MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_002578	TCA	2	6	858544	858549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082559
16003	NC_002578	ATA	2	6	858603	858608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082559
16004	NC_002578	CAG	2	6	858746	858751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082559
16005	NC_002578	TTC	2	6	858801	858806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082559
16006	NC_002578	TC	3	6	858805	858810	0 %	50 %	0 %	50 %	16082559
16007	NC_002578	TGGT	2	8	858811	858818	0 %	50 %	50 %	0 %	16082559
16008	NC_002578	AGG	2	6	859084	859089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082560
16009	NC_002578	AGG	2	6	859118	859123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082560
16010	NC_002578	CG	3	6	859214	859219	0 %	0 %	50 %	50 %	16082560
16011	NC_002578	GCAT	2	8	859228	859235	25 %	25 %	25 %	25 %	16082560
16012	NC_002578	ACGTT	2	10	859281	859290	20 %	40 %	20 %	20 %	16082560
16013	NC_002578	CTA	2	6	859293	859298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082560
16014	NC_002578	GTC	2	6	859318	859323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082560
16015	NC_002578	CTT	2	6	859420	859425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082560
16016	NC_002578	CAT	2	6	859580	859585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082560
16017	NC_002578	CCG	2	6	859628	859633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082560
16018	NC_002578	GAA	2	6	859687	859692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082560
16019	NC_002578	CGC	2	6	859694	859699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082560
16020	NC_002578	CGG	2	6	859710	859715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082560
16021	NC_002578	ATG	2	6	859741	859746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082560
16022	NC_002578	AAG	2	6	859764	859769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082560
16023	NC_002578	AT	3	6	859855	859860	50 %	50 %	0 %	0 %	16082560
16024	NC_002578	GGTC	2	8	859871	859878	0 %	25 %	50 %	25 %	16082560
16025	NC_002578	ATA	2	6	859893	859898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081865
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16027	NC_002578	CTA	2	6	859931	859936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081865
16028	NC_002578	TCCGT	2	10	859939	859948	0 %	40 %	20 %	40 %	16081865
16029	NC_002578	ACG	2	6	859975	859980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081865
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16033	NC_002578	CAA	2	6	860452	860457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081866
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16037	NC_002578	CACT	2	8	860668	860675	25 %	25 %	0 %	50 %	16081866
16038	NC_002578	TGA	2	6	860749	860754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081866
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16041	NC_002578	GA	3	6	860834	860839	50 %	0 %	50 %	0 %	16081866
16042	NC_002578	GAG	2	6	860879	860884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081866
16043	NC_002578	A	6	6	860906	860911	100 %	0 %	0 %	0 %	16081866
16044	NC_002578	TGGA	2	8	860916	860923	25 %	25 %	50 %	0 %	16081866
16045	NC_002578	ACA	2	6	860943	860948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081866
16046	NC_002578	ATA	2	6	861134	861139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081866
16047	NC_002578	AT	4	8	861213	861220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_002578	TTC	3	9	861304	861312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081867
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16053	NC_002578	GA	3	6	861452	861457	50 %	0 %	50 %	0 %	16081867
16054	NC_002578	AGA	2	6	861492	861497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081867
16055	NC_002578	ATA	2	6	861518	861523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081867
16056	NC_002578	GGA	2	6	861526	861531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081867
16057	NC_002578	AGG	2	6	861549	861554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081867
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16059	NC_002578	TAC	2	6	861593	861598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081867
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16061	NC_002578	CGT	2	6	861642	861647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081867
16062	NC_002578	CCGG	2	8	861716	861723	0 %	0 %	50 %	50 %	16081867
16063	NC_002578	GTT	2	6	861770	861775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081867
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16065	NC_002578	TCG	2	6	861828	861833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081867
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16079	NC_002578	CA	3	6	862604	862609	50 %	0 %	0 %	50 %	16081867
16080	NC_002578	CAGG	2	8	862628	862635	25 %	0 %	50 %	25 %	16081867
16081	NC_002578	CTGAAG	2	12	862667	862678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081867
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16083	NC_002578	ATT	2	6	862775	862780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_002578	TCGG	2	8	862829	862836	0 %	25 %	50 %	25 %	16081868
16085	NC_002578	CTG	2	6	862844	862849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081868
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16092	NC_002578	TCCT	2	8	863420	863427	0 %	50 %	0 %	50 %	16081868
16093	NC_002578	AGC	2	6	863453	863458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081868
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16098	NC_002578	TAC	2	6	863698	863703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081868
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16106	NC_002578	CGCC	2	8	863985	863992	0 %	0 %	25 %	75 %	16081868
16107	NC_002578	CTT	2	6	864007	864012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081868
16108	NC_002578	TATCA	2	10	864265	864274	40 %	40 %	0 %	20 %	16081868
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16113	NC_002578	CG	3	6	864507	864512	0 %	0 %	50 %	50 %	16081868
16114	NC_002578	CCAC	2	8	864587	864594	25 %	0 %	0 %	75 %	16081868
16115	NC_002578	TAA	2	6	864606	864611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_002578	GTT	2	6	864614	864619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_002578	AT	3	6	864624	864629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_002578	CGAT	2	8	864684	864691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16119	NC_002578	ATT	2	6	864693	864698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16123	NC_002578	GAT	2	6	865099	865104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081869
16124	NC_002578	ACG	2	6	865155	865160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081869
16125	NC_002578	GAT	2	6	865195	865200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081869
16126	NC_002578	ATG	2	6	865287	865292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081869
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16167	NC_002578	GAT	2	6	867030	867035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16183	NC_002578	CCGG	2	8	868029	868036	0 %	0 %	50 %	50 %	16081871
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16209	NC_002578	ACG	2	6	869045	869050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081872
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16212	NC_002578	CTTC	2	8	869136	869143	0 %	50 %	0 %	50 %	16081872
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16214	NC_002578	GCA	2	6	869167	869172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081872
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16230	NC_002578	GTACGA	2	12	870277	870288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081873
16231	NC_002578	ACT	2	6	870387	870392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081873
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16233	NC_002578	CTT	2	6	870697	870702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081873
16234	NC_002578	CAG	2	6	870706	870711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081873
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16237	NC_002578	GGATC	2	10	870926	870935	20 %	20 %	40 %	20 %	16081873
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16242	NC_002578	ATCG	2	8	871162	871169	25 %	25 %	25 %	25 %	16081873
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16491	NC_002578	TAGA	2	8	884859	884866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16492	NC_002578	GAT	3	9	884873	884881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16493	NC_002578	ATC	2	6	884914	884919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16494	NC_002578	TC	3	6	884976	884981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16495	NC_002578	GA	3	6	884989	884994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16496	NC_002578	AT	3	6	885031	885036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16497	NC_002578	CCT	2	6	885065	885070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16498	NC_002578	ATTTT	2	10	885106	885115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16499	NC_002578	TCTT	2	8	885310	885317	0 %	75 %	0 %	25 %	16081884
16500	NC_002578	ATT	2	6	885377	885382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081884

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