MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002578	CCA	2	6	540890	540895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081624
10002	NC_002578	AGG	2	6	540986	540991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081624
10003	NC_002578	AGGA	2	8	541013	541020	50 %	0 %	50 %	0 %	16081624
10004	NC_002578	CCT	2	6	541041	541046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081624
10005	NC_002578	TCT	2	6	541060	541065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081624
10006	NC_002578	GCA	2	6	541082	541087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081624
10007	NC_002578	CGA	2	6	541202	541207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081624
10008	NC_002578	CT	3	6	541385	541390	0 %	50 %	0 %	50 %	16081624
10009	NC_002578	TTC	2	6	541391	541396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081624
10010	NC_002578	CAT	2	6	541419	541424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081624
10011	NC_002578	AAG	2	6	541476	541481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081624
10012	NC_002578	GGC	2	6	541536	541541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081624
10013	NC_002578	TAT	2	6	541560	541565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081624
10014	NC_002578	ATT	2	6	541614	541619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081624
10015	NC_002578	GAT	2	6	541623	541628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081624
10016	NC_002578	AT	3	6	541659	541664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_002578	TAA	2	6	541817	541822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_002578	T	6	6	541829	541834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_002578	A	6	6	541860	541865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_002578	A	7	7	541900	541906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_002578	AAAG	2	8	541963	541970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_002578	CAT	2	6	542002	542007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_002578	GAC	2	6	542021	542026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_002578	A	6	6	542043	542048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_002578	GA	3	6	542071	542076	50 %	0 %	50 %	0 %	16081625
10026	NC_002578	CCA	2	6	542108	542113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081625
10027	NC_002578	TC	3	6	542162	542167	0 %	50 %	0 %	50 %	16081625
10028	NC_002578	TTA	2	6	542210	542215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081625
10029	NC_002578	TAA	2	6	542251	542256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081625
10030	NC_002578	TAT	3	9	542259	542267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081625
10031	NC_002578	CTG	2	6	542304	542309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081625
10032	NC_002578	CAG	2	6	542442	542447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081625
10033	NC_002578	CTT	2	6	542469	542474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081625
10034	NC_002578	CCG	2	6	542533	542538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081625
10035	NC_002578	CTC	2	6	542674	542679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081625
10036	NC_002578	TCC	2	6	542699	542704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081625
10037	NC_002578	CA	3	6	542737	542742	50 %	0 %	0 %	50 %	16081625
10038	NC_002578	C	6	6	542794	542799	0 %	0 %	0 %	100 %	16081625
10039	NC_002578	GAGATC	2	12	542808	542819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081625
10040	NC_002578	TC	3	6	542991	542996	0 %	50 %	0 %	50 %	16081625
10041	NC_002578	TCT	2	6	543038	543043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081625
10042	NC_002578	TAA	2	6	543081	543086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_002578	TGC	2	6	543120	543125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_002578	ATA	2	6	543191	543196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_002578	ATG	2	6	543222	543227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082527
10046	NC_002578	GAA	2	6	543248	543253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082527
10047	NC_002578	GAATA	2	10	543287	543296	60 %	20 %	20 %	0 %	16082527
10048	NC_002578	TTC	2	6	543321	543326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082527
10049	NC_002578	AGA	2	6	543356	543361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082527
10050	NC_002578	AGGC	2	8	543487	543494	25 %	0 %	50 %	25 %	16081626
10051	NC_002578	AGG	3	9	543642	543650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081626
10052	NC_002578	GAA	3	9	543667	543675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081626
10053	NC_002578	AAT	2	6	543679	543684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081626
10054	NC_002578	CGG	2	6	543703	543708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081626
10055	NC_002578	ACATC	2	10	543774	543783	40 %	20 %	0 %	40 %	16081626
10056	NC_002578	ATGA	2	8	543797	543804	50 %	25 %	25 %	0 %	16081626
10057	NC_002578	TC	3	6	543818	543823	0 %	50 %	0 %	50 %	16081626
10058	NC_002578	GCA	2	6	543926	543931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081626
10059	NC_002578	AC	3	6	543979	543984	50 %	0 %	0 %	50 %	16081626
10060	NC_002578	TGA	2	6	544102	544107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081626
10061	NC_002578	TCA	2	6	544122	544127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081626
10062	NC_002578	GGA	2	6	544162	544167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081626
10063	NC_002578	GAA	2	6	544184	544189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081626
