MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_000919	CGCCTT	2	12	1114981	1114992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23502	NC_000919	CAC	2	6	1115029	1115034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23503	NC_000919	AGG	2	6	1115047	1115052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640006
23504	NC_000919	GT	3	6	1115055	1115060	0 %	50 %	50 %	0 %	15640006
23505	NC_000919	AT	3	6	1115083	1115088	50 %	50 %	0 %	0 %	15640006
23506	NC_000919	A	6	6	1115379	1115384	100 %	0 %	0 %	0 %	15640006
23507	NC_000919	CG	3	6	1115385	1115390	0 %	0 %	50 %	50 %	15640006
23508	NC_000919	ACT	2	6	1115395	1115400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640006
23509	NC_000919	CA	3	6	1115454	1115459	50 %	0 %	0 %	50 %	15640006
23510	NC_000919	CCTG	2	8	1115493	1115500	0 %	25 %	25 %	50 %	15640006
23511	NC_000919	TAA	2	6	1115505	1115510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640006
23512	NC_000919	A	6	6	1115509	1115514	100 %	0 %	0 %	0 %	15640006
23513	NC_000919	TCA	2	6	1115573	1115578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640006
23514	NC_000919	A	6	6	1115609	1115614	100 %	0 %	0 %	0 %	15640006
23515	NC_000919	CCA	2	6	1115655	1115660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640006
23516	NC_000919	ACT	2	6	1115669	1115674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640006
23517	NC_000919	A	6	6	1115716	1115721	100 %	0 %	0 %	0 %	15640006
23518	NC_000919	TGAT	2	8	1115780	1115787	25 %	50 %	25 %	0 %	15640006
23519	NC_000919	A	6	6	1115817	1115822	100 %	0 %	0 %	0 %	15640006
23520	NC_000919	GAATC	2	10	1115829	1115838	40 %	20 %	20 %	20 %	15640006
23521	NC_000919	TTC	2	6	1115971	1115976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640006
23522	NC_000919	CCG	2	6	1116092	1116097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640006
23523	NC_000919	GC	4	8	1116147	1116154	0 %	0 %	50 %	50 %	15640006
23524	NC_000919	CA	3	6	1116159	1116164	50 %	0 %	0 %	50 %	15640006
23525	NC_000919	GAA	2	6	1116185	1116190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640006
23526	NC_000919	T	6	6	1116197	1116202	0 %	100 %	0 %	0 %	15640006
23527	NC_000919	GGA	2	6	1116220	1116225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640006
23528	NC_000919	AGAA	2	8	1116363	1116370	75 %	0 %	25 %	0 %	15640006
23529	NC_000919	CGG	2	6	1116382	1116387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640006
23530	NC_000919	CGA	2	6	1116423	1116428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23531	NC_000919	TTC	2	6	1116530	1116535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640007
23532	NC_000919	TCTGCA	2	12	1116570	1116581	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15640007
23533	NC_000919	CG	3	6	1116666	1116671	0 %	0 %	50 %	50 %	15640007
23534	NC_000919	ATC	2	6	1116680	1116685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640007
23535	NC_000919	GCT	2	6	1116769	1116774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640007
23536	NC_000919	CGAG	2	8	1116792	1116799	25 %	0 %	50 %	25 %	15640007
23537	NC_000919	TCA	2	6	1116864	1116869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640007
23538	NC_000919	CTC	2	6	1116890	1116895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640007
23539	NC_000919	GC	3	6	1116910	1116915	0 %	0 %	50 %	50 %	15640007
23540	NC_000919	CACC	2	8	1116946	1116953	25 %	0 %	0 %	75 %	15640007
23541	NC_000919	TCC	2	6	1116975	1116980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23542	NC_000919	CTT	2	6	1117062	1117067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23543	NC_000919	GCAC	2	8	1117138	1117145	25 %	0 %	25 %	50 %	15640008
23544	NC_000919	GC	4	8	1117150	1117157	0 %	0 %	50 %	50 %	15640008
23545	NC_000919	CCG	2	6	1117195	1117200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640008
23546	NC_000919	CGC	2	6	1117228	1117233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640008
