MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_002578	CGG	2	6	1126051	1126056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082084
21003	NC_002578	CTT	2	6	1126088	1126093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082084
21004	NC_002578	TAT	2	6	1126211	1126216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082084
21005	NC_002578	TGC	2	6	1126222	1126227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082084
21006	NC_002578	GT	3	6	1126239	1126244	0 %	50 %	50 %	0 %	16082084
21007	NC_002578	TTG	2	6	1126401	1126406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082084
21008	NC_002578	TCC	2	6	1126443	1126448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082084
21009	NC_002578	CCT	2	6	1126536	1126541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082084
21010	NC_002578	ATCGC	2	10	1126614	1126623	20 %	20 %	20 %	40 %	16082084
21011	NC_002578	GTTG	2	8	1126652	1126659	0 %	50 %	50 %	0 %	16082084
21012	NC_002578	CAG	2	6	1126694	1126699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082084
21013	NC_002578	TCA	2	6	1126776	1126781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
21014	NC_002578	ATC	2	6	1126784	1126789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
21015	NC_002578	CAT	2	6	1126790	1126795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
21016	NC_002578	GCC	2	6	1126839	1126844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082084
21017	NC_002578	CCA	2	6	1126885	1126890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082084
21018	NC_002578	AGCGA	2	10	1126897	1126906	40 %	0 %	40 %	20 %	16082084
21019	NC_002578	CT	3	6	1127033	1127038	0 %	50 %	0 %	50 %	16082084
21020	NC_002578	TCAACT	2	12	1127148	1127159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
21021	NC_002578	TTC	2	6	1127217	1127222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082085
21022	NC_002578	TCC	2	6	1127231	1127236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
21023	NC_002578	TC	3	6	1127249	1127254	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
21024	NC_002578	CCT	2	6	1127282	1127287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
21025	NC_002578	GTC	2	6	1127338	1127343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21026	NC_002578	GCT	2	6	1127351	1127356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21027	NC_002578	TAT	2	6	1127391	1127396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
21028	NC_002578	GGT	2	6	1127488	1127493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082085
21029	NC_002578	GAA	3	9	1127541	1127549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082085
21030	NC_002578	CAG	2	6	1127556	1127561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21031	NC_002578	CATCGG	2	12	1127585	1127596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21032	NC_002578	ATT	2	6	1127602	1127607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
21033	NC_002578	CTT	2	6	1127625	1127630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082085
21034	NC_002578	ATGA	2	8	1127679	1127686	50 %	25 %	25 %	0 %	16082085
21035	NC_002578	TCC	2	6	1127793	1127798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
21036	NC_002578	CCG	2	6	1127878	1127883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082085
21037	NC_002578	CCTT	2	8	1127921	1127928	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
21038	NC_002578	TAT	2	6	1127967	1127972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
21039	NC_002578	GCT	2	6	1128051	1128056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21040	NC_002578	CTTC	2	8	1128131	1128138	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
21041	NC_002578	TCG	2	6	1128142	1128147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21042	NC_002578	TTG	2	6	1128175	1128180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
21043	NC_002578	CCT	2	6	1128244	1128249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
21044	NC_002578	TGT	2	6	1128263	1128268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
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21046	NC_002578	ATG	2	6	1128423	1128428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082085
21047	NC_002578	TCC	2	6	1128436	1128441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
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21049	NC_002578	GTC	2	6	1128538	1128543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21050	NC_002578	TAT	2	6	1128573	1128578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082085
21051	NC_002578	GTA	2	6	1128684	1128689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082085
21052	NC_002578	TC	3	6	1128700	1128705	0 %	50 %	0 %	50 %	16082085
21053	NC_002578	CAC	2	6	1128708	1128713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082085
21054	NC_002578	T	6	6	1128724	1128729	0 %	100 %	0 %	0 %	16082085
21055	NC_002578	TGT	2	6	1128848	1128853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
21056	NC_002578	TCC	2	6	1128892	1128897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082085
21057	NC_002578	CTG	2	6	1128937	1128942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082085
21058	NC_002578	TCA	2	6	1128961	1128966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082085
21059	NC_002578	TGT	2	6	1128971	1128976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082085
21060	NC_002578	GGT	2	6	1128995	1129000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082085
21061	NC_002578	GTATCT	2	12	1129070	1129081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082085
21062	NC_002578	TGT	2	6	1129124	1129129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21063	NC_002578	T	6	6	1129183	1129188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21064	NC_002578	ATG	2	6	1129197	1129202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_002578	TCC	2	6	1129274	1129279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21066	NC_002578	TA	4	8	1129295	1129302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_002578	ATG	2	6	1129324	1129329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082086
21068	NC_002578	GCG	3	9	1129355	1129363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082086
