MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_002578	AGA	2	6	433379	433384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082519
8003	NC_002578	ATC	2	6	433419	433424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082519
8004	NC_002578	GAT	3	9	433479	433487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082519
8005	NC_002578	CGG	2	6	433581	433586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082519
8006	NC_002578	GAA	2	6	433620	433625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082519
8007	NC_002578	CAG	2	6	433643	433648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082519
8008	NC_002578	ATA	2	6	433663	433668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082519
8009	NC_002578	GAG	2	6	433672	433677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082519
8010	NC_002578	ATA	2	6	433690	433695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082519
8011	NC_002578	AT	3	6	433721	433726	50 %	50 %	0 %	0 %	16082519
8012	NC_002578	CGA	2	6	433736	433741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082519
8013	NC_002578	AATG	2	8	433755	433762	50 %	25 %	25 %	0 %	16082519
8014	NC_002578	ATGA	2	8	433789	433796	50 %	25 %	25 %	0 %	16082519
8015	NC_002578	GCA	2	6	433895	433900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082519
8016	NC_002578	CGGT	2	8	433916	433923	0 %	25 %	50 %	25 %	16082519
8017	NC_002578	AAC	2	6	433935	433940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082519
8018	NC_002578	GAG	2	6	433941	433946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082519
8019	NC_002578	TGGCC	2	10	434025	434034	0 %	20 %	40 %	40 %	16082519
8020	NC_002578	TGTC	2	8	434117	434124	0 %	50 %	25 %	25 %	16082519
8021	NC_002578	TGA	2	6	434136	434141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082519
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8024	NC_002578	AT	3	6	434180	434185	50 %	50 %	0 %	0 %	16082519
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8035	NC_002578	TATT	2	8	434730	434737	25 %	75 %	0 %	0 %	16081530
8036	NC_002578	AGA	2	6	434775	434780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081530
8037	NC_002578	GAATC	2	10	434877	434886	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8038	NC_002578	TCA	2	6	434986	434991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_002578	TCTCC	2	10	435045	435054	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8040	NC_002578	CCT	2	6	435074	435079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_002578	CCA	2	6	435234	435239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081531
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8043	NC_002578	CGA	2	6	435494	435499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081531
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8045	NC_002578	TAT	2	6	435564	435569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081531
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8049	NC_002578	A	7	7	435666	435672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_002578	AATTG	2	10	435676	435685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_002578	GCAT	2	8	435814	435821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_002578	GAA	2	6	435870	435875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8055	NC_002578	AT	3	6	436178	436183	50 %	50 %	0 %	0 %	16081532
8056	NC_002578	AT	3	6	436253	436258	50 %	50 %	0 %	0 %	16081532
8057	NC_002578	TGA	4	12	436346	436357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081532
8058	NC_002578	ATT	2	6	436392	436397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081532
8059	NC_002578	ACA	2	6	436404	436409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081532
8060	NC_002578	TAAT	2	8	436479	436486	50 %	50 %	0 %	0 %	16081532
8061	NC_002578	TAAT	2	8	436494	436501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_002578	ATG	2	6	436613	436618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081533
8063	NC_002578	CGT	2	6	436668	436673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081533
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8067	NC_002578	AGGC	2	8	436741	436748	25 %	0 %	50 %	25 %	16081533
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8072	NC_002578	CTGAAG	2	12	437105	437116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081533
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8074	NC_002578	TGC	2	6	437284	437289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081533
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8107	NC_002578	CCT	2	6	438777	438782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081535
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8120	NC_002578	TGA	2	6	439411	439416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081536
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8497	NC_002578	TAT	2	6	459375	459380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081553
8498	NC_002578	CTT	2	6	459408	459413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081554
8499	NC_002578	ACC	2	6	459429	459434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081554
8500	NC_002578	CTT	2	6	459438	459443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081554

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