NC_002578	TGG	2	6	1266674	1266679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082205
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23598	NC_002578	TCC	2	6	1267001	1267006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23599	NC_002578	AAAG	2	8	1267031	1267038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23600	NC_002578	TGT	2	6	1267047	1267052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23601	NC_002578	TTA	2	6	1267102	1267107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23602	NC_002578	ATTT	2	8	1267138	1267145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23603	NC_002578	ATA	2	6	1267149	1267154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23604	NC_002578	CTT	2	6	1267270	1267275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082206
23605	NC_002578	TC	3	6	1267443	1267448	0 %	50 %	0 %	50 %	16082206
23606	NC_002578	AG	3	6	1267488	1267493	50 %	0 %	50 %	0 %	16082206
23607	NC_002578	GGTT	2	8	1267526	1267533	0 %	50 %	50 %	0 %	16082206
23608	NC_002578	CCTG	2	8	1267572	1267579	0 %	25 %	25 %	50 %	16082206
23609	NC_002578	CCA	2	6	1267588	1267593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082206
23610	NC_002578	TCC	2	6	1267657	1267662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082206
23611	NC_002578	ATCCAG	2	12	1267692	1267703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082206
23612	NC_002578	CTT	2	6	1267764	1267769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082206
23613	NC_002578	GTCC	2	8	1267796	1267803	0 %	25 %	25 %	50 %	16082206
23614	NC_002578	TTC	2	6	1267813	1267818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082206
23615	NC_002578	CTT	3	9	1267875	1267883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082206
23616	NC_002578	TGATC	2	10	1267919	1267928	20 %	40 %	20 %	20 %	16082206
23617	NC_002578	AT	3	6	1267952	1267957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23619	NC_002578	T	6	6	1267973	1267978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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