MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000919	C	10	10	148336	148345	0 %	0 %	0 %	100 %	15639120
3002	NC_000919	GTTC	2	8	148375	148382	0 %	50 %	25 %	25 %	15639120
3003	NC_000919	CG	3	6	148384	148389	0 %	0 %	50 %	50 %	15639120
3004	NC_000919	GCA	2	6	148394	148399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639120
3005	NC_000919	CG	3	6	148400	148405	0 %	0 %	50 %	50 %	15639120
3006	NC_000919	GCA	3	9	148545	148553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_000919	GTTT	2	8	148674	148681	0 %	75 %	25 %	0 %	15639121
3008	NC_000919	TAC	2	6	148783	148788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639121
3009	NC_000919	TGT	2	6	148844	148849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639121
3010	NC_000919	GT	3	6	148899	148904	0 %	50 %	50 %	0 %	15639121
3011	NC_000919	G	11	11	148931	148941	0 %	0 %	100 %	0 %	15639121
3012	NC_000919	ACT	2	6	149026	149031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639121
3013	NC_000919	CGGA	2	8	149224	149231	25 %	0 %	50 %	25 %	15639121
3014	NC_000919	GTT	2	6	149318	149323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_000919	GGCTGG	4	24	149324	149347	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3016	NC_000919	GTAC	2	8	149369	149376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_000919	GCT	2	6	149442	149447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_000919	TCC	2	6	149476	149481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639122
3019	NC_000919	T	6	6	149549	149554	0 %	100 %	0 %	0 %	15639122
3020	NC_000919	GC	3	6	149570	149575	0 %	0 %	50 %	50 %	15639122
3021	NC_000919	GAC	2	6	149624	149629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639122
3022	NC_000919	GCA	2	6	149640	149645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639122
3023	NC_000919	GCTT	2	8	149646	149653	0 %	50 %	25 %	25 %	15639122
3024	NC_000919	CCG	2	6	149661	149666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639122
3025	NC_000919	CTG	2	6	149686	149691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639122
3026	NC_000919	GTTTG	2	10	149702	149711	0 %	60 %	40 %	0 %	15639122
3027	NC_000919	G	6	6	149730	149735	0 %	0 %	100 %	0 %	15639122
3028	NC_000919	TCC	2	6	149760	149765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639122
3029	NC_000919	CCA	2	6	149785	149790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639122
3030	NC_000919	T	7	7	149791	149797	0 %	100 %	0 %	0 %	15639122
3031	NC_000919	GCGG	2	8	149894	149901	0 %	0 %	75 %	25 %	15639123
3032	NC_000919	GTC	2	6	149998	150003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639123
3033	NC_000919	CGGCTC	2	12	150021	150032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15639123
3034	NC_000919	T	6	6	150054	150059	0 %	100 %	0 %	0 %	15639123
3035	NC_000919	GC	3	6	150075	150080	0 %	0 %	50 %	50 %	15639123
3036	NC_000919	GCA	3	9	150124	150132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639123
3037	NC_000919	T	6	6	150135	150140	0 %	100 %	0 %	0 %	15639123
3038	NC_000919	CCG	2	6	150148	150153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639123
3039	NC_000919	GAC	2	6	150180	150185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639123
3040	NC_000919	CCA	2	6	150236	150241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639123
3041	NC_000919	TCTT	2	8	150327	150334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_000919	GTT	2	6	150529	150534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_000919	CTGCGG	4	24	150537	150560	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_000919	CG	3	6	150613	150618	0 %	0 %	50 %	50 %	15639124
3045	NC_000919	AGC	2	6	150656	150661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639124
3046	NC_000919	AGC	2	6	150665	150670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639124
3047	NC_000919	CCG	2	6	150696	150701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639124
3048	NC_000919	CTG	2	6	150718	150723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639124
3049	NC_000919	TG	3	6	150788	150793	0 %	50 %	50 %	0 %	15639124
3050	NC_000919	CCT	2	6	150794	150799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639124
3051	NC_000919	CCA	2	6	150818	150823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639124
3052	NC_000919	CA	3	6	150879	150884	50 %	0 %	0 %	50 %	15639124
3053	NC_000919	GCGG	2	8	151009	151016	0 %	0 %	75 %	25 %	15639124
3054	NC_000919	CGGCTC	2	12	151042	151053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_000919	AGCA	2	8	151184	151191	50 %	0 %	25 %	25 %	15639125
3056	NC_000919	TTCA	2	8	151271	151278	25 %	50 %	0 %	25 %	15639125
3057	NC_000919	TAA	2	6	151297	151302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639125
3058	NC_000919	TG	4	8	151334	151341	0 %	50 %	50 %	0 %	15639125
3059	NC_000919	CAC	2	6	151383	151388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639125
3060	NC_000919	GGTG	2	8	151528	151535	0 %	25 %	75 %	0 %	15639125
3061	NC_000919	AGT	2	6	151585	151590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639125