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21071	NC_002578	GA	3	6	1129535	1129540	50 %	0 %	50 %	0 %	16082086
21072	NC_002578	AGGA	2	8	1129690	1129697	50 %	0 %	50 %	0 %	16082585
21073	NC_002578	GCG	2	6	1129706	1129711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082585
21074	NC_002578	AGA	2	6	1129751	1129756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082585
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21077	NC_002578	GAT	2	6	1130020	1130025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082585
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21079	NC_002578	GCA	2	6	1130089	1130094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082585
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21081	NC_002578	GATCT	2	10	1130160	1130169	20 %	40 %	20 %	20 %	16082585
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21083	NC_002578	TA	3	6	1130213	1130218	50 %	50 %	0 %	0 %	16082087
21084	NC_002578	CTG	2	6	1130240	1130245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082087
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21087	NC_002578	CT	3	6	1130474	1130479	0 %	50 %	0 %	50 %	16082087
21088	NC_002578	TCC	2	6	1130567	1130572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082087
21089	NC_002578	GC	3	6	1130628	1130633	0 %	0 %	50 %	50 %	16082087
21090	NC_002578	GTTT	2	8	1130658	1130665	0 %	75 %	25 %	0 %	16082087
21091	NC_002578	TTC	2	6	1130854	1130859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082087
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21099	NC_002578	TTC	2	6	1131341	1131346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082088
21100	NC_002578	CGA	2	6	1131389	1131394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082088
21101	NC_002578	GTAT	2	8	1131419	1131426	25 %	50 %	25 %	0 %	16082088
21102	NC_002578	CTT	2	6	1131455	1131460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082088
21103	NC_002578	TTA	2	6	1131489	1131494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21104	NC_002578	TGC	2	6	1131521	1131526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21105	NC_002578	TCG	2	6	1131613	1131618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082586
21106	NC_002578	TCC	2	6	1131633	1131638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082586
21107	NC_002578	CTT	2	6	1131639	1131644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082586
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21109	NC_002578	TTG	2	6	1131706	1131711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082586
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21113	NC_002578	TAT	2	6	1131864	1131869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082586
21114	NC_002578	AAG	2	6	1131925	1131930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082586
21115	NC_002578	ATT	2	6	1131939	1131944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082586
21116	NC_002578	CTGT	2	8	1131955	1131962	0 %	50 %	25 %	25 %	16082586
21117	NC_002578	G	6	6	1132005	1132010	0 %	0 %	100 %	0 %	16082586
21118	NC_002578	CTG	2	6	1132129	1132134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082586
21119	NC_002578	CT	3	6	1132171	1132176	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
21120	NC_002578	CTTC	2	8	1132202	1132209	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
21121	NC_002578	GC	3	6	1132267	1132272	0 %	0 %	50 %	50 %	16082586
21122	NC_002578	TCA	2	6	1132282	1132287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082586
21123	NC_002578	GTG	2	6	1132393	1132398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082586
21124	NC_002578	GA	3	6	1132423	1132428	50 %	0 %	50 %	0 %	16082586
21125	NC_002578	ATC	2	6	1132516	1132521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082586
21126	NC_002578	TC	3	6	1132602	1132607	0 %	50 %	0 %	50 %	16082586
21127	NC_002578	GTGC	2	8	1132655	1132662	0 %	25 %	50 %	25 %	16082586
21128	NC_002578	CAC	2	6	1132683	1132688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082586
21129	NC_002578	CTTA	2	8	1132858	1132865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21130	NC_002578	GAT	2	6	1132895	1132900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21131	NC_002578	AT	3	6	1132927	1132932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21132	NC_002578	GATA	2	8	1132950	1132957	50 %	25 %	25 %	0 %	16082587
21133	NC_002578	TGC	2	6	1132975	1132980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
21134	NC_002578	GCT	2	6	1133075	1133080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
21135	NC_002578	ACC	2	6	1133128	1133133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082587
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21138	NC_002578	CTG	2	6	1133292	1133297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
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21141	NC_002578	CTG	2	6	1133382	1133387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082587
21142	NC_002578	GAT	2	6	1133406	1133411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082587
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21144	NC_002578	GAT	2	6	1133481	1133486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082089
21145	NC_002578	TTC	2	6	1133515	1133520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082089
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21149	NC_002578	TGC	2	6	1133921	1133926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082089
21150	NC_002578	ATCT	2	8	1133944	1133951	25 %	50 %	0 %	25 %	16082089
21151	NC_002578	ATG	2	6	1133954	1133959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082089
21152	NC_002578	AGCG	2	8	1133962	1133969	25 %	0 %	50 %	25 %	16082089
21153	NC_002578	TC	3	6	1134004	1134009	0 %	50 %	0 %	50 %	16082089
21154	NC_002578	TCAT	2	8	1134025	1134032	25 %	50 %	0 %	25 %	16082089
21155	NC_002578	GTT	2	6	1134087	1134092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082089
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21158	NC_002578	GGAT	2	8	1134161	1134168	25 %	25 %	50 %	0 %	16082089
21159	NC_002578	TTC	2	6	1134232	1134237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082089
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21162	NC_002578	GGC	2	6	1134360	1134365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082089
