MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_002578	TTC	2	6	1237745	1237750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082177
23003	NC_002578	ATT	2	6	1237813	1237818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082177
23004	NC_002578	TAT	2	6	1237860	1237865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082177
23005	NC_002578	TAT	2	6	1237905	1237910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082177
23006	NC_002578	CT	3	6	1237944	1237949	0 %	50 %	0 %	50 %	16082177
23007	NC_002578	CAG	2	6	1237997	1238002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082177
23008	NC_002578	AGTAAA	2	12	1238132	1238143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16082177
23009	NC_002578	TGT	2	6	1238174	1238179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082177
23010	NC_002578	CTT	2	6	1238258	1238263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082177
23011	NC_002578	CGCCAA	2	12	1238267	1238278	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16082177
23012	NC_002578	TAT	2	6	1238298	1238303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082177
23013	NC_002578	TTG	2	6	1238363	1238368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082177
23014	NC_002578	TAT	2	6	1238529	1238534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082177
23015	NC_002578	CCA	2	6	1238611	1238616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082177
23016	NC_002578	TCAT	2	8	1238629	1238636	25 %	50 %	0 %	25 %	16082177
23017	NC_002578	CCG	2	6	1238650	1238655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23018	NC_002578	ATCC	2	8	1238685	1238692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23019	NC_002578	CAG	2	6	1238776	1238781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23020	NC_002578	CAT	2	6	1238807	1238812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23021	NC_002578	AT	3	6	1238890	1238895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_002578	TAA	2	6	1238897	1238902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23023	NC_002578	ATA	2	6	1238906	1238911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23024	NC_002578	AAG	2	6	1239012	1239017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082178
23025	NC_002578	GAAA	2	8	1239021	1239028	75 %	0 %	25 %	0 %	16082178
23026	NC_002578	CT	3	6	1239078	1239083	0 %	50 %	0 %	50 %	16082178
23027	NC_002578	GGC	2	6	1239104	1239109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082178
23028	NC_002578	GGGT	2	8	1239138	1239145	0 %	25 %	75 %	0 %	16082178
23029	NC_002578	GGA	2	6	1239167	1239172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082178
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23033	NC_002578	ATA	2	6	1239216	1239221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082178
23034	NC_002578	GAA	2	6	1239258	1239263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082178
23035	NC_002578	GAT	2	6	1239353	1239358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082178
23036	NC_002578	TCTG	2	8	1239372	1239379	0 %	50 %	25 %	25 %	16082178
23037	NC_002578	ATT	2	6	1239495	1239500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23038	NC_002578	ATG	2	6	1239508	1239513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23039	NC_002578	ATT	2	6	1239562	1239567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23040	NC_002578	TGGC	2	8	1239606	1239613	0 %	25 %	50 %	25 %	16082179
23041	NC_002578	A	6	6	1239626	1239631	100 %	0 %	0 %	0 %	16082179
23042	NC_002578	GAAAA	2	10	1239633	1239642	80 %	0 %	20 %	0 %	16082179
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23046	NC_002578	GATA	2	8	1239913	1239920	50 %	25 %	25 %	0 %	16082179
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23053	NC_002578	GGA	2	6	1240277	1240282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_002578	GATA	2	8	1240420	1240427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_002578	TCC	2	6	1240436	1240441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23056	NC_002578	TGA	2	6	1240592	1240597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23057	NC_002578	AAG	2	6	1240621	1240626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_002578	CTG	2	6	1240632	1240637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23059	NC_002578	A	6	6	1240674	1240679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_002578	CTT	2	6	1240757	1240762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23061	NC_002578	AGA	2	6	1240788	1240793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23062	NC_002578	CAT	2	6	1240801	1240806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23063	NC_002578	CGAT	2	8	1240881	1240888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23064	NC_002578	TAA	2	6	1240902	1240907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23065	NC_002578	ATT	2	6	1240914	1240919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23066	NC_002578	GACA	2	8	1240961	1240968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23067	NC_002578	TCATG	2	10	1240969	1240978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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23069	NC_002578	AATA	2	8	1241092	1241099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23070	NC_002578	GAT	2	6	1241129	1241134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082180
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23075	NC_002578	AACC	2	8	1241513	1241520	50 %	0 %	0 %	50 %	16082180
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23088	NC_002578	TAAA	2	8	1242121	1242128	75 %	25 %	0 %	0 %	16082180
23089	NC_002578	AAC	2	6	1242135	1242140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082180
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23093	NC_002578	AGA	2	6	1242321	1242326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23094	NC_002578	TGA	3	9	1242331	1242339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23095	NC_002578	AT	3	6	1242380	1242385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23096	NC_002578	TCA	2	6	1242402	1242407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23097	NC_002578	TAA	3	9	1242459	1242467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23098	NC_002578	ATT	2	6	1242482	1242487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23101	NC_002578	TTG	2	6	1242664	1242669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082181
