MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_002578	TGC	2	6	832137	832142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081853
15502	NC_002578	CGA	2	6	832154	832159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081853
15503	NC_002578	CTT	2	6	832161	832166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081853
15504	NC_002578	TAT	2	6	832242	832247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_002578	CTC	2	6	832248	832253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15506	NC_002578	ACGA	2	8	832302	832309	50 %	0 %	25 %	25 %	16081854
15507	NC_002578	ATC	2	6	832413	832418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081854
15508	NC_002578	ATGA	2	8	832512	832519	50 %	25 %	25 %	0 %	16081854
15509	NC_002578	GAT	2	6	832605	832610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081854
15510	NC_002578	TAT	2	6	832658	832663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081854
15511	NC_002578	TCT	2	6	832681	832686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15512	NC_002578	CTT	2	6	832724	832729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15513	NC_002578	TCC	2	6	832752	832757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15514	NC_002578	CTT	2	6	832763	832768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15515	NC_002578	CTC	2	6	832769	832774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15516	NC_002578	TCT	2	6	832792	832797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15517	NC_002578	ATC	2	6	832802	832807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081854
15518	NC_002578	CTG	2	6	832832	832837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15519	NC_002578	GCA	2	6	832842	832847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15520	NC_002578	TCGA	2	8	832953	832960	25 %	25 %	25 %	25 %	16081854
15521	NC_002578	TTC	2	6	833016	833021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15522	NC_002578	GATG	2	8	833027	833034	25 %	25 %	50 %	0 %	16081854
15523	NC_002578	CTT	2	6	833147	833152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15524	NC_002578	CTT	2	6	833174	833179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15525	NC_002578	ATC	2	6	833235	833240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081854
15526	NC_002578	TCC	2	6	833244	833249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15527	NC_002578	CTTT	2	8	833255	833262	0 %	75 %	0 %	25 %	16081854
15528	NC_002578	CTG	2	6	833283	833288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15529	NC_002578	GAA	2	6	833372	833377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081854
15530	NC_002578	CCT	2	6	833413	833418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15531	NC_002578	TCT	2	6	833440	833445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15532	NC_002578	ATC	2	6	833472	833477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081854
15533	NC_002578	T	7	7	833479	833485	0 %	100 %	0 %	0 %	16081854
15534	NC_002578	CTGT	2	8	833499	833506	0 %	50 %	25 %	25 %	16081854
15535	NC_002578	TTC	2	6	833537	833542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15536	NC_002578	CCT	2	6	833557	833562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15537	NC_002578	TC	3	6	833590	833595	0 %	50 %	0 %	50 %	16081854
15538	NC_002578	GATC	2	8	833658	833665	25 %	25 %	25 %	25 %	16081854
15539	NC_002578	GAG	2	6	833676	833681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081854
15540	NC_002578	TGC	2	6	833709	833714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15541	NC_002578	CCG	2	6	833757	833762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081854
15542	NC_002578	CCG	2	6	833772	833777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081854
15543	NC_002578	AT	3	6	833785	833790	50 %	50 %	0 %	0 %	16081854
15544	NC_002578	CCT	2	6	833828	833833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15545	NC_002578	ATA	2	6	833876	833881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081854
15546	NC_002578	CGA	2	6	833911	833916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15547	NC_002578	GAA	2	6	834004	834009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081854
15548	NC_002578	GCCT	2	8	834094	834101	0 %	25 %	25 %	50 %	16081854
15549	NC_002578	CTC	2	6	834185	834190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15550	NC_002578	GTA	2	6	834323	834328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081854
15551	NC_002578	CTG	2	6	834333	834338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15552	NC_002578	TCC	2	6	834405	834410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15553	NC_002578	TCCTC	2	10	834412	834421	0 %	40 %	0 %	60 %	16081854
15554	NC_002578	CTT	2	6	834431	834436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15555	NC_002578	GCA	2	6	834439	834444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15556	NC_002578	TCT	2	6	834517	834522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15557	NC_002578	CCG	2	6	834553	834558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081854
15558	NC_002578	CGGCCT	2	12	834565	834576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16081854
15559	NC_002578	CTG	2	6	834582	834587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15560	NC_002578	TCT	2	6	834604	834609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15561	NC_002578	TCC	2	6	834627	834632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15562	NC_002578	CTCTTC	2	12	834639	834650	0 %	50 %	0 %	50 %	16081854
15563	NC_002578	TCC	2	6	834732	834737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15564	NC_002578	GAT	2	6	834767	834772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081854
15565	NC_002578	CGC	2	6	834835	834840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081854
15566	NC_002578	GTC	2	6	834848	834853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15567	NC_002578	TCCTGA	2	12	834877	834888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081854
15568	NC_002578	TTC	2	6	834923	834928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15569	NC_002578	TTTC	2	8	834940	834947	0 %	75 %	0 %	25 %	16081854
