MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002578	ATC	2	6	699213	699218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081749
13002	NC_002578	GCAT	2	8	699233	699240	25 %	25 %	25 %	25 %	16081749
13003	NC_002578	GAT	2	6	699306	699311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081750
13004	NC_002578	AAT	2	6	699369	699374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081750
13005	NC_002578	ATA	2	6	699527	699532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081750
13006	NC_002578	CAG	2	6	699572	699577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081750
13007	NC_002578	ATT	2	6	699594	699599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081750
13008	NC_002578	AAC	2	6	699614	699619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081750
13009	NC_002578	CTG	2	6	699631	699636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081750
13010	NC_002578	TTAA	2	8	699671	699678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_002578	TGT	2	6	699685	699690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_002578	TGATC	2	10	699723	699732	20 %	40 %	20 %	20 %	16081751
13013	NC_002578	TCCT	2	8	699887	699894	0 %	50 %	0 %	50 %	16081751
13014	NC_002578	ATC	2	6	699952	699957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081751
13015	NC_002578	TCC	2	6	699998	700003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081751
13016	NC_002578	CAT	2	6	700050	700055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081751
13017	NC_002578	CACT	2	8	700106	700113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13018	NC_002578	CCA	2	6	700246	700251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081752
13019	NC_002578	TTG	2	6	700268	700273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081752
13020	NC_002578	TGA	2	6	700296	700301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081752
13021	NC_002578	CTT	2	6	700325	700330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081752
13022	NC_002578	GAAT	2	8	700443	700450	50 %	25 %	25 %	0 %	16081752
13023	NC_002578	CCG	2	6	700454	700459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081752
13024	NC_002578	CTTATC	2	12	700487	700498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16081752
13025	NC_002578	TCC	2	6	700562	700567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081752
13026	NC_002578	GTT	2	6	700618	700623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081752
13027	NC_002578	TTTC	2	8	700685	700692	0 %	75 %	0 %	25 %	16081752
13028	NC_002578	CTG	2	6	700728	700733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081752
13029	NC_002578	TGA	2	6	700775	700780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081752
13030	NC_002578	AG	3	6	700847	700852	50 %	0 %	50 %	0 %	16081752
13031	NC_002578	TCG	2	6	700884	700889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081752
13032	NC_002578	TCC	2	6	700957	700962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081752
13033	NC_002578	GAA	2	6	701054	701059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081752
13034	NC_002578	CAGA	2	8	701085	701092	50 %	0 %	25 %	25 %	16081752
13035	NC_002578	GTG	2	6	701162	701167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081752
13036	NC_002578	TCA	2	6	701249	701254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081752
13037	NC_002578	AGA	2	6	701345	701350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081752
13038	NC_002578	GCT	2	6	701353	701358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081752
13039	NC_002578	CTTC	2	8	701364	701371	0 %	50 %	0 %	50 %	16081752
13040	NC_002578	GGA	2	6	701374	701379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081752
13041	NC_002578	AGC	2	6	701450	701455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081752
13042	NC_002578	GCTATG	2	12	701531	701542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081752
13043	NC_002578	GGT	2	6	701605	701610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081752
13044	NC_002578	TGT	2	6	701652	701657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081752
13045	NC_002578	TG	3	6	701665	701670	0 %	50 %	50 %	0 %	16081752
13046	NC_002578	AT	3	6	701698	701703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_002578	ATA	2	6	701722	701727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_002578	ATAA	2	8	701762	701769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_002578	TGCA	2	8	701810	701817	25 %	25 %	25 %	25 %	16081753
13050	NC_002578	AT	3	6	701874	701879	50 %	50 %	0 %	0 %	16081753
13051	NC_002578	GAT	2	6	701894	701899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081753
13052	NC_002578	TCAA	2	8	701936	701943	50 %	25 %	0 %	25 %	16081753
13053	NC_002578	AGAAC	2	10	701950	701959	60 %	0 %	20 %	20 %	16081753
13054	NC_002578	AAG	2	6	701963	701968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081753
13055	NC_002578	ACC	2	6	702003	702008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081753
13056	NC_002578	ATC	2	6	702060	702065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081753
13057	NC_002578	GAG	2	6	702167	702172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081753
13058	NC_002578	ATA	2	6	702173	702178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081753
13059	NC_002578	GAT	2	6	702503	702508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081753
13060	NC_002578	CAT	2	6	702541	702546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081753
13061	NC_002578	GAG	2	6	702713	702718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081753
13062	NC_002578	AAT	2	6	702724	702729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081753
13063	NC_002578	CATA	2	8	702738	702745	50 %	25 %	0 %	25 %	16081753
13064	NC_002578	AAT	2	6	702747	702752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081753
13065	NC_002578	ACA	2	6	702843	702848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081754
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13070	NC_002578	GGA	2	6	703048	703053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081754
13071	NC_002578	GGA	2	6	703061	703066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081754
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13073	NC_002578	GAGG	2	8	703153	703160	25 %	0 %	75 %	0 %	16081754
13074	NC_002578	CCTCG	2	10	703219	703228	0 %	20 %	20 %	60 %	16081754
13075	NC_002578	ATG	2	6	703301	703306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081754
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13089	NC_002578	CAA	2	6	704085	704090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_002578	AT	3	6	704094	704099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_002578	TTA	2	6	704239	704244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_002578	GCAGAG	2	12	704245	704256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13093	NC_002578	TGA	2	6	704394	704399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13095	NC_002578	GAG	2	6	704614	704619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081755
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13098	NC_002578	AC	3	6	704698	704703	50 %	0 %	0 %	50 %	16081755
13099	NC_002578	GTT	2	6	704752	704757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081755
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13101	NC_002578	CTG	2	6	704778	704783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081755
13102	NC_002578	CTT	2	6	704790	704795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081755
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13105	NC_002578	CGG	2	6	704907	704912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081755
13106	NC_002578	AG	3	6	705040	705045	50 %	0 %	50 %	0 %	16081755
13107	NC_002578	GAA	2	6	705102	705107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081755
13108	NC_002578	CTG	2	6	705122	705127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081755
13109	NC_002578	AAG	2	6	705142	705147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081755
13110	NC_002578	GTC	2	6	705160	705165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081755
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13112	NC_002578	AGA	2	6	705341	705346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081755
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13120	NC_002578	AAG	2	6	706009	706014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081755
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13361	NC_002578	TA	3	6	719599	719604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_002578	AT	3	6	719606	719611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_002578	AATA	2	8	719623	719630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13490	NC_002578	CAT	2	6	727641	727646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081773
13491	NC_002578	AGC	2	6	727676	727681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081773
13492	NC_002578	GAA	2	6	727717	727722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081773
13493	NC_002578	TTC	2	6	727751	727756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081773
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13499	NC_002578	AT	3	6	727925	727930	50 %	50 %	0 %	0 %	16081774
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