MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_000919	GCAC	2	8	1019521	1019528	25 %	0 %	25 %	50 %	15639923
21502	NC_000919	CATAG	2	10	1019556	1019565	40 %	20 %	20 %	20 %	15639923
21503	NC_000919	GGA	2	6	1019568	1019573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639923
21504	NC_000919	A	6	6	1019573	1019578	100 %	0 %	0 %	0 %	15639923
21505	NC_000919	CG	3	6	1019656	1019661	0 %	0 %	50 %	50 %	15639923
21506	NC_000919	TGC	2	6	1019688	1019693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639923
21507	NC_000919	TCT	2	6	1019755	1019760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639923
21508	NC_000919	CCTG	2	8	1019791	1019798	0 %	25 %	25 %	50 %	15639923
21509	NC_000919	ACC	2	6	1019880	1019885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639923
21510	NC_000919	CCA	2	6	1019996	1020001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639923
21511	NC_000919	CG	4	8	1020004	1020011	0 %	0 %	50 %	50 %	15639923
21512	NC_000919	T	6	6	1020073	1020078	0 %	100 %	0 %	0 %	15639923
21513	NC_000919	CTG	2	6	1020099	1020104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639923
21514	NC_000919	AGGA	2	8	1020107	1020114	50 %	0 %	50 %	0 %	15639923
21515	NC_000919	GA	3	6	1020113	1020118	50 %	0 %	50 %	0 %	15639923
21516	NC_000919	GA	3	6	1020171	1020176	50 %	0 %	50 %	0 %	15639923
21517	NC_000919	AC	3	6	1020183	1020188	50 %	0 %	0 %	50 %	15639923
21518	NC_000919	CG	3	6	1020199	1020204	0 %	0 %	50 %	50 %	15639923
21519	NC_000919	TTCA	2	8	1020244	1020251	25 %	50 %	0 %	25 %	15639923
21520	NC_000919	CTC	2	6	1020276	1020281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639923
21521	NC_000919	GC	3	6	1020300	1020305	0 %	0 %	50 %	50 %	15639923
21522	NC_000919	ACGG	2	8	1020318	1020325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21523	NC_000919	CTTCT	2	10	1020364	1020373	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21524	NC_000919	GC	3	6	1020374	1020379	0 %	0 %	50 %	50 %	15639924
21525	NC_000919	AGC	2	6	1020383	1020388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21526	NC_000919	GCTC	2	8	1020395	1020402	0 %	25 %	25 %	50 %	15639924
21527	NC_000919	CTT	2	6	1020435	1020440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21528	NC_000919	T	6	6	1020497	1020502	0 %	100 %	0 %	0 %	15639924
21529	NC_000919	CAT	2	6	1020642	1020647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639924
21530	NC_000919	CT	3	6	1020658	1020663	0 %	50 %	0 %	50 %	15639924
21531	NC_000919	CGC	2	6	1020775	1020780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639924
21532	NC_000919	ACC	2	6	1020826	1020831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21533	NC_000919	ACC	2	6	1020904	1020909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21534	NC_000919	GGT	2	6	1020969	1020974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639924
21535	NC_000919	GA	3	6	1020979	1020984	50 %	0 %	50 %	0 %	15639924
21536	NC_000919	GCT	2	6	1021053	1021058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21537	NC_000919	CTG	2	6	1021081	1021086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21538	NC_000919	A	6	6	1021092	1021097	100 %	0 %	0 %	0 %	15639924
21539	NC_000919	GCC	2	6	1021115	1021120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639924
21540	NC_000919	CTG	2	6	1021206	1021211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21541	NC_000919	CGT	2	6	1021261	1021266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21542	NC_000919	AT	3	6	1021294	1021299	50 %	50 %	0 %	0 %	15639924
21543	NC_000919	GAA	2	6	1021301	1021306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639924
21544	NC_000919	CAA	2	6	1021341	1021346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639924
21545	NC_000919	TCA	2	6	1021353	1021358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639924
21546	NC_000919	GGCA	2	8	1021389	1021396	25 %	0 %	50 %	25 %	15639924
21547	NC_000919	CTT	2	6	1021456	1021461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21548	NC_000919	AAG	2	6	1021487	1021492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639924
21549	NC_000919	T	6	6	1021571	1021576	0 %	100 %	0 %	0 %	15639924
21550	NC_000919	TGC	2	6	1021586	1021591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21551	NC_000919	AC	3	6	1021750	1021755	50 %	0 %	0 %	50 %	15639924
21552	NC_000919	GAC	2	6	1021962	1021967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21553	NC_000919	CCA	2	6	1022001	1022006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21554	NC_000919	AGCG	2	8	1022017	1022024	25 %	0 %	50 %	25 %	15639924
21555	NC_000919	GTG	2	6	1022036	1022041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639924
21556	NC_000919	A	6	6	1022147	1022152	100 %	0 %	0 %	0 %	15639924
21557	NC_000919	CAC	2	6	1022164	1022169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21558	NC_000919	CCT	2	6	1022235	1022240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639924
21559	NC_000919	TCT	2	6	1022424	1022429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21560	NC_000919	ACC	2	6	1022461	1022466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21561	NC_000919	CTT	2	6	1022470	1022475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21562	NC_000919	TTA	2	6	1022504	1022509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639924
21563	NC_000919	AAT	2	6	1022524	1022529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639924
21564	NC_000919	AC	3	6	1022593	1022598	50 %	0 %	0 %	50 %	15639924
21565	NC_000919	ATC	2	6	1022605	1022610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639924
