MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 29169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002578	CA	3	6	271144	271149	50 %	0 %	0 %	50 %	16081403
5002	NC_002578	GTG	2	6	271158	271163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081403
5003	NC_002578	ACA	2	6	271210	271215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081403
5004	NC_002578	GGT	2	6	271229	271234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081403
5005	NC_002578	ATA	2	6	271257	271262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081403
5006	NC_002578	ACT	2	6	271297	271302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081403
5007	NC_002578	AAC	2	6	271368	271373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081403
5008	NC_002578	ACTT	2	8	271374	271381	25 %	50 %	0 %	25 %	16081403
5009	NC_002578	TGGTA	2	10	271395	271404	20 %	40 %	40 %	0 %	16081403
5010	NC_002578	AAT	2	6	271518	271523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081403
5011	NC_002578	GCC	2	6	271541	271546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081403
5012	NC_002578	TACA	2	8	271547	271554	50 %	25 %	0 %	25 %	16081403
5013	NC_002578	CAG	2	6	271593	271598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081403
5014	NC_002578	CTT	2	6	271604	271609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081403
5015	NC_002578	GTC	3	9	271646	271654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081403
5016	NC_002578	T	6	6	271745	271750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_002578	T	6	6	271791	271796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_002578	GAA	3	9	271803	271811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_002578	AAT	2	6	271836	271841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_002578	GAAA	2	8	271848	271855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_002578	A	6	6	271853	271858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_002578	ATGA	2	8	271942	271949	50 %	25 %	25 %	0 %	16081404
5023	NC_002578	A	6	6	272077	272082	100 %	0 %	0 %	0 %	16081404
5024	NC_002578	CTA	2	6	272104	272109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081404
5025	NC_002578	AT	3	6	272136	272141	50 %	50 %	0 %	0 %	16081404
5026	NC_002578	GAA	2	6	272142	272147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081404
5027	NC_002578	TGAT	2	8	272166	272173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_002578	AT	4	8	272172	272179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_002578	A	6	6	272235	272240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_002578	TTA	2	6	272277	272282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_002578	ATA	2	6	272331	272336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081405
5032	NC_002578	AT	3	6	272346	272351	50 %	50 %	0 %	0 %	16081405
5033	NC_002578	A	6	6	272487	272492	100 %	0 %	0 %	0 %	16081405
5034	NC_002578	TA	3	6	272510	272515	50 %	50 %	0 %	0 %	16081405
5035	NC_002578	ATA	2	6	272661	272666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081405
5036	NC_002578	GCA	2	6	272688	272693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081405
5037	NC_002578	AGA	3	9	272697	272705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081405
5038	NC_002578	CTT	2	6	272811	272816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081405
5039	NC_002578	CAT	2	6	272928	272933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081405
5040	NC_002578	TTGCT	2	10	272956	272965	0 %	60 %	20 %	20 %	16081405
5041	NC_002578	CCA	2	6	272998	273003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081405
5042	NC_002578	ATGGAT	2	12	273015	273026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081405
5043	NC_002578	CAT	2	6	273041	273046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081405
5044	NC_002578	TGC	2	6	273095	273100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081405
5045	NC_002578	TA	3	6	273117	273122	50 %	50 %	0 %	0 %	16081405
5046	NC_002578	AT	3	6	273169	273174	50 %	50 %	0 %	0 %	16081405
5047	NC_002578	TTA	2	6	273194	273199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081405
5048	NC_002578	ATA	3	9	273252	273260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081405
5049	NC_002578	TGT	2	6	273349	273354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_002578	A	6	6	273371	273376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_002578	C	6	6	273580	273585	0 %	0 %	0 %	100 %	16081406
5052	NC_002578	CAAATG	2	12	273609	273620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16081406
5053	NC_002578	ATT	2	6	273677	273682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081406
5054	NC_002578	GTA	2	6	273683	273688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081406
5055	NC_002578	TTC	2	6	273699	273704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081406
5056	NC_002578	ATC	2	6	273722	273727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081406
5057	NC_002578	GGC	2	6	273740	273745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081406
5058	NC_002578	GGC	2	6	273845	273850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081406
5059	NC_002578	TG	3	6	273871	273876	0 %	50 %	50 %	0 %	16081406
5060	NC_002578	TA	3	6	273883	273888	50 %	50 %	0 %	0 %	16081406
5061	NC_002578	TTC	2	6	273896	273901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081406
5062	NC_002578	TTC	2	6	273980	273985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081406
5063	NC_002578	GTT	2	6	274016	274021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081406
5064	NC_002578	CCA	2	6	274097	274102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081406
5065	NC_002578	TGG	2	6	274157	274162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081406
5066	NC_002578	ACT	2	6	274257	274262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081406
5067	NC_002578	TGT	2	6	274276	274281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081407
5068	NC_002578	CGA	2	6	274340	274345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081407
5069	NC_002578	GAG	2	6	274593	274598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081407
