MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_002578	AGA	2	6	620655	620660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
11502	NC_002578	TGC	2	6	620682	620687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081689
11503	NC_002578	GGA	2	6	620748	620753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081689
11504	NC_002578	CAG	2	6	620826	620831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081689
11505	NC_002578	GAT	2	6	620928	620933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081689
11506	NC_002578	TAT	2	6	620959	620964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081689
11507	NC_002578	GCG	2	6	620983	620988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081689
11508	NC_002578	GAA	2	6	621024	621029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081689
11509	NC_002578	TCC	2	6	621046	621051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081689
11510	NC_002578	ATC	2	6	621096	621101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081689
11511	NC_002578	ATCAA	2	10	621193	621202	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11512	NC_002578	GAT	2	6	621269	621274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_002578	ATG	2	6	621275	621280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_002578	GTT	2	6	621299	621304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_002578	ATA	2	6	621389	621394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_002578	AAAT	2	8	621424	621431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_002578	TA	3	6	621433	621438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_002578	TAA	2	6	621451	621456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_002578	CAT	2	6	621549	621554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
11520	NC_002578	ATC	2	6	621574	621579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
11521	NC_002578	TACG	2	8	621600	621607	25 %	25 %	25 %	25 %	16081690
11522	NC_002578	GA	3	6	621631	621636	50 %	0 %	50 %	0 %	16081690
11523	NC_002578	AAG	2	6	621637	621642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081690
11524	NC_002578	ATC	2	6	621652	621657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081690
11525	NC_002578	A	6	6	621738	621743	100 %	0 %	0 %	0 %	16081690
11526	NC_002578	GAG	2	6	621760	621765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081690
11527	NC_002578	ATA	2	6	621781	621786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081690
11528	NC_002578	ATA	2	6	621820	621825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081690
11529	NC_002578	TCAG	2	8	621832	621839	25 %	25 %	25 %	25 %	16081690
11530	NC_002578	TA	3	6	621910	621915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_002578	CTG	2	6	621968	621973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081691
11532	NC_002578	GAA	2	6	622018	622023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
11533	NC_002578	AAG	3	9	622027	622035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
11534	NC_002578	GAT	2	6	622044	622049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081691
11535	NC_002578	AATA	2	8	622071	622078	75 %	25 %	0 %	0 %	16081691
11536	NC_002578	TA	3	6	622090	622095	50 %	50 %	0 %	0 %	16081691
11537	NC_002578	AAG	3	9	622111	622119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081691
11538	NC_002578	AG	3	6	622130	622135	50 %	0 %	50 %	0 %	16081691
11539	NC_002578	TC	3	6	622150	622155	0 %	50 %	0 %	50 %	16081691
11540	NC_002578	GAA	2	6	622272	622277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081692
11541	NC_002578	ATTC	2	8	622346	622353	25 %	50 %	0 %	25 %	16081692
11542	NC_002578	TAA	2	6	622409	622414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081692
11543	NC_002578	GAA	2	6	622439	622444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081692
11544	NC_002578	ATAG	2	8	622582	622589	50 %	25 %	25 %	0 %	16081692
11545	NC_002578	TTC	2	6	622652	622657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_002578	TATGC	2	10	622671	622680	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11547	NC_002578	GCG	2	6	622765	622770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082648
11548	NC_002578	TATG	2	8	622812	622819	25 %	50 %	25 %	0 %	16082648
11549	NC_002578	ACA	2	6	622894	622899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082648
11550	NC_002578	ACT	2	6	622933	622938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_002578	CCA	2	6	622994	622999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081693
11552	NC_002578	AAT	2	6	623004	623009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081693
11553	NC_002578	TCC	2	6	623035	623040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
11554	NC_002578	GTC	2	6	623086	623091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081693
11555	NC_002578	GAA	3	9	623110	623118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
11556	NC_002578	TTA	2	6	623178	623183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081693
11557	NC_002578	TTC	2	6	623252	623257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
11558	NC_002578	CCT	2	6	623355	623360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
11559	NC_002578	GATCA	2	10	623371	623380	40 %	20 %	20 %	20 %	16081693
11560	NC_002578	TAT	2	6	623386	623391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081693
11561	NC_002578	ATCAA	2	10	623432	623441	60 %	20 %	0 %	20 %	16081693
11562	NC_002578	CAG	2	6	623518	623523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
11563	NC_002578	TG	3	6	623620	623625	0 %	50 %	50 %	0 %	16081693