23547	NC_000919	CCG	2	6	1117280	1117285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640008
23548	NC_000919	AC	3	6	1117347	1117352	50 %	0 %	0 %	50 %	15640008
23549	NC_000919	GCGA	2	8	1117353	1117360	25 %	0 %	50 %	25 %	15640008
23550	NC_000919	TTC	2	6	1117396	1117401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640008
23551	NC_000919	C	6	6	1117599	1117604	0 %	0 %	0 %	100 %	15640009
23552	NC_000919	GTA	2	6	1117623	1117628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640009
23553	NC_000919	CG	4	8	1117754	1117761	0 %	0 %	50 %	50 %	15640009
23554	NC_000919	GA	3	6	1117925	1117930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23555	NC_000919	CCG	2	6	1117950	1117955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23556	NC_000919	GCA	2	6	1117962	1117967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23557	NC_000919	AGA	2	6	1118031	1118036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23558	NC_000919	CCG	2	6	1118044	1118049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23559	NC_000919	CAG	2	6	1118057	1118062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23560	NC_000919	ACCA	2	8	1118066	1118073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23561	NC_000919	CAC	2	6	1118084	1118089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23562	NC_000919	GAA	2	6	1118205	1118210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23563	NC_000919	CTG	2	6	1118216	1118221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23564	NC_000919	TGA	2	6	1118260	1118265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23565	NC_000919	CA	3	6	1118314	1118319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23566	NC_000919	ATGCGT	2	12	1118386	1118397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15640010
23567	NC_000919	TTC	2	6	1118508	1118513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640010
23568	NC_000919	GCT	3	9	1118561	1118569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640010
23569	NC_000919	CAC	2	6	1118575	1118580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640010
23570	NC_000919	AGA	2	6	1118678	1118683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640010
23571	NC_000919	CTC	2	6	1118712	1118717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640010
23572	NC_000919	CA	3	6	1118725	1118730	50 %	0 %	0 %	50 %	15640010
23573	NC_000919	CCA	2	6	1118744	1118749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640010
23574	NC_000919	AC	3	6	1118783	1118788	50 %	0 %	0 %	50 %	15640010
23575	NC_000919	GCG	2	6	1118801	1118806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640010
23576	NC_000919	CTT	2	6	1118831	1118836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640010
23577	NC_000919	CGCA	2	8	1118900	1118907	25 %	0 %	25 %	50 %	15640010
23578	NC_000919	AAC	2	6	1119040	1119045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640010
23579	NC_000919	TGTA	2	8	1119159	1119166	25 %	50 %	25 %	0 %	15640010
23580	NC_000919	ACC	2	6	1119217	1119222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640010
23581	NC_000919	AGCG	2	8	1119251	1119258	25 %	0 %	50 %	25 %	15640010
23582	NC_000919	TG	3	6	1119419	1119424	0 %	50 %	50 %	0 %	15640010
23583	NC_000919	T	6	6	1119495	1119500	0 %	100 %	0 %	0 %	15640010
23584	NC_000919	AGAA	2	8	1119508	1119515	75 %	0 %	25 %	0 %	15640010
23585	NC_000919	AAG	2	6	1119630	1119635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640010
23586	NC_000919	GC	3	6	1119641	1119646	0 %	0 %	50 %	50 %	15640010
23587	NC_000919	GCA	2	6	1119686	1119691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640010
23588	NC_000919	TAC	2	6	1119750	1119755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640010
23589	NC_000919	GGC	2	6	1119918	1119923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640010
23590	NC_000919	GTTT	2	8	1119986	1119993	0 %	75 %	25 %	0 %	15640010
23591	NC_000919	A	6	6	1120057	1120062	100 %	0 %	0 %	0 %	15640010