10064	NC_002578	GAG	2	6	544229	544234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081626
10065	NC_002578	CCT	2	6	544246	544251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081626
10066	NC_002578	T	6	6	544276	544281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_002578	CAT	2	6	544361	544366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_002578	CTG	2	6	544527	544532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081627
10069	NC_002578	ACGTCA	2	12	544540	544551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081627
10070	NC_002578	TTC	2	6	544558	544563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081627
10071	NC_002578	GC	3	6	544586	544591	0 %	0 %	50 %	50 %	16081627
10072	NC_002578	GAA	2	6	544596	544601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081627
10073	NC_002578	GAA	2	6	544653	544658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081627
10074	NC_002578	TCAAGC	2	12	544690	544701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081627
10075	NC_002578	AAT	2	6	544709	544714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081627
10076	NC_002578	TTC	2	6	544770	544775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081627
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10078	NC_002578	ATC	2	6	544956	544961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081627
10079	NC_002578	AGG	2	6	545010	545015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081627
10080	NC_002578	ATC	2	6	545052	545057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081627
10081	NC_002578	GCA	2	6	545072	545077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081627
10082	NC_002578	GGCCG	2	10	545078	545087	0 %	0 %	60 %	40 %	16081627
10083	NC_002578	GATG	2	8	545141	545148	25 %	25 %	50 %	0 %	16081627
10084	NC_002578	GCG	2	6	545161	545166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081627
10085	NC_002578	GAT	2	6	545232	545237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081627
10086	NC_002578	AGG	2	6	545317	545322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081627
10087	NC_002578	GGA	3	9	545333	545341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081627
10088	NC_002578	TGA	2	6	545365	545370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081627
10089	NC_002578	TGA	2	6	545431	545436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081627
10090	NC_002578	AGA	2	6	545482	545487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081627
10091	NC_002578	ATC	2	6	545538	545543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081627
10092	NC_002578	ATA	2	6	545583	545588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081627
10093	NC_002578	GAA	2	6	545634	545639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081627
10094	NC_002578	GAA	2	6	545675	545680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081627
10095	NC_002578	GAT	2	6	545690	545695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081627
10096	NC_002578	TGC	2	6	545722	545727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081627
10097	NC_002578	GGA	2	6	545759	545764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081627
10098	NC_002578	ATT	2	6	545830	545835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_002578	CTG	2	6	545844	545849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_002578	TTC	2	6	545852	545857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_002578	A	6	6	545860	545865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_002578	AATG	2	8	545872	545879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_002578	GAC	2	6	545912	545917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082528
10104	NC_002578	CGA	2	6	545995	546000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082528
10105	NC_002578	ATC	2	6	546014	546019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082528
10106	NC_002578	TC	3	6	546068	546073	0 %	50 %	0 %	50 %	16082528
10107	NC_002578	CAT	2	6	546107	546112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082528
10108	NC_002578	GCG	2	6	546115	546120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082528
10109	NC_002578	CCA	2	6	546195	546200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082528
10110	NC_002578	CGC	2	6	546289	546294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082528
10111	NC_002578	CTT	2	6	546320	546325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082528
10112	NC_002578	TTC	2	6	546363	546368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082528
10113	NC_002578	TGT	2	6	546379	546384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082528
10114	NC_002578	GGA	2	6	546398	546403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082528
10115	NC_002578	AT	3	6	546448	546453	50 %	50 %	0 %	0 %	16082528
10116	NC_002578	CCGG	2	8	546456	546463	0 %	0 %	50 %	50 %	16082528
10117	NC_002578	ATC	2	6	546516	546521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082528
10118	NC_002578	GGCC	2	8	546574	546581	0 %	0 %	50 %	50 %	16082528
10119	NC_002578	CA	3	6	546723	546728	50 %	0 %	0 %	50 %	16082528
10120	NC_002578	GCA	2	6	546744	546749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082528
10121	NC_002578	GCA	2	6	546753	546758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082528
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10123	NC_002578	TCTCT	2	10	546974	546983	0 %	60 %	0 %	40 %	16082528
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10248	NC_002578	CAGG	2	8	553042	553049	25 %	0 %	50 %	25 %	16081633
10249	NC_002578	AAG	2	6	553160	553165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081633