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23103	NC_002578	ATC	2	6	1242800	1242805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082181
23104	NC_002578	TC	4	8	1242878	1242885	0 %	50 %	0 %	50 %	16082181
23105	NC_002578	TC	3	6	1242909	1242914	0 %	50 %	0 %	50 %	16082181
23106	NC_002578	TCC	2	6	1243016	1243021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082181
23107	NC_002578	AT	3	6	1243112	1243117	50 %	50 %	0 %	0 %	16082181
23108	NC_002578	TAT	2	6	1243180	1243185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082181
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23110	NC_002578	TCT	2	6	1243242	1243247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082181
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23112	NC_002578	AT	3	6	1243291	1243296	50 %	50 %	0 %	0 %	16082181
23113	NC_002578	CTT	2	6	1243359	1243364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082181
23114	NC_002578	GAAA	2	8	1243406	1243413	75 %	0 %	25 %	0 %	16082181
23115	NC_002578	TCCATA	2	12	1243438	1243449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082181
23116	NC_002578	CAG	2	6	1243495	1243500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082181
23117	NC_002578	ATTTG	2	10	1243503	1243512	20 %	60 %	20 %	0 %	16082181
23118	NC_002578	TA	3	6	1243537	1243542	50 %	50 %	0 %	0 %	16082181
23119	NC_002578	CAT	2	6	1243664	1243669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082181
23120	NC_002578	A	6	6	1243729	1243734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23121	NC_002578	CTA	2	6	1243740	1243745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23122	NC_002578	TCAT	2	8	1243863	1243870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23123	NC_002578	ATT	2	6	1243934	1243939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082182
23124	NC_002578	CTT	2	6	1243944	1243949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082182
23125	NC_002578	GTA	2	6	1243962	1243967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082182
23126	NC_002578	TCCTG	2	10	1243996	1244005	0 %	40 %	20 %	40 %	16082182
23127	NC_002578	CTT	2	6	1244031	1244036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082182
23128	NC_002578	TCC	2	6	1244206	1244211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082658
23129	NC_002578	CGCCGA	2	12	1244228	1244239	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082658
23130	NC_002578	GAT	2	6	1244250	1244255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082658
23131	NC_002578	CTT	2	6	1244271	1244276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082658
23132	NC_002578	CCT	2	6	1244330	1244335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082658
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23139	NC_002578	TAAA	2	8	1244622	1244629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23140	NC_002578	TAT	2	6	1244636	1244641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23141	NC_002578	GAT	2	6	1244649	1244654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23142	NC_002578	ATA	2	6	1244685	1244690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23143	NC_002578	TAT	2	6	1244697	1244702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23144	NC_002578	AT	3	6	1244756	1244761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23145	NC_002578	TA	3	6	1244802	1244807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23146	NC_002578	ATA	2	6	1244832	1244837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082183
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23151	NC_002578	TAA	2	6	1245168	1245173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082183
23152	NC_002578	CCT	2	6	1245220	1245225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082183
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23154	NC_002578	TC	4	8	1245268	1245275	0 %	50 %	0 %	50 %	16082183
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23163	NC_002578	TCC	2	6	1245534	1245539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082184
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23170	NC_002578	TAA	2	6	1245870	1245875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23171	NC_002578	TAC	2	6	1245933	1245938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082185
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23175	NC_002578	GAT	2	6	1246028	1246033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082185
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23181	NC_002578	GAGAGT	2	12	1246332	1246343	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16082185
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23194	NC_002578	TGA	2	6	1246686	1246691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082186
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23222	NC_002578	ATGA	2	8	1248110	1248117	50 %	25 %	25 %	0 %	16082188
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23224	NC_002578	ATC	2	6	1248233	1248238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082188
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23230	NC_002578	GAGTA	2	10	1248752	1248761	40 %	20 %	40 %	0 %	16082188
23231	NC_002578	AT	3	6	1248797	1248802	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188
23232	NC_002578	TCT	2	6	1248810	1248815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082188
23233	NC_002578	CTG	2	6	1249007	1249012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082188
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23235	NC_002578	TAT	2	6	1249039	1249044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082188
23236	NC_002578	AT	3	6	1249072	1249077	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188
23237	NC_002578	GGC	2	6	1249096	1249101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082188
23238	NC_002578	TG	3	6	1249141	1249146	0 %	50 %	50 %	0 %	16082188
23239	NC_002578	TCAC	2	8	1249166	1249173	25 %	25 %	0 %	50 %	16082188
23240	NC_002578	TA	3	6	1249177	1249182	50 %	50 %	0 %	0 %	16082188
23241	NC_002578	GAA	2	6	1249183	1249188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082188
23242	NC_002578	TCC	2	6	1249251	1249256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082188
23243	NC_002578	CG	3	6	1249308	1249313	0 %	0 %	50 %	50 %	16082188
23244	NC_002578	CCAT	2	8	1249341	1249348	25 %	25 %	0 %	50 %	16082188
23245	NC_002578	AAG	2	6	1249448	1249453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082188
