MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002578	TTC	2	6	355035	355040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081465
6502	NC_002578	GAA	2	6	355100	355105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081465
6503	NC_002578	CTG	2	6	355140	355145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081465
6504	NC_002578	ATG	2	6	355162	355167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081465
6505	NC_002578	TGC	2	6	355171	355176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081465
6506	NC_002578	ATT	2	6	355214	355219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_002578	T	6	6	355218	355223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_002578	ATT	2	6	355224	355229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_002578	TCT	2	6	355266	355271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081466
6510	NC_002578	ACG	2	6	355370	355375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081466
6511	NC_002578	AGA	2	6	355461	355466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081466
6512	NC_002578	GAA	3	9	355507	355515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081466
6513	NC_002578	CCAA	2	8	355589	355596	50 %	0 %	0 %	50 %	16081466
6514	NC_002578	CAGC	2	8	355623	355630	25 %	0 %	25 %	50 %	16081466
6515	NC_002578	ATC	2	6	355631	355636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081466
6516	NC_002578	TCA	2	6	355743	355748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081466
6517	NC_002578	TCG	2	6	355749	355754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081466
6518	NC_002578	GTA	2	6	355756	355761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081466
6519	NC_002578	GAAA	2	8	355826	355833	75 %	0 %	25 %	0 %	16081466
6520	NC_002578	TGA	2	6	355837	355842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081466
6521	NC_002578	TCC	2	6	355871	355876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081466
6522	NC_002578	CTTG	2	8	355936	355943	0 %	50 %	25 %	25 %	16081466
6523	NC_002578	TCA	2	6	355946	355951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081466
6524	NC_002578	CCG	2	6	356030	356035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081466
6525	NC_002578	ATG	2	6	356036	356041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081466
6526	NC_002578	TACC	2	8	356121	356128	25 %	25 %	0 %	50 %	16081466
6527	NC_002578	AGC	2	6	356138	356143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081466
6528	NC_002578	CAT	2	6	356242	356247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081466
6529	NC_002578	AAC	2	6	356284	356289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081466
6530	NC_002578	TCT	2	6	356316	356321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081466
6531	NC_002578	AGC	2	6	356351	356356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081466
6532	NC_002578	GTAT	2	8	356400	356407	25 %	50 %	25 %	0 %	16081466
6533	NC_002578	CAG	2	6	356440	356445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081466
6534	NC_002578	GAA	2	6	356557	356562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081466
6535	NC_002578	CCT	2	6	356577	356582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_002578	CAG	2	6	356613	356618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_002578	AT	4	8	356638	356645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_002578	GATT	2	8	356689	356696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_002578	A	7	7	356708	356714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_002578	CTGG	2	8	356755	356762	0 %	25 %	50 %	25 %	16081467
6541	NC_002578	CAT	2	6	356868	356873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081467
6542	NC_002578	TC	3	6	356895	356900	0 %	50 %	0 %	50 %	16081467
6543	NC_002578	CAA	2	6	356913	356918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081467
6544	NC_002578	GAG	2	6	356923	356928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081467
6545	NC_002578	GAG	2	6	356974	356979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081467
6546	NC_002578	GAA	2	6	357093	357098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081467
6547	NC_002578	TAC	2	6	357238	357243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081467
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6549	NC_002578	AGGG	2	8	357325	357332	25 %	0 %	75 %	0 %	16081467
6550	NC_002578	GAG	2	6	357352	357357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081467
6551	NC_002578	GAT	3	9	357460	357468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081467
6552	NC_002578	GCT	2	6	357477	357482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081467
6553	NC_002578	CGA	2	6	357582	357587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081467
6554	NC_002578	AGGTA	2	10	357621	357630	40 %	20 %	40 %	0 %	16081467
6555	NC_002578	ATC	2	6	357667	357672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081467
6556	NC_002578	A	6	6	357676	357681	100 %	0 %	0 %	0 %	16081467
6557	NC_002578	ATATA	2	10	357685	357694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_002578	AG	3	6	357781	357786	50 %	0 %	50 %	0 %	16081468
6559	NC_002578	A	7	7	357819	357825	100 %	0 %	0 %	0 %	16081468
6560	NC_002578	GGA	2	6	357846	357851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081468
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6562	NC_002578	GGA	2	6	357945	357950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081468
6563	NC_002578	AG	3	6	357973	357978	50 %	0 %	50 %	0 %	16081468
6564	NC_002578	TTC	2	6	357989	357994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081468
6565	NC_002578	GCTT	2	8	358050	358057	0 %	50 %	25 %	25 %	16081468
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6569	NC_002578	CAT	2	6	358200	358205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081469
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6572	NC_002578	CGC	2	6	358368	358373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081469
6573	NC_002578	ATTCTG	2	12	358470	358481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081469
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6579	NC_002578	TCA	2	6	358766	358771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081470
6580	NC_002578	CG	3	6	358820	358825	0 %	0 %	50 %	50 %	16081470
6581	NC_002578	CGTA	2	8	358852	358859	25 %	25 %	25 %	25 %	16081470
6582	NC_002578	TCT	2	6	358906	358911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081470
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6586	NC_002578	TTA	2	6	359078	359083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081470
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6588	NC_002578	TGC	2	6	359129	359134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081470
6589	NC_002578	TCC	2	6	359182	359187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081470
6590	NC_002578	TGA	2	6	359192	359197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081470
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6592	NC_002578	GGATC	2	10	359278	359287	20 %	20 %	40 %	20 %	16081470
6593	NC_002578	AGA	2	6	359305	359310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081470
6594	NC_002578	TCA	2	6	359352	359357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_002578	GTA	2	6	359502	359507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082514
6596	NC_002578	TAT	2	6	359508	359513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082514
6597	NC_002578	ATCTT	2	10	359548	359557	20 %	60 %	0 %	20 %	16082514
6598	NC_002578	TGA	2	6	359660	359665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082514
6599	NC_002578	GGTGC	2	10	359673	359682	0 %	20 %	60 %	20 %	16082514
6600	NC_002578	TG	3	6	359709	359714	0 %	50 %	50 %	0 %	16082514
6601	NC_002578	CCG	2	6	359864	359869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082514
6602	NC_002578	CGT	2	6	359984	359989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082514
6603	NC_002578	GTC	2	6	360003	360008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082514
6604	NC_002578	TGAA	2	8	360092	360099	50 %	25 %	25 %	0 %	16082514
6605	NC_002578	TCT	2	6	360119	360124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082514
6606	NC_002578	CTC	2	6	360162	360167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082514
6607	NC_002578	GTA	2	6	360195	360200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082514
6608	NC_002578	CAG	2	6	360210	360215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082514
6609	NC_002578	CTC	2	6	360229	360234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082514
6610	NC_002578	TTC	2	6	360394	360399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082514
6611	NC_002578	TCC	2	6	360400	360405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082514
6612	NC_002578	CTG	2	6	360418	360423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082514
6613	NC_002578	TTC	2	6	360427	360432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082514
6614	NC_002578	AG	3	6	360662	360667	50 %	0 %	50 %	0 %	16081471
6615	NC_002578	GGT	2	6	360695	360700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081471
6616	NC_002578	CAG	2	6	360769	360774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081471
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6619	NC_002578	CTT	2	6	360950	360955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081471
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6622	NC_002578	TC	3	6	361023	361028	0 %	50 %	0 %	50 %	16081471
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