3062	NC_000919	AGA	2	6	151658	151663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639125
3063	NC_000919	GC	3	6	151719	151724	0 %	0 %	50 %	50 %	15639125
3064	NC_000919	GC	3	6	151834	151839	0 %	0 %	50 %	50 %	15639125
3065	NC_000919	AGC	2	6	151892	151897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639125
3066	NC_000919	TGG	2	6	151940	151945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639125
3067	NC_000919	CAT	2	6	151946	151951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639125
3068	NC_000919	CT	4	8	152020	152027	0 %	50 %	0 %	50 %	15639125
3069	NC_000919	CCT	2	6	152121	152126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639125
3070	NC_000919	TGTTT	2	10	152144	152153	0 %	80 %	20 %	0 %	15639125
3071	NC_000919	AGC	2	6	152226	152231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639125
3072	NC_000919	GTG	2	6	152292	152297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639125
3073	NC_000919	AGGA	2	8	152325	152332	50 %	0 %	50 %	0 %	15639125
3074	NC_000919	CCGGAG	2	12	152400	152411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15639125
3075	NC_000919	CA	3	6	152489	152494	50 %	0 %	0 %	50 %	15639125
3076	NC_000919	GGAA	2	8	152548	152555	50 %	0 %	50 %	0 %	15639125
3077	NC_000919	AGA	2	6	152594	152599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639125
3078	NC_000919	CAGCTG	2	12	152624	152635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15639125
3079	NC_000919	CGG	2	6	152664	152669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639125
3080	NC_000919	TTC	2	6	152763	152768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639125
3081	NC_000919	GAGT	2	8	152815	152822	25 %	25 %	50 %	0 %	15639125
3082	NC_000919	AGC	2	6	152840	152845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639125
3083	NC_000919	CCTG	2	8	152881	152888	0 %	25 %	25 %	50 %	15639125
3084	NC_000919	CACT	2	8	152891	152898	25 %	25 %	0 %	50 %	15639125
3085	NC_000919	CTC	2	6	152903	152908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_000919	C	9	9	152923	152931	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3087	NC_000919	TAAAAA	2	12	152955	152966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15639126
3088	NC_000919	CG	3	6	153097	153102	0 %	0 %	50 %	50 %	15639126
3089	NC_000919	GCG	2	6	153154	153159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639127
3090	NC_000919	TCGT	2	8	153190	153197	0 %	50 %	25 %	25 %	15639127
3091	NC_000919	GGTCT	2	10	153218	153227	0 %	40 %	40 %	20 %	15639127
3092	NC_000919	T	7	7	153275	153281	0 %	100 %	0 %	0 %	15639127
3093	NC_000919	TAC	2	6	153320	153325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639127
3094	NC_000919	CTTC	2	8	153395	153402	0 %	50 %	0 %	50 %	15639127
3095	NC_000919	TC	3	6	153458	153463	0 %	50 %	0 %	50 %	15639127
3096	NC_000919	TCG	2	6	153496	153501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639127
3097	NC_000919	GAA	2	6	153513	153518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639127
3098	NC_000919	TG	3	6	153557	153562	0 %	50 %	50 %	0 %	15639127
3099	NC_000919	GCT	2	6	153580	153585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639127
3100	NC_000919	T	6	6	153633	153638	0 %	100 %	0 %	0 %	15639127
3101	NC_000919	CGT	2	6	153683	153688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639127
3102	NC_000919	CGG	2	6	153705	153710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639127
3103	NC_000919	TTC	2	6	153717	153722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639127
3104	NC_000919	AC	4	8	153760	153767	50 %	0 %	0 %	50 %	15639127
3105	NC_000919	TGG	2	6	153773	153778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639127
3106	NC_000919	GCAG	2	8	153803	153810	25 %	0 %	50 %	25 %	15639127
3107	NC_000919	CCA	2	6	153841	153846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639127
3108	NC_000919	ACT	2	6	153855	153860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639127
3109	NC_000919	ATC	2	6	153876	153881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639127
3110	NC_000919	ATG	2	6	153902	153907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639127
3111	NC_000919	CTT	2	6	154124	154129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639127
3112	NC_000919	TGG	2	6	154160	154165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639127
3113	NC_000919	GC	3	6	154283	154288	0 %	0 %	50 %	50 %	15639127
3114	NC_000919	CAC	2	6	154329	154334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639127
3115	NC_000919	CTG	2	6	154348	154353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639127
3116	NC_000919	TCGC	2	8	154419	154426	0 %	25 %	25 %	50 %	15639128
3117	NC_000919	GGTCT	2	10	154447	154456	0 %	40 %	40 %	20 %	15639128
3118	NC_000919	T	6	6	154505	154510	0 %	100 %	0 %	0 %	15639128
3119	NC_000919	TAC	2	6	154549	154554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639128
3120	NC_000919	GGT	2	6	154604	154609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639128
