MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_002578	CTTTC	2	10	804002	804011	0 %	60 %	0 %	40 %	16081832
15002	NC_002578	GCA	2	6	804077	804082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081832
15003	NC_002578	CGG	2	6	804161	804166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081833
15004	NC_002578	GACATC	2	12	804219	804230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081833
15005	NC_002578	GAT	2	6	804339	804344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081833
15006	NC_002578	CAT	2	6	804347	804352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081833
15007	NC_002578	CCAGG	2	10	804368	804377	20 %	0 %	40 %	40 %	16081833
15008	NC_002578	ATA	2	6	804438	804443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081833
15009	NC_002578	ATG	2	6	804468	804473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081833
15010	NC_002578	CGA	2	6	804518	804523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081833
15011	NC_002578	ATTA	2	8	804558	804565	50 %	50 %	0 %	0 %	16081833
15012	NC_002578	GAC	2	6	804681	804686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081833
15013	NC_002578	GCT	2	6	804707	804712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081833
15014	NC_002578	ATA	2	6	804779	804784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081834
15015	NC_002578	GCA	2	6	804934	804939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081834
15016	NC_002578	AACG	2	8	805015	805022	50 %	0 %	25 %	25 %	16081834
15017	NC_002578	GAA	2	6	805080	805085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081834
15018	NC_002578	AT	3	6	805262	805267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_002578	TAT	2	6	805356	805361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082552
15020	NC_002578	TGT	2	6	805430	805435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082552
15021	NC_002578	AGA	2	6	805525	805530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082552
15022	NC_002578	CTTC	2	8	805605	805612	0 %	50 %	0 %	50 %	16082552
15023	NC_002578	GCC	2	6	805719	805724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082552
15024	NC_002578	CTC	2	6	805752	805757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082552
15025	NC_002578	GGC	2	6	805782	805787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082552
15026	NC_002578	CAC	2	6	805788	805793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082552
15027	NC_002578	TTC	2	6	805807	805812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082552
15028	NC_002578	GT	3	6	805851	805856	0 %	50 %	50 %	0 %	16082552
15029	NC_002578	TTC	2	6	805881	805886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082552
15030	NC_002578	CCA	2	6	805928	805933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082552
15031	NC_002578	GCAT	2	8	805962	805969	25 %	25 %	25 %	25 %	16082552
15032	NC_002578	GAA	2	6	806040	806045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_002578	TGC	2	6	806048	806053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_002578	GAA	2	6	806131	806136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_002578	TACA	2	8	806207	806214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15036	NC_002578	ATG	2	6	806259	806264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_002578	CGT	2	6	806306	806311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081835
15038	NC_002578	GAT	2	6	806313	806318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081835
15039	NC_002578	TTCG	2	8	806321	806328	0 %	50 %	25 %	25 %	16081835
15040	NC_002578	AAG	2	6	806379	806384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081835
15041	NC_002578	AAG	2	6	806460	806465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081835
15042	NC_002578	GAA	2	6	806534	806539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081835
15043	NC_002578	GGA	2	6	806586	806591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081835
15044	NC_002578	ATA	2	6	806646	806651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081835
15045	NC_002578	CGGA	2	8	806695	806702	25 %	0 %	50 %	25 %	16081835
15046	NC_002578	GAG	2	6	806736	806741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081835
15047	NC_002578	ATG	2	6	806758	806763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081835
15048	NC_002578	GC	3	6	806771	806776	0 %	0 %	50 %	50 %	16081835
15049	NC_002578	CAACC	2	10	806798	806807	40 %	0 %	0 %	60 %	16081835
15050	NC_002578	ATA	2	6	806841	806846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081835
15051	NC_002578	TGA	2	6	806882	806887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081835
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15053	NC_002578	GAA	2	6	807047	807052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081835
15054	NC_002578	GCT	2	6	807053	807058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081835
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15056	NC_002578	ATA	2	6	807174	807179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081835
15057	NC_002578	CCGG	2	8	807351	807358	0 %	0 %	50 %	50 %	16081835
15058	NC_002578	GCA	2	6	807387	807392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081835
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15062	NC_002578	GAA	2	6	807539	807544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_002578	GGA	2	6	807679	807684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_002578	TCCG	2	8	807704	807711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15065	NC_002578	AG	3	6	807713	807718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15071	NC_002578	AT	3	6	808123	808128	50 %	50 %	0 %	0 %	16081836
15072	NC_002578	A	6	6	808139	808144	100 %	0 %	0 %	0 %	16081836
15073	NC_002578	ATG	2	6	808219	808224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15079	NC_002578	ATT	2	6	808594	808599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15081	NC_002578	AT	3	6	808717	808722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_002578	AAGA	2	8	808754	808761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_002578	AAT	2	6	808768	808773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_002578	AACG	2	8	808778	808785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15087	NC_002578	T	8	8	809007	809014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_002578	TATT	2	8	809028	809035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_002578	ATTTT	2	10	809048	809057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15092	NC_002578	AT	4	8	809230	809237	50 %	50 %	0 %	0 %	16081837
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15095	NC_002578	CG	3	6	809392	809397	0 %	0 %	50 %	50 %	16081837
15096	NC_002578	TGA	2	6	809470	809475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081837
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15101	NC_002578	TGC	2	6	809833	809838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081838
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15103	NC_002578	AT	3	6	809964	809969	50 %	50 %	0 %	0 %	16081838
15104	NC_002578	ATA	2	6	809973	809978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081838
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15109	NC_002578	CCGT	2	8	810120	810127	0 %	25 %	25 %	50 %	16081838
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15111	NC_002578	TCA	2	6	810136	810141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081838
15112	NC_002578	AG	3	6	810148	810153	50 %	0 %	50 %	0 %	16081838
15113	NC_002578	TAC	2	6	810192	810197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081838
15114	NC_002578	TTG	2	6	810331	810336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081838
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15120	NC_002578	ACA	2	6	810715	810720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081838
15121	NC_002578	CT	3	6	810758	810763	0 %	50 %	0 %	50 %	16081838
15122	NC_002578	GGT	2	6	810840	810845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081838
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15125	NC_002578	AT	3	6	811012	811017	50 %	50 %	0 %	0 %	16081838
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15249	NC_002578	A	6	6	817691	817696	100 %	0 %	0 %	0 %	16081842
15250	NC_002578	T	7	7	817705	817711	0 %	100 %	0 %	0 %	16081843
15251	NC_002578	TCT	2	6	817835	817840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081843
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15253	NC_002578	GTT	2	6	817887	817892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081843
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15261	NC_002578	GTAT	2	8	818573	818580	25 %	50 %	25 %	0 %	16081843
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15263	NC_002578	CCG	2	6	818650	818655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081843
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15271	NC_002578	TAA	2	6	818986	818991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_002578	TAA	2	6	819007	819012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15273	NC_002578	AT	5	10	819049	819058	50 %	50 %	0 %	0 %	16081844
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15357	NC_002578	GCA	2	6	824136	824141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081847
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15368	NC_002578	GTC	2	6	824866	824871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081847
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15495	NC_002578	TCC	2	6	831721	831726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081853
15496	NC_002578	TCT	2	6	831792	831797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081853
15497	NC_002578	TGT	2	6	831803	831808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081853
15498	NC_002578	CCT	2	6	831846	831851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081853
15499	NC_002578	TTC	2	6	831918	831923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081853
15500	NC_002578	TGC	2	6	832031	832036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081853

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