5070	NC_002578	CAG	2	6	274628	274633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081407
5071	NC_002578	TGG	2	6	274748	274753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081407
5072	NC_002578	CTT	2	6	274785	274790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081407
5073	NC_002578	ATT	2	6	274802	274807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081407
5074	NC_002578	ATC	2	6	274902	274907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081407
5075	NC_002578	TCA	2	6	274909	274914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081407
5076	NC_002578	T	6	6	274960	274965	0 %	100 %	0 %	0 %	16081407
5077	NC_002578	TTGC	2	8	275040	275047	0 %	50 %	25 %	25 %	16081407
5078	NC_002578	GAG	2	6	275178	275183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081407
5079	NC_002578	AAG	2	6	275199	275204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081407
5080	NC_002578	TGAG	2	8	275234	275241	25 %	25 %	50 %	0 %	16081407
5081	NC_002578	CT	3	6	275247	275252	0 %	50 %	0 %	50 %	16081408
5082	NC_002578	AT	3	6	275323	275328	50 %	50 %	0 %	0 %	16081408
5083	NC_002578	AAT	2	6	275358	275363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081408
5084	NC_002578	GTT	2	6	275383	275388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081408
5085	NC_002578	CAT	2	6	275546	275551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081408
5086	NC_002578	TGAAGG	2	12	275564	275575	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081408
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5088	NC_002578	AGGT	2	8	275636	275643	25 %	25 %	50 %	0 %	16081408
5089	NC_002578	ACG	2	6	275651	275656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081408
5090	NC_002578	TGA	2	6	275726	275731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081408
5091	NC_002578	TCG	2	6	275810	275815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081408
5092	NC_002578	CAGA	2	8	275821	275828	50 %	0 %	25 %	25 %	16081408
5093	NC_002578	AT	4	8	275841	275848	50 %	50 %	0 %	0 %	16081408
5094	NC_002578	ATA	2	6	275858	275863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081408
5095	NC_002578	TA	3	6	275890	275895	50 %	50 %	0 %	0 %	16081408
5096	NC_002578	TAT	2	6	275900	275905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081408
5097	NC_002578	GTTCC	2	10	275987	275996	0 %	40 %	20 %	40 %	16081408
5098	NC_002578	AGA	2	6	276114	276119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081408
5099	NC_002578	ACC	2	6	276120	276125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081408
5100	NC_002578	GCTG	2	8	276161	276168	0 %	25 %	50 %	25 %	16081408
5101	NC_002578	AAG	2	6	276176	276181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081408
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5104	NC_002578	ATA	2	6	276402	276407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081409
5105	NC_002578	TTC	2	6	276435	276440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081409
5106	NC_002578	AGG	2	6	276483	276488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081409
5107	NC_002578	AAT	2	6	276509	276514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081409
5108	NC_002578	GGAA	2	8	276516	276523	50 %	0 %	50 %	0 %	16081409
5109	NC_002578	AGA	2	6	276608	276613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_002578	TAT	2	6	276649	276654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_002578	CTA	2	6	276666	276671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_002578	TAA	2	6	276721	276726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081410
5113	NC_002578	ATA	2	6	276735	276740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081410
5114	NC_002578	GTG	2	6	276768	276773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081410
5115	NC_002578	A	6	6	276856	276861	100 %	0 %	0 %	0 %	16081410
5116	NC_002578	AAC	2	6	276874	276879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081410
5117	NC_002578	ATCT	2	8	276921	276928	25 %	50 %	0 %	25 %	16081410
5118	NC_002578	TAT	2	6	276963	276968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081410
5119	NC_002578	A	6	6	277098	277103	100 %	0 %	0 %	0 %	16081410
5120	NC_002578	TAT	2	6	277166	277171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081410
5121	NC_002578	TAT	2	6	277278	277283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081410
5122	NC_002578	TAG	2	6	277312	277317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081410
5123	NC_002578	TGC	2	6	277346	277351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081410
5124	NC_002578	AAC	2	6	277382	277387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081410
5125	NC_002578	TCA	2	6	277427	277432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081410
5126	NC_002578	ATG	2	6	277555	277560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081410
5127	NC_002578	AAG	2	6	277570	277575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081410
5128	NC_002578	CT	3	6	277597	277602	0 %	50 %	0 %	50 %	16081410
5129	NC_002578	GAAAG	2	10	277710	277719	60 %	0 %	40 %	0 %	16081411
5130	NC_002578	TCA	2	6	277769	277774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081411
5131	NC_002578	TAA	2	6	277827	277832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081411
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5140	NC_002578	ACA	2	6	278159	278164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081411
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5143	NC_002578	CAG	2	6	278484	278489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081411
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5147	NC_002578	TATTG	2	10	278779	278788	20 %	60 %	20 %	0 %	16081411
5148	NC_002578	TTTA	2	8	278797	278804	25 %	75 %	0 %	0 %	16081411
5149	NC_002578	AGTA	2	8	278839	278846	50 %	25 %	25 %	0 %	16081411
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5152	NC_002578	AGT	2	6	278939	278944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081411
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5154	NC_002578	AT	3	6	279059	279064	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