11564	NC_002578	AGAT	2	8	623639	623646	50 %	25 %	25 %	0 %	16081693
11565	NC_002578	TCC	2	6	623693	623698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081693
11566	NC_002578	GAA	2	6	623716	623721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
11567	NC_002578	GCA	2	6	623726	623731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
11568	NC_002578	GAG	2	6	623732	623737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081693
11569	NC_002578	AAG	2	6	623777	623782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081693
11570	NC_002578	CAG	2	6	623967	623972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
11571	NC_002578	TCCT	2	8	624005	624012	0 %	50 %	0 %	50 %	16081693
11572	NC_002578	TTCAA	2	10	624026	624035	40 %	40 %	0 %	20 %	16081693
11573	NC_002578	TTG	2	6	624054	624059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081693
11574	NC_002578	T	7	7	624076	624082	0 %	100 %	0 %	0 %	16081693
11575	NC_002578	CGG	2	6	624111	624116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081693
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11577	NC_002578	AT	3	6	624195	624200	50 %	50 %	0 %	0 %	16081693
11578	NC_002578	TTCT	2	8	624221	624228	0 %	75 %	0 %	25 %	16081693
11579	NC_002578	ATTG	2	8	624335	624342	25 %	50 %	25 %	0 %	16081693
11580	NC_002578	CTT	2	6	624359	624364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
11581	NC_002578	CTT	2	6	624432	624437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081693
11582	NC_002578	GCA	2	6	624440	624445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081693
11583	NC_002578	GAATA	2	10	624450	624459	60 %	20 %	20 %	0 %	16081693
11584	NC_002578	GAG	2	6	624484	624489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081693
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11587	NC_002578	ATA	2	6	624779	624784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_002578	TTC	2	6	624920	624925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081694
11589	NC_002578	ATC	2	6	624943	624948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
11590	NC_002578	CCG	2	6	624973	624978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081694
11591	NC_002578	AAGG	2	8	625045	625052	50 %	0 %	50 %	0 %	16081694
11592	NC_002578	A	6	6	625071	625076	100 %	0 %	0 %	0 %	16081694
11593	NC_002578	CAT	2	6	625128	625133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
11594	NC_002578	GAA	2	6	625145	625150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081694
11595	NC_002578	ATC	2	6	625240	625245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081694
11596	NC_002578	AGA	2	6	625246	625251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081694
11597	NC_002578	GATA	2	8	625319	625326	50 %	25 %	25 %	0 %	16081694
11598	NC_002578	CGAT	2	8	625337	625344	25 %	25 %	25 %	25 %	16081694
11599	NC_002578	CCA	2	6	625411	625416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081694
11600	NC_002578	GAG	2	6	625506	625511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081694
11601	NC_002578	GAG	2	6	625515	625520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081694
11602	NC_002578	TAT	2	6	625596	625601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081694
11603	NC_002578	GATC	2	8	625623	625630	25 %	25 %	25 %	25 %	16081694
11604	NC_002578	AAT	2	6	625640	625645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081694
11605	NC_002578	GTA	2	6	625698	625703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081694
11606	NC_002578	ATG	2	6	625806	625811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_002578	AAG	2	6	625829	625834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_002578	TCG	2	6	625914	625919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_002578	ATG	2	6	625962	625967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_002578	TATC	2	8	625993	626000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11611	NC_002578	CGG	2	6	626011	626016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_002578	CAGA	2	8	626035	626042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11613	NC_002578	AAAT	2	8	626056	626063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_002578	AAT	2	6	626076	626081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_002578	AT	3	6	626088	626093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_002578	AATG	2	8	626106	626113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_002578	ATT	2	6	626130	626135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_002578	TGAA	2	8	626210	626217	50 %	25 %	25 %	0 %	16082534
11619	NC_002578	TAT	2	6	626320	626325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082534
11620	NC_002578	TA	3	6	626470	626475	50 %	50 %	0 %	0 %	16082534
11621	NC_002578	TC	3	6	626494	626499	0 %	50 %	0 %	50 %	16082534
11622	NC_002578	CAT	2	6	626526	626531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082534
11623	NC_002578	AT	3	6	626530	626535	50 %	50 %	0 %	0 %	16082534
11624	NC_002578	CAA	2	6	626550	626555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082534
11625	NC_002578	GAG	2	6	626566	626571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082534
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11998	NC_002578	ATG	2	6	645061	645066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082538
11999	NC_002578	ATG	2	6	645215	645220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082538
12000	NC_002578	CCT	2	6	645238	645243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082538

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