3121	NC_000919	CCG	2	6	154624	154629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639128
3122	NC_000919	GAA	2	6	154647	154652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639128
3123	NC_000919	GAG	2	6	154653	154658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639128
3124	NC_000919	CTG	2	6	154697	154702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639128
3125	NC_000919	GCAAGC	2	12	154746	154757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639128
3126	NC_000919	CAC	2	6	154785	154790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639128
3127	NC_000919	TGC	2	6	154861	154866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639128
3128	NC_000919	AGG	2	6	154939	154944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639128
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3130	NC_000919	C	6	6	154998	155003	0 %	0 %	0 %	100 %	15639128
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3139	NC_000919	CTG	2	6	155372	155377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639128
3140	NC_000919	TGG	2	6	155380	155385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639128
3141	NC_000919	GCTG	2	8	155416	155423	0 %	25 %	50 %	25 %	15639128
3142	NC_000919	AGC	2	6	155430	155435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639128
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3148	NC_000919	TG	3	6	155640	155645	0 %	50 %	50 %	0 %	15639129
3149	NC_000919	A	6	6	155679	155684	100 %	0 %	0 %	0 %	15639129
3150	NC_000919	CTGCG	2	10	155738	155747	0 %	20 %	40 %	40 %	15639129
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3155	NC_000919	CG	4	8	155833	155840	0 %	0 %	50 %	50 %	15639129
3156	NC_000919	CCGC	2	8	155889	155896	0 %	0 %	25 %	75 %	15639129
3157	NC_000919	GC	3	6	156011	156016	0 %	0 %	50 %	50 %	15639129
3158	NC_000919	ACT	2	6	156164	156169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639129
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3165	NC_000919	CG	3	6	156376	156381	0 %	0 %	50 %	50 %	15639129
3166	NC_000919	CCG	2	6	156385	156390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639129
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3169	NC_000919	GC	3	6	156546	156551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3170	NC_000919	CG	4	8	156560	156567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3190	NC_000919	CTC	3	9	157425	157433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639130
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3202	NC_000919	CGA	2	6	157796	157801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639130
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3213	NC_000919	CGC	2	6	158193	158198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639130
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3217	NC_000919	GCAAG	2	10	158434	158443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3218	NC_000919	AGA	2	6	158472	158477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3219	NC_000919	GGTG	2	8	158517	158524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_000919	C	6	6	158631	158636	0 %	0 %	0 %	100 %	15639132
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3231	NC_000919	AGC	3	9	159053	159061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639132
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3233	NC_000919	AGGA	2	8	159156	159163	50 %	0 %	50 %	0 %	15639132
3234	NC_000919	CTT	2	6	159188	159193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639132
3235	NC_000919	AC	3	6	159209	159214	50 %	0 %	0 %	50 %	15639132
3236	NC_000919	GCG	2	6	159253	159258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639132
3237	NC_000919	GTA	2	6	159360	159365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639133
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3239	NC_000919	TC	3	6	159451	159456	0 %	50 %	0 %	50 %	15639133
3240	NC_000919	TTC	2	6	159465	159470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639133
3241	NC_000919	A	6	6	159486	159491	100 %	0 %	0 %	0 %	15639133
3242	NC_000919	CAA	2	6	159500	159505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639133
3243	NC_000919	GCG	2	6	159770	159775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639133
3244	NC_000919	TTG	2	6	159859	159864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639133
3245	NC_000919	ACA	2	6	159874	159879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639133
3246	NC_000919	ATG	2	6	159964	159969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639133
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3248	NC_000919	TGC	2	6	160065	160070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639134
3249	NC_000919	ATC	2	6	160123	160128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639134
3250	NC_000919	ATG	2	6	160350	160355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639134
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3252	NC_000919	AAG	2	6	160370	160375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639134
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