5155	NC_002578	CAC	2	6	279139	279144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081411
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5158	NC_002578	TA	3	6	279506	279511	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
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5164	NC_002578	TTA	2	6	280014	280019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081412
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5179	NC_002578	A	6	6	280981	280986	100 %	0 %	0 %	0 %	16081412
5180	NC_002578	TTG	2	6	281047	281052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081412
5181	NC_002578	ATCAGG	2	12	281057	281068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081412
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5197	NC_002578	ATC	2	6	281982	281987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081413
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5199	NC_002578	GATGC	2	10	282064	282073	20 %	20 %	40 %	20 %	16081413
5200	NC_002578	TTA	2	6	282077	282082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081413
5201	NC_002578	TTTA	2	8	282085	282092	25 %	75 %	0 %	0 %	16081413
5202	NC_002578	A	6	6	282139	282144	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
5203	NC_002578	A	6	6	282180	282185	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
5204	NC_002578	TA	5	10	282195	282204	50 %	50 %	0 %	0 %	16081413
5205	NC_002578	A	6	6	282208	282213	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
5206	NC_002578	TATG	2	8	282254	282261	25 %	50 %	25 %	0 %	16081413
5207	NC_002578	TA	3	6	282271	282276	50 %	50 %	0 %	0 %	16081413
5208	NC_002578	T	6	6	282282	282287	0 %	100 %	0 %	0 %	16081413
5209	NC_002578	TTCCA	2	10	282389	282398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5210	NC_002578	CCA	2	6	282568	282573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5211	NC_002578	CTATG	2	10	282588	282597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5212	NC_002578	AT	3	6	282623	282628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5213	NC_002578	TTGCCA	2	12	282691	282702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5214	NC_002578	TTA	2	6	282720	282725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5215	NC_002578	AAG	2	6	282812	282817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5216	NC_002578	CAT	2	6	282943	282948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5217	NC_002578	ATA	2	6	282964	282969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5218	NC_002578	T	7	7	283037	283043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5219	NC_002578	TA	3	6	283077	283082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_002578	GAA	2	6	283102	283107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_002578	T	6	6	283120	283125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_002578	TAT	2	6	283132	283137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_002578	A	8	8	283222	283229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_002578	TA	4	8	283231	283238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_002578	CTTC	2	8	283333	283340	0 %	50 %	0 %	50 %	16081414
5226	NC_002578	CAGT	2	8	283362	283369	25 %	25 %	25 %	25 %	16081414
5227	NC_002578	GCAA	2	8	283397	283404	50 %	0 %	25 %	25 %	16081414
5228	NC_002578	CGG	2	6	283451	283456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081414
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5230	NC_002578	CAT	2	6	283513	283518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
5231	NC_002578	TGA	2	6	283538	283543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
5232	NC_002578	AT	3	6	283545	283550	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
5233	NC_002578	TTC	2	6	283566	283571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081414
5234	NC_002578	CTT	2	6	283600	283605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081414
5235	NC_002578	TAC	2	6	283640	283645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
5236	NC_002578	AT	3	6	283686	283691	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
5237	NC_002578	CAGGC	2	10	283703	283712	20 %	0 %	40 %	40 %	16081414
5238	NC_002578	GAT	2	6	283722	283727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
5239	NC_002578	TACG	2	8	283751	283758	25 %	25 %	25 %	25 %	16081414
5240	NC_002578	A	6	6	283818	283823	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
5241	NC_002578	A	6	6	283844	283849	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
5242	NC_002578	ATT	2	6	283922	283927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081414
5243	NC_002578	TGT	2	6	283970	283975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081414
5244	NC_002578	TTTA	2	8	284024	284031	25 %	75 %	0 %	0 %	16081414
5245	NC_002578	ACG	2	6	284037	284042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
5246	NC_002578	AT	3	6	284213	284218	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
5247	NC_002578	GCT	2	6	284379	284384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081414
5248	NC_002578	GTG	2	6	284401	284406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081414
5249	NC_002578	CAA	2	6	284446	284451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081414
5250	NC_002578	CAG	2	6	284508	284513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
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5252	NC_002578	GAA	2	6	284705	284710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081414
5253	NC_002578	GAT	2	6	284720	284725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
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5496	NC_002578	CAG	2	6	298066	298071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081422
5497	NC_002578	AGA	2	6	298076	298081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081422
5498	NC_002578	AATTT	2	10	298086	298095	40 %	60 %	0 %	0 %	16081422
5499	NC_002578	T	6	6	298093	298098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_002578	ATT	2	6	298104	298109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081423

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