10250	NC_002578	AG	3	6	553171	553176	50 %	0 %	50 %	0 %	16081633
10251	NC_002578	ATC	2	6	553230	553235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10253	NC_002578	GATG	2	8	553469	553476	25 %	25 %	50 %	0 %	16081634
10254	NC_002578	GCGGT	2	10	553541	553550	0 %	20 %	60 %	20 %	16081634
10255	NC_002578	A	6	6	553553	553558	100 %	0 %	0 %	0 %	16081634
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10258	NC_002578	ATA	3	9	553629	553637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081634
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10261	NC_002578	GATC	2	8	553721	553728	25 %	25 %	25 %	25 %	16081634
10262	NC_002578	A	6	6	553731	553736	100 %	0 %	0 %	0 %	16081634
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10264	NC_002578	TCTT	2	8	553808	553815	0 %	75 %	0 %	25 %	16081635
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10292	NC_002578	ATT	2	6	555383	555388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10371	NC_002578	AGG	2	6	559741	559746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081639
10372	NC_002578	GCTAT	2	10	559756	559765	20 %	40 %	20 %	20 %	16081639
10373	NC_002578	CAT	2	6	559780	559785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081639
10374	NC_002578	CAT	2	6	559820	559825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081639
10375	NC_002578	ATG	3	9	559849	559857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081639
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10377	NC_002578	GCA	2	6	559944	559949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081639
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10384	NC_002578	AAT	2	6	560434	560439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081640
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10400	NC_002578	ATC	2	6	561042	561047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081640
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10412	NC_002578	CTTT	2	8	561783	561790	0 %	75 %	0 %	25 %	16081641
10413	NC_002578	TAT	2	6	561891	561896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10416	NC_002578	AT	3	6	562058	562063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10417	NC_002578	TAA	2	6	562196	562201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10418	NC_002578	CT	3	6	562277	562282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10419	NC_002578	CCG	2	6	562288	562293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10420	NC_002578	TCATC	2	10	562337	562346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10421	NC_002578	AG	3	6	562438	562443	50 %	0 %	50 %	0 %	16081642
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10430	NC_002578	TGA	2	6	562812	562817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10432	NC_002578	ATCA	2	8	562866	562873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10433	NC_002578	TAGAAA	2	12	562885	562896	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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10436	NC_002578	GCC	2	6	563110	563115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10441	NC_002578	TAT	2	6	563274	563279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10442	NC_002578	AATC	2	8	563311	563318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10443	NC_002578	TAAG	2	8	563345	563352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10444	NC_002578	GAC	2	6	563370	563375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10447	NC_002578	GAT	2	6	563475	563480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081643
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10463	NC_002578	GTT	2	6	563955	563960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081643
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10480	NC_002578	TGA	2	6	564807	564812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081644
10481	NC_002578	TA	3	6	564816	564821	50 %	50 %	0 %	0 %	16081644
10482	NC_002578	GGTTC	2	10	564845	564854	0 %	40 %	40 %	20 %	16081644
10483	NC_002578	TTC	2	6	564874	564879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081644
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10485	NC_002578	ATCA	2	8	564993	565000	50 %	25 %	0 %	25 %	16081644
10486	NC_002578	TTC	2	6	565004	565009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081644
10487	NC_002578	GAT	2	6	565132	565137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081644
10488	NC_002578	TAT	2	6	565186	565191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081644
10489	NC_002578	GCA	2	6	565333	565338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081644
10490	NC_002578	AGAGA	2	10	565591	565600	60 %	0 %	40 %	0 %	16081644
10491	NC_002578	T	7	7	565620	565626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_002578	GAA	2	6	565633	565638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_002578	CGAAT	2	10	565673	565682	40 %	20 %	20 %	20 %	16081645
10494	NC_002578	TACT	2	8	565688	565695	25 %	50 %	0 %	25 %	16081645
10495	NC_002578	ATA	2	6	565721	565726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081645
10496	NC_002578	CTT	2	6	565728	565733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081645
10497	NC_002578	GAA	2	6	565782	565787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081645
10498	NC_002578	AT	3	6	565834	565839	50 %	50 %	0 %	0 %	16081645
10499	NC_002578	ATG	2	6	565892	565897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081645
10500	NC_002578	TTC	2	6	565926	565931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081645

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