21566	NC_000919	GCT	2	6	1022638	1022643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21567	NC_000919	CAT	2	6	1022652	1022657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639924
21568	NC_000919	ACCG	2	8	1022665	1022672	25 %	0 %	25 %	50 %	15639924
21569	NC_000919	TCT	2	6	1022685	1022690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21570	NC_000919	ACC	2	6	1022761	1022766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639924
21571	NC_000919	CTT	2	6	1022797	1022802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21572	NC_000919	AG	3	6	1022844	1022849	50 %	0 %	50 %	0 %	15639924
21573	NC_000919	TCGA	2	8	1022878	1022885	25 %	25 %	25 %	25 %	15639924
21574	NC_000919	TCC	2	6	1022980	1022985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639924
21575	NC_000919	GTA	2	6	1023073	1023078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639924
21576	NC_000919	CTGTG	2	10	1023205	1023214	0 %	40 %	40 %	20 %	15639924
21577	NC_000919	AGTC	2	8	1023238	1023245	25 %	25 %	25 %	25 %	15639924
21578	NC_000919	TCG	3	9	1023272	1023280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21579	NC_000919	CTT	2	6	1023309	1023314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21580	NC_000919	A	7	7	1023352	1023358	100 %	0 %	0 %	0 %	15639924
21581	NC_000919	CG	3	6	1023372	1023377	0 %	0 %	50 %	50 %	15639924
21582	NC_000919	GCA	2	6	1023389	1023394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21583	NC_000919	CCT	2	6	1023420	1023425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639924
21584	NC_000919	GGC	2	6	1023462	1023467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639924
21585	NC_000919	TGA	2	6	1023482	1023487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639924
21586	NC_000919	GCA	2	6	1023527	1023532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21587	NC_000919	AGC	2	6	1023590	1023595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21588	NC_000919	AGA	2	6	1023619	1023624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639924
21589	NC_000919	CGT	2	6	1023634	1023639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639924
21590	NC_000919	GCCT	2	8	1023667	1023674	0 %	25 %	25 %	50 %	15639924
21591	NC_000919	GGAG	2	8	1023766	1023773	25 %	0 %	75 %	0 %	15639924
21592	NC_000919	CCAT	2	8	1023836	1023843	25 %	25 %	0 %	50 %	15639924
21593	NC_000919	TTC	2	6	1023854	1023859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639924
21594	NC_000919	CT	4	8	1023877	1023884	0 %	50 %	0 %	50 %	15639924
21595	NC_000919	TAG	2	6	1023957	1023962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639925
21596	NC_000919	T	7	7	1024007	1024013	0 %	100 %	0 %	0 %	15639925
21597	NC_000919	A	6	6	1024015	1024020	100 %	0 %	0 %	0 %	15639925
21598	NC_000919	A	7	7	1024045	1024051	100 %	0 %	0 %	0 %	15639925
21599	NC_000919	CGA	2	6	1024117	1024122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21600	NC_000919	CCG	2	6	1024145	1024150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639926
21601	NC_000919	CG	4	8	1024272	1024279	0 %	0 %	50 %	50 %	15639926
21602	NC_000919	A	6	6	1024385	1024390	100 %	0 %	0 %	0 %	15639926
21603	NC_000919	CG	4	8	1024501	1024508	0 %	0 %	50 %	50 %	15639926
21604	NC_000919	CA	3	6	1024591	1024596	50 %	0 %	0 %	50 %	15639926
21605	NC_000919	CCT	2	6	1024625	1024630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639926
21606	NC_000919	TCC	2	6	1024688	1024693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21607	NC_000919	CGC	2	6	1024720	1024725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639927
21608	NC_000919	GCT	2	6	1024740	1024745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639927
21609	NC_000919	GGA	2	6	1024770	1024775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639927
21610	NC_000919	T	7	7	1024784	1024790	0 %	100 %	0 %	0 %	15639927
21611	NC_000919	CTG	2	6	1024867	1024872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639927
21612	NC_000919	CTT	2	6	1024935	1024940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639927
21613	NC_000919	TGC	3	9	1024997	1025005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639927
21614	NC_000919	ACC	2	6	1025009	1025014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639927
21615	NC_000919	GCT	2	6	1025037	1025042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639927
21616	NC_000919	GCA	2	6	1025046	1025051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639927
21617	NC_000919	GGA	2	6	1025175	1025180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639927
21618	NC_000919	TCA	2	6	1025225	1025230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639928
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21620	NC_000919	GCT	2	6	1025285	1025290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639928
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21983	NC_000919	TCT	2	6	1042355	1042360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21984	NC_000919	T	6	6	1042371	1042376	0 %	100 %	0 %	0 %	15639945
21985	NC_000919	CG	3	6	1042390	1042395	0 %	0 %	50 %	50 %	15639945
21986	NC_000919	CAA	2	6	1042449	1042454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639945
21987	NC_000919	CTGCA	2	10	1042459	1042468	20 %	20 %	20 %	40 %	15639945
21988	NC_000919	GCA	2	6	1042490	1042495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639945
21989	NC_000919	CTT	2	6	1042540	1042545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639945
21990	NC_000919	A	9	9	1042592	1042600	100 %	0 %	0 %	0 %	15639945
21991	NC_000919	CTAT	2	8	1042616	1042623	25 %	50 %	0 %	25 %	15639945
21992	NC_000919	TGAT	2	8	1042649	1042656	25 %	50 %	25 %	0 %	15639945
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