MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_002578	TCTG	2	8	645483	645490	0 %	50 %	25 %	25 %	16082538
12003	NC_002578	ACA	2	6	645533	645538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082538
12004	NC_002578	GGAG	2	8	645580	645587	25 %	0 %	75 %	0 %	16082538
12005	NC_002578	GAG	2	6	645610	645615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082538
12006	NC_002578	TAA	2	6	645638	645643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082538
12007	NC_002578	AGG	2	6	645704	645709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082538
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12009	NC_002578	GCA	2	6	645805	645810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082538
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12011	NC_002578	AAG	2	6	645889	645894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082538
12012	NC_002578	GGA	2	6	645914	645919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082538
12013	NC_002578	ATG	2	6	645966	645971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082538
12014	NC_002578	CGG	2	6	645974	645979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082538
12015	NC_002578	CCG	2	6	646009	646014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082538
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12018	NC_002578	GATG	2	8	646139	646146	25 %	25 %	50 %	0 %	16082538
12019	NC_002578	AGA	2	6	646228	646233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082538
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12054	NC_002578	TAT	2	6	648129	648134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12115	NC_002578	TA	3	6	651774	651779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12124	NC_002578	ATC	2	6	652279	652284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081714
12125	NC_002578	AAT	2	6	652297	652302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081714
12126	NC_002578	TTC	2	6	652349	652354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081714
12127	NC_002578	TCC	2	6	652389	652394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081714
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12137	NC_002578	TCA	2	6	652814	652819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081714
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12148	NC_002578	T	6	6	653436	653441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12149	NC_002578	ATTTG	2	10	653480	653489	20 %	60 %	20 %	0 %	16081715
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12154	NC_002578	ATTT	2	8	653594	653601	25 %	75 %	0 %	0 %	16081715
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12231	NC_002578	TCAA	2	8	657844	657851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12232	NC_002578	TAA	2	6	657852	657857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12235	NC_002578	AAT	2	6	657955	657960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12243	NC_002578	GTT	2	6	658203	658208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082540
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12246	NC_002578	GAG	2	6	658545	658550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082540
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12250	NC_002578	ACG	2	6	658892	658897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082541
12251	NC_002578	CGC	2	6	658955	658960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082541
12252	NC_002578	GAC	2	6	658962	658967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082541
12253	NC_002578	TTG	2	6	658970	658975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082541
12254	NC_002578	TGC	2	6	659052	659057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082541
12255	NC_002578	CGA	2	6	659099	659104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082541
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12260	NC_002578	ATACG	2	10	659493	659502	40 %	20 %	20 %	20 %	16082541
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12279	NC_002578	TAC	2	6	660673	660678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081720
12280	NC_002578	TGAA	2	8	660833	660840	50 %	25 %	25 %	0 %	16081720
12281	NC_002578	GGA	2	6	660870	660875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081720
12282	NC_002578	T	6	6	660934	660939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12283	NC_002578	ATT	2	6	660943	660948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12284	NC_002578	T	7	7	660947	660953	0 %	100 %	0 %	0 %	16082542
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12298	NC_002578	CTTCG	2	10	661565	661574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12299	NC_002578	ATC	2	6	661575	661580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12301	NC_002578	ATC	2	6	661633	661638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12304	NC_002578	CTC	2	6	661682	661687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082543
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12306	NC_002578	GGA	2	6	661850	661855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082543
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12316	NC_002578	AGA	2	6	662342	662347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082543
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12363	NC_002578	CTG	2	6	664549	664554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081723
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12365	NC_002578	TCG	2	6	664614	664619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081723
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12368	NC_002578	TGA	2	6	664699	664704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081723
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