15570	NC_002578	CAG	2	6	835046	835051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15571	NC_002578	CTT	2	6	835067	835072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15572	NC_002578	TAT	2	6	835118	835123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081854
15573	NC_002578	CTG	2	6	835146	835151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15574	NC_002578	TC	3	6	835214	835219	0 %	50 %	0 %	50 %	16081854
15575	NC_002578	TCA	2	6	835326	835331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081854
15576	NC_002578	CCT	2	6	835400	835405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081854
15577	NC_002578	CT	3	6	835404	835409	0 %	50 %	0 %	50 %	16081854
15578	NC_002578	CGT	2	6	835426	835431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15579	NC_002578	CTT	2	6	835622	835627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081854
15580	NC_002578	ACG	2	6	835672	835677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081854
15581	NC_002578	CCT	2	6	835688	835693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_002578	TA	3	6	835713	835718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_002578	GTTCA	2	10	835735	835744	20 %	40 %	20 %	20 %	16082554
15584	NC_002578	GAC	2	6	835745	835750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082554
15585	NC_002578	TCC	2	6	835773	835778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082554
15586	NC_002578	ATC	2	6	835788	835793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082554
15587	NC_002578	TCC	2	6	835806	835811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082554
15588	NC_002578	ATGATC	2	12	835812	835823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082554
15589	NC_002578	CGGCCT	2	12	835829	835840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16082554
15590	NC_002578	CTCA	2	8	835907	835914	25 %	25 %	0 %	50 %	16082554
15591	NC_002578	CGGTGA	2	12	835963	835974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082554
15592	NC_002578	TCT	2	6	835975	835980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082554
15593	NC_002578	CT	3	6	835992	835997	0 %	50 %	0 %	50 %	16082554
15594	NC_002578	GGCC	2	8	836033	836040	0 %	0 %	50 %	50 %	16082554
15595	NC_002578	CGA	2	6	836104	836109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082554
15596	NC_002578	TCCC	2	8	836292	836299	0 %	25 %	0 %	75 %	16082554
15597	NC_002578	GAA	2	6	836318	836323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082554
15598	NC_002578	TGT	2	6	836359	836364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082554
15599	NC_002578	CGATC	2	10	836366	836375	20 %	20 %	20 %	40 %	16082554
15600	NC_002578	TCC	2	6	836406	836411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082554
15601	NC_002578	GGC	2	6	836435	836440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082554
15602	NC_002578	GGT	3	9	836477	836485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082554
15603	NC_002578	TG	3	6	836565	836570	0 %	50 %	50 %	0 %	16082554
15604	NC_002578	GAGTA	2	10	836643	836652	40 %	20 %	40 %	0 %	16082554
15605	NC_002578	TCC	2	6	836655	836660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082554
15606	NC_002578	CAT	2	6	836684	836689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082554
15607	NC_002578	GAT	2	6	836852	836857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082554
15608	NC_002578	CTT	2	6	836873	836878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082554
15609	NC_002578	CATCT	2	10	836882	836891	20 %	40 %	0 %	40 %	16082554
15610	NC_002578	TCA	3	9	836922	836930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082554
15611	NC_002578	CCT	2	6	836960	836965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15612	NC_002578	GAT	2	6	836977	836982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_002578	TTAT	2	8	836985	836992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_002578	A	6	6	837027	837032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_002578	GCA	2	6	837063	837068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_002578	ATCC	2	8	837093	837100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15617	NC_002578	TA	4	8	837146	837153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_002578	GAT	2	6	837169	837174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081855
15619	NC_002578	GAG	2	6	837208	837213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081855
15620	NC_002578	CTT	2	6	837235	837240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081855
15621	NC_002578	CGC	2	6	837280	837285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081855
15622	NC_002578	CTT	3	9	837346	837354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081855
15623	NC_002578	CGGTG	2	10	837478	837487	0 %	20 %	60 %	20 %	16081855
15624	NC_002578	CACCGT	2	12	837490	837501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081855
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15726	NC_002578	AT	3	6	843828	843833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15734	NC_002578	CAT	2	6	844331	844336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081857
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15985	NC_002578	GAT	2	6	857232	857237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082558
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15989	NC_002578	TGAC	2	8	857487	857494	25 %	25 %	25 %	25 %	16081864
15990	NC_002578	TCG	2	6	857505	857510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081864
15991	NC_002578	CGG	2	6	857515	857520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081864
15992	NC_002578	CCATA	2	10	857530	857539	40 %	20 %	0 %	40 %	16081864
15993	NC_002578	TCT	2	6	857715	857720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081864
15994	NC_002578	GCGA	2	8	857908	857915	25 %	0 %	50 %	25 %	16081864
15995	NC_002578	ATC	2	6	858158	858163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081864
15996	NC_002578	AGGA	2	8	858186	858193	50 %	0 %	50 %	0 %	16081864
15997	NC_002578	G	6	6	858224	858229	0 %	0 %	100 %	0 %	16081864
15998	NC_002578	GCG	2	6	858274	858279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082559
15999	NC_002578	CAT	2	6	858326	858331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082559
16000	NC_002578	CAT	2	6	858440	858445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082559

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