23592	NC_000919	TTC	2	6	1120121	1120126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23593	NC_000919	G	6	6	1120384	1120389	0 %	0 %	100 %	0 %	15640011
23594	NC_000919	GAG	2	6	1120411	1120416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640011
23595	NC_000919	CA	3	6	1120433	1120438	50 %	0 %	0 %	50 %	15640011
23596	NC_000919	CTG	2	6	1120586	1120591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640011
23597	NC_000919	AGA	2	6	1120608	1120613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640011
23598	NC_000919	C	6	6	1120676	1120681	0 %	0 %	0 %	100 %	15640011
23599	NC_000919	TGCA	2	8	1120731	1120738	25 %	25 %	25 %	25 %	15640011
23600	NC_000919	AC	3	6	1120739	1120744	50 %	0 %	0 %	50 %	15640011
23601	NC_000919	AAACC	2	10	1120830	1120839	60 %	0 %	0 %	40 %	15640011
23602	NC_000919	TCA	2	6	1120922	1120927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640011
23603	NC_000919	GT	3	6	1121042	1121047	0 %	50 %	50 %	0 %	15640012
23604	NC_000919	CGC	2	6	1121126	1121131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640012
23605	NC_000919	TCA	2	6	1121153	1121158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640012
23606	NC_000919	CTC	2	6	1121256	1121261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640012
23607	NC_000919	TCG	2	6	1121264	1121269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640012
23608	NC_000919	CTT	2	6	1121385	1121390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640012
23609	NC_000919	TTC	2	6	1121413	1121418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640012
23610	NC_000919	GT	3	6	1121426	1121431	0 %	50 %	50 %	0 %	15640012
23611	NC_000919	GC	3	6	1121452	1121457	0 %	0 %	50 %	50 %	15640012
23612	NC_000919	CTC	2	6	1121482	1121487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640012
23613	NC_000919	CTC	2	6	1121494	1121499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15640012
23614	NC_000919	GGC	2	6	1121501	1121506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640012
23615	NC_000919	CTT	2	6	1121520	1121525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640012
23616	NC_000919	GGTG	2	8	1121625	1121632	0 %	25 %	75 %	0 %	15640012
23617	NC_000919	CTGC	2	8	1121661	1121668	0 %	25 %	25 %	50 %	15640012
23618	NC_000919	ACAA	2	8	1121678	1121685	75 %	0 %	0 %	25 %	15640012
23619	NC_000919	GGC	2	6	1121717	1121722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640012
23620	NC_000919	CCG	2	6	1121734	1121739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640012
23621	NC_000919	A	6	6	1121858	1121863	100 %	0 %	0 %	0 %	15640012
23622	NC_000919	CG	3	6	1121931	1121936	0 %	0 %	50 %	50 %	15640012
23623	NC_000919	CTT	2	6	1121943	1121948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640012
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23628	NC_000919	T	6	6	1122173	1122178	0 %	100 %	0 %	0 %	15640012
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23635	NC_000919	CG	3	6	1122566	1122571	0 %	0 %	50 %	50 %	15640012
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23652	NC_000919	T	6	6	1123356	1123361	0 %	100 %	0 %	0 %	15640013
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23656	NC_000919	CG	5	10	1123435	1123444	0 %	0 %	50 %	50 %	15640013
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23732	NC_000919	GC	3	6	1126547	1126552	0 %	0 %	50 %	50 %	15640017
23733	NC_000919	GCA	2	6	1126591	1126596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640017
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23735	NC_000919	GC	5	10	1126681	1126690	0 %	0 %	50 %	50 %	15640017
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23739	NC_000919	C	7	7	1126892	1126898	0 %	0 %	0 %	100 %	15640017
23740	NC_000919	CAG	2	6	1126910	1126915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640017
23741	NC_000919	AGCCCC	2	12	1126941	1126952	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	15640017
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