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23255	NC_002578	CTG	2	6	1249889	1249894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082596
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23261	NC_002578	ATTC	2	8	1250297	1250304	25 %	50 %	0 %	25 %	16082596
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23264	NC_002578	AT	3	6	1250612	1250617	50 %	50 %	0 %	0 %	16082189
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23291	NC_002578	AAT	2	6	1251624	1251629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23292	NC_002578	TATG	2	8	1251631	1251638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23293	NC_002578	CTTA	2	8	1251639	1251646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23294	NC_002578	AT	3	6	1251693	1251698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23295	NC_002578	CTG	2	6	1251788	1251793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082190
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23303	NC_002578	A	6	6	1252135	1252140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23304	NC_002578	A	6	6	1252151	1252156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23305	NC_002578	ATC	2	6	1252187	1252192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082191
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23343	NC_002578	AT	3	6	1254030	1254035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23344	NC_002578	T	6	6	1254065	1254070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23345	NC_002578	AT	3	6	1254131	1254136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23346	NC_002578	AAT	2	6	1254153	1254158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23347	NC_002578	TGA	2	6	1254173	1254178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082193
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23349	NC_002578	GACC	2	8	1254230	1254237	25 %	0 %	25 %	50 %	16082193
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23351	NC_002578	GAAC	2	8	1254326	1254333	50 %	0 %	25 %	25 %	16082193
23352	NC_002578	TGA	2	6	1254414	1254419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082193
23353	NC_002578	GAG	2	6	1254453	1254458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082193
23354	NC_002578	ATA	2	6	1254516	1254521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23355	NC_002578	CAT	2	6	1254523	1254528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23356	NC_002578	TGA	2	6	1254529	1254534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082194
23357	NC_002578	GCG	2	6	1254537	1254542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082194
23358	NC_002578	TCT	2	6	1254552	1254557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082194
23359	NC_002578	CTT	2	6	1254626	1254631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082194
23360	NC_002578	TGA	2	6	1254709	1254714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082194
23361	NC_002578	AGG	2	6	1254742	1254747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082194
23362	NC_002578	GAT	2	6	1254794	1254799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082194
23363	NC_002578	GCT	2	6	1254818	1254823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082194
23364	NC_002578	ATC	2	6	1254858	1254863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082194
23365	NC_002578	CAG	2	6	1254937	1254942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082194
23366	NC_002578	TTTA	2	8	1255043	1255050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23367	NC_002578	GAT	2	6	1255058	1255063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23368	NC_002578	GATACT	2	12	1255095	1255106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082597
23369	NC_002578	CTG	2	6	1255135	1255140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082597
23370	NC_002578	ATC	2	6	1255186	1255191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
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23373	NC_002578	TCA	2	6	1255391	1255396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082597
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23382	NC_002578	ATA	2	6	1255741	1255746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082597
23383	NC_002578	GCT	2	6	1255752	1255757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082597
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23395	NC_002578	CTG	3	9	1256380	1256388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23396	NC_002578	CAG	2	6	1256489	1256494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082195
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23405	NC_002578	AGG	2	6	1257173	1257178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23407	NC_002578	TCA	2	6	1257218	1257223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082196
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23453	NC_002578	CCGGG	2	10	1259615	1259624	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23454	NC_002578	A	6	6	1259775	1259780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23455	NC_002578	GT	3	6	1259918	1259923	0 %	50 %	50 %	0 %	16082198
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23471	NC_002578	TGC	2	6	1260847	1260852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082198
23472	NC_002578	CTT	2	6	1260853	1260858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082198
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23474	NC_002578	GTT	2	6	1260889	1260894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082198
23475	NC_002578	CT	3	6	1260950	1260955	0 %	50 %	0 %	50 %	16082198
23476	NC_002578	TCC	2	6	1261007	1261012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082198
23477	NC_002578	ATTT	2	8	1261033	1261040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23478	NC_002578	TA	3	6	1261054	1261059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23479	NC_002578	TTGC	2	8	1261094	1261101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23480	NC_002578	ATC	2	6	1261116	1261121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23481	NC_002578	TA	3	6	1261168	1261173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23482	NC_002578	GATG	2	8	1261254	1261261	25 %	25 %	50 %	0 %	16082199
23483	NC_002578	CATA	2	8	1261343	1261350	50 %	25 %	0 %	25 %	16082199
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