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21167	NC_002578	CTG	2	6	1134485	1134490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082089
21168	NC_002578	TCAT	2	8	1134508	1134515	25 %	50 %	0 %	25 %	16082089
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21184	NC_002578	ACTGA	2	10	1135665	1135674	40 %	20 %	20 %	20 %	16082090
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21194	NC_002578	ATAAC	2	10	1136450	1136459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21195	NC_002578	AT	3	6	1136516	1136521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21196	NC_002578	AGT	2	6	1136568	1136573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21198	NC_002578	CAA	2	6	1136790	1136795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21199	NC_002578	TAC	2	6	1136824	1136829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082091
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21207	NC_002578	TACCT	2	10	1137182	1137191	20 %	40 %	0 %	40 %	16082091
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21209	NC_002578	A	7	7	1137486	1137492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21210	NC_002578	CT	3	6	1137535	1137540	0 %	50 %	0 %	50 %	16082092
21211	NC_002578	CCCTG	2	10	1137643	1137652	0 %	20 %	20 %	60 %	16082092
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21221	NC_002578	CTG	2	6	1138218	1138223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082093
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21224	NC_002578	CAT	2	6	1138334	1138339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082093
21225	NC_002578	TCG	2	6	1138342	1138347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082093
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21227	NC_002578	C	6	6	1138530	1138535	0 %	0 %	0 %	100 %	16082093
21228	NC_002578	GGCC	2	8	1138698	1138705	0 %	0 %	50 %	50 %	16082093
21229	NC_002578	TCC	2	6	1138821	1138826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082093
21230	NC_002578	TCG	2	6	1138896	1138901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082093
21231	NC_002578	GAT	2	6	1138922	1138927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082093
21232	NC_002578	TCT	2	6	1138933	1138938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082093
21233	NC_002578	CCTCCG	2	12	1139190	1139201	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	16082093
21234	NC_002578	CGT	2	6	1139230	1139235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082093
21235	NC_002578	ATC	2	6	1139256	1139261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082093
21236	NC_002578	CTG	2	6	1139301	1139306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082093
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21238	NC_002578	CCT	2	6	1139553	1139558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082093
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21254	NC_002578	TCT	2	6	1140147	1140152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082094
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21297	NC_002578	CTTCC	2	10	1142430	1142439	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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21336	NC_002578	TTC	2	6	1144384	1144389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21353	NC_002578	CTGC	2	8	1145304	1145311	0 %	25 %	25 %	50 %	16082099
21354	NC_002578	TCCT	2	8	1145375	1145382	0 %	50 %	0 %	50 %	16082099
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21357	NC_002578	AAG	2	6	1145442	1145447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082099
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21359	NC_002578	CTG	2	6	1145666	1145671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082099
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21363	NC_002578	TTCC	2	8	1145887	1145894	0 %	50 %	0 %	50 %	16082099
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21459	NC_002578	T	6	6	1150761	1150766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21460	NC_002578	CAA	2	6	1150777	1150782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21472	NC_002578	AGGA	2	8	1151625	1151632	50 %	0 %	50 %	0 %	16082104
21473	NC_002578	TCG	2	6	1151686	1151691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082104
21474	NC_002578	GAT	2	6	1151714	1151719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082104
21475	NC_002578	CTT	2	6	1151896	1151901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082105
21476	NC_002578	ATA	2	6	1151906	1151911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082105
21477	NC_002578	TTG	2	6	1151958	1151963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082105
21478	NC_002578	TTCA	2	8	1152031	1152038	25 %	50 %	0 %	25 %	16082105
21479	NC_002578	GAT	3	9	1152109	1152117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082105
21480	NC_002578	CGG	2	6	1152169	1152174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082105
21481	NC_002578	T	6	6	1152246	1152251	0 %	100 %	0 %	0 %	16082105
21482	NC_002578	GAT	4	12	1152283	1152294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082105
21483	NC_002578	TC	4	8	1152415	1152422	0 %	50 %	0 %	50 %	16082105
21484	NC_002578	GATC	2	8	1152546	1152553	25 %	25 %	25 %	25 %	16082105
21485	NC_002578	TCA	2	6	1152626	1152631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082105
21486	NC_002578	CAG	2	6	1152741	1152746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298205267
21487	NC_002578	T	7	7	1152757	1152763	0 %	100 %	0 %	0 %	298205267
21488	NC_002578	ATCAGT	2	12	1152800	1152811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298205267
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21490	NC_002578	ATT	2	6	1153004	1153009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298205267
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21494	NC_002578	GCTG	2	8	1153388	1153395	0 %	25 %	50 %	25 %	16082106
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21499	NC_002578	TCT	2	6	1153696	1153701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082106
21500	NC_002578	CTG	2	6	1153727	1153732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082106

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