MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_002578	GCT	2	6	1153773	1153778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21502	NC_002578	TCT	2	6	1153792	1153797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21503	NC_002578	TCC	2	6	1153867	1153872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
21504	NC_002578	TCT	2	6	1153882	1153887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21505	NC_002578	TAT	2	6	1153907	1153912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082106
21506	NC_002578	TCT	2	6	1153936	1153941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21507	NC_002578	TGAAC	2	10	1153966	1153975	40 %	20 %	20 %	20 %	16082106
21508	NC_002578	TCG	2	6	1153992	1153997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21509	NC_002578	CAT	2	6	1154083	1154088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082106
21510	NC_002578	GCA	2	6	1154097	1154102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21511	NC_002578	TCTG	2	8	1154130	1154137	0 %	50 %	25 %	25 %	16082106
21512	NC_002578	GCTC	2	8	1154158	1154165	0 %	25 %	25 %	50 %	16082106
21513	NC_002578	CTT	2	6	1154183	1154188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21514	NC_002578	TGCAG	2	10	1154193	1154202	20 %	20 %	40 %	20 %	16082106
21515	NC_002578	CTG	2	6	1154213	1154218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21516	NC_002578	CAG	2	6	1154357	1154362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21517	NC_002578	GGCCAT	2	12	1154474	1154485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082106
21518	NC_002578	GAA	2	6	1154536	1154541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082106
21519	NC_002578	TAT	2	6	1154552	1154557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082106
21520	NC_002578	TCC	2	6	1154727	1154732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
21521	NC_002578	CCT	2	6	1154816	1154821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
21522	NC_002578	T	6	6	1154834	1154839	0 %	100 %	0 %	0 %	16082106
21523	NC_002578	CTC	2	6	1154939	1154944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082106
21524	NC_002578	TTC	2	6	1154960	1154965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21525	NC_002578	ATAA	2	8	1154989	1154996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21526	NC_002578	A	7	7	1155063	1155069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21527	NC_002578	CTT	2	6	1155152	1155157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082589
21528	NC_002578	TTC	2	6	1155171	1155176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082589
21529	NC_002578	CTC	2	6	1155275	1155280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082589
21530	NC_002578	GA	3	6	1155387	1155392	50 %	0 %	50 %	0 %	16082589
21531	NC_002578	AGA	2	6	1155397	1155402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082589
21532	NC_002578	T	7	7	1155499	1155505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21533	NC_002578	TA	3	6	1155508	1155513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21534	NC_002578	TGCC	2	8	1155633	1155640	0 %	25 %	25 %	50 %	16082107
21535	NC_002578	CTT	2	6	1155763	1155768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082107
21536	NC_002578	AGA	2	6	1155817	1155822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082107
21537	NC_002578	TGT	2	6	1155828	1155833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082107
21538	NC_002578	TGA	2	6	1155861	1155866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
21539	NC_002578	GAA	2	6	1155884	1155889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082107
21540	NC_002578	ACA	2	6	1155907	1155912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082107
21541	NC_002578	TAA	2	6	1155959	1155964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082107
21542	NC_002578	CAG	2	6	1155984	1155989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082107
21543	NC_002578	ACCA	2	8	1155993	1156000	50 %	0 %	0 %	50 %	16082107
21544	NC_002578	GATA	2	8	1156082	1156089	50 %	25 %	25 %	0 %	16082107
21545	NC_002578	GAT	2	6	1156204	1156209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
21546	NC_002578	TTG	2	6	1156300	1156305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082107
21547	NC_002578	CGC	2	6	1156320	1156325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082107
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21549	NC_002578	TGC	3	9	1156390	1156398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
21550	NC_002578	CAA	2	6	1156418	1156423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082107
21551	NC_002578	TA	3	6	1156440	1156445	50 %	50 %	0 %	0 %	16082107
21552	NC_002578	TTA	2	6	1156538	1156543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082107
21553	NC_002578	GAT	2	6	1156570	1156575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
21554	NC_002578	CCG	2	6	1156603	1156608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082107
21555	NC_002578	CTG	2	6	1156631	1156636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
21556	NC_002578	GGC	2	6	1156680	1156685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082107
21557	NC_002578	ATCT	2	8	1156695	1156702	25 %	50 %	0 %	25 %	16082107
21558	NC_002578	TCG	2	6	1156705	1156710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082107
21559	NC_002578	TTC	2	6	1156729	1156734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082107
21560	NC_002578	ATG	2	6	1156804	1156809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082107
21561	NC_002578	TAA	2	6	1156829	1156834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21562	NC_002578	AT	3	6	1156861	1156866	50 %	50 %	0 %	0 %	16082108
21563	NC_002578	AGCA	2	8	1156950	1156957	50 %	0 %	25 %	25 %	16082108
21564	NC_002578	ATA	2	6	1156965	1156970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082108
21565	NC_002578	GAA	2	6	1157065	1157070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082108
21566	NC_002578	GAT	2	6	1157103	1157108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082108
21567	NC_002578	ATC	2	6	1157142	1157147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082108
21568	NC_002578	TCT	2	6	1157212	1157217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082108
21569	NC_002578	ATTAT	2	10	1157331	1157340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21570	NC_002578	TCC	2	6	1157461	1157466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
21571	NC_002578	AT	3	6	1157488	1157493	50 %	50 %	0 %	0 %	16082109
21572	NC_002578	GGC	2	6	1157516	1157521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082109
21573	NC_002578	GCA	2	6	1157557	1157562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082109
21574	NC_002578	TATG	2	8	1157633	1157640	25 %	50 %	25 %	0 %	16082109
21575	NC_002578	CTT	2	6	1157645	1157650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082109
21576	NC_002578	GGA	2	6	1157655	1157660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082109
21577	NC_002578	GTT	2	6	1157667	1157672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082109
21578	NC_002578	TCC	2	6	1157703	1157708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
21579	NC_002578	ATCA	2	8	1157906	1157913	50 %	25 %	0 %	25 %	16082109
21580	NC_002578	AGGGA	2	10	1157914	1157923	40 %	0 %	60 %	0 %	16082109
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21582	NC_002578	AGAA	2	8	1158006	1158013	75 %	0 %	25 %	0 %	16082109
21583	NC_002578	GTCT	2	8	1158020	1158027	0 %	50 %	25 %	25 %	16082109
21584	NC_002578	TCC	2	6	1158048	1158053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
21585	NC_002578	GCT	2	6	1158062	1158067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082109
21586	NC_002578	CCT	2	6	1158174	1158179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082109
21587	NC_002578	CTGA	2	8	1158245	1158252	25 %	25 %	25 %	25 %	16082109
21588	NC_002578	GA	3	6	1158296	1158301	50 %	0 %	50 %	0 %	16082109
21589	NC_002578	TAT	2	6	1158308	1158313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082109
21590	NC_002578	AGAT	2	8	1158336	1158343	50 %	25 %	25 %	0 %	16082109
21591	NC_002578	AGA	2	6	1158358	1158363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082109
21592	NC_002578	GGTATT	2	12	1158399	1158410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16082109
21593	NC_002578	TCTG	2	8	1158437	1158444	0 %	50 %	25 %	25 %	16082109
21594	NC_002578	GTACT	2	10	1158461	1158470	20 %	40 %	20 %	20 %	16082109
21595	NC_002578	AGA	2	6	1158488	1158493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082109
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21598	NC_002578	CCA	2	6	1158697	1158702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21599	NC_002578	TAA	2	6	1158704	1158709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21600	NC_002578	CCG	2	6	1158715	1158720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21601	NC_002578	TA	3	6	1158757	1158762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21602	NC_002578	GAA	2	6	1158763	1158768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_002578	AAG	2	6	1158838	1158843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082110
21604	NC_002578	GAAA	2	8	1158848	1158855	75 %	0 %	25 %	0 %	16082110
21605	NC_002578	ATG	2	6	1158882	1158887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082110
21606	NC_002578	AGA	2	6	1159008	1159013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082110
21607	NC_002578	TCGA	2	8	1159058	1159065	25 %	25 %	25 %	25 %	16082110
21608	NC_002578	TGC	2	6	1159066	1159071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082110
21609	NC_002578	AAC	2	6	1159091	1159096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082110
21610	NC_002578	AG	3	6	1159248	1159253	50 %	0 %	50 %	0 %	16082110
21611	NC_002578	TGA	2	6	1159310	1159315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082110
21612	NC_002578	CTG	3	9	1159359	1159367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082111
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21614	NC_002578	GAG	2	6	1159492	1159497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082111
21615	NC_002578	GCA	2	6	1159532	1159537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
21616	NC_002578	CAG	2	6	1159595	1159600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082111
21617	NC_002578	AGA	2	6	1159620	1159625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082111
21618	NC_002578	A	6	6	1159627	1159632	100 %	0 %	0 %	0 %	16082111
21619	NC_002578	TGAA	2	8	1159662	1159669	50 %	25 %	25 %	0 %	16082111
21620	NC_002578	AGGC	2	8	1159709	1159716	25 %	0 %	50 %	25 %	16082111
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21623	NC_002578	TA	3	6	1159961	1159966	50 %	50 %	0 %	0 %	16082111
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21731	NC_002578	TCT	2	6	1165772	1165777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21734	NC_002578	CTA	2	6	1165923	1165928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21736	NC_002578	ACC	2	6	1165981	1165986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21737	NC_002578	ACAG	2	8	1166048	1166055	50 %	0 %	25 %	25 %	16082118
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