MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_000919	ATC	2	6	901532	901537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639820
19003	NC_000919	GCC	2	6	901538	901543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639820
19004	NC_000919	A	6	6	901581	901586	100 %	0 %	0 %	0 %	15639820
19005	NC_000919	GAAAG	2	10	901621	901630	60 %	0 %	40 %	0 %	15639820
19006	NC_000919	CCAA	2	8	901732	901739	50 %	0 %	0 %	50 %	15639820
19007	NC_000919	ATT	2	6	901745	901750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639820
19008	NC_000919	GAAA	2	8	901779	901786	75 %	0 %	25 %	0 %	15639820
19009	NC_000919	CG	3	6	901884	901889	0 %	0 %	50 %	50 %	15639820
19010	NC_000919	CA	3	6	901930	901935	50 %	0 %	0 %	50 %	15639820
19011	NC_000919	ACT	2	6	901979	901984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639820
19012	NC_000919	TAA	2	6	902068	902073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639820
19013	NC_000919	GAC	2	6	902247	902252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_000919	TC	3	6	902280	902285	0 %	50 %	0 %	50 %	15639821
19015	NC_000919	TGC	2	6	902362	902367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19016	NC_000919	CCA	2	6	902418	902423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639821
19017	NC_000919	GTT	2	6	902482	902487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639821
19018	NC_000919	T	6	6	902546	902551	0 %	100 %	0 %	0 %	15639821
19019	NC_000919	GCG	2	6	902757	902762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
19020	NC_000919	CG	3	6	902778	902783	0 %	0 %	50 %	50 %	15639821
19021	NC_000919	CCT	2	6	902795	902800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639821
19022	NC_000919	GC	3	6	902804	902809	0 %	0 %	50 %	50 %	15639821
19023	NC_000919	CGC	2	6	902812	902817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639821
19024	NC_000919	ACTG	2	8	902822	902829	25 %	25 %	25 %	25 %	15639821
19025	NC_000919	CATA	2	8	902868	902875	50 %	25 %	0 %	25 %	15639821
19026	NC_000919	CTG	2	6	902878	902883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19027	NC_000919	CA	3	6	903154	903159	50 %	0 %	0 %	50 %	15639821
19028	NC_000919	CCTG	2	8	903215	903222	0 %	25 %	25 %	50 %	15639821
19029	NC_000919	GCA	2	6	903228	903233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19030	NC_000919	GCG	2	6	903378	903383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
19031	NC_000919	TCC	2	6	903388	903393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639821
19032	NC_000919	AATCC	2	10	903427	903436	40 %	20 %	0 %	40 %	15639821
19033	NC_000919	TCA	2	6	903519	903524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639821
19034	NC_000919	GCA	2	6	903567	903572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19035	NC_000919	ATC	2	6	903599	903604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639821
19036	NC_000919	CAC	2	6	903685	903690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639821
19037	NC_000919	GAC	2	6	903718	903723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19038	NC_000919	CG	3	6	903744	903749	0 %	0 %	50 %	50 %	15639821
19039	NC_000919	GCG	2	6	903765	903770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
19040	NC_000919	TCT	2	6	903785	903790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639821
19041	NC_000919	GAT	2	6	903837	903842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639821
19042	NC_000919	GCG	2	6	903864	903869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
19043	NC_000919	CTGCGC	2	12	903900	903911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15639821
19044	NC_000919	CTA	2	6	903912	903917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639821
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19046	NC_000919	CACG	2	8	904089	904096	25 %	0 %	25 %	50 %	15639821
19047	NC_000919	GCA	3	9	904116	904124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19048	NC_000919	GCA	2	6	904130	904135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
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19050	NC_000919	T	6	6	904187	904192	0 %	100 %	0 %	0 %	15639821
19051	NC_000919	GCG	2	6	904266	904271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
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19053	NC_000919	GCA	2	6	904376	904381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
19054	NC_000919	GCA	2	6	904388	904393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639821
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19057	NC_000919	GCG	2	6	904428	904433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639821
19058	NC_000919	GCAC	2	8	904508	904515	25 %	0 %	25 %	50 %	15639821
19059	NC_000919	CCA	2	6	904704	904709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639821
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19062	NC_000919	CGT	2	6	904785	904790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639821
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19064	NC_000919	GAG	2	6	904923	904928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639821
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19067	NC_000919	ATGC	2	8	905017	905024	25 %	25 %	25 %	25 %	15639821
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19070	NC_000919	CTG	2	6	905178	905183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19072	NC_000919	CTG	3	9	905223	905231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639822
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19076	NC_000919	GTA	2	6	905330	905335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639822
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19085	NC_000919	GCAC	2	8	905809	905816	25 %	0 %	25 %	50 %	15639822
19086	NC_000919	A	6	6	905839	905844	100 %	0 %	0 %	0 %	15639822
19087	NC_000919	GCG	2	6	905849	905854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639822
19088	NC_000919	CG	3	6	905910	905915	0 %	0 %	50 %	50 %	15639822
19089	NC_000919	GCG	2	6	905956	905961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639822
19090	NC_000919	CTA	2	6	906017	906022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639822
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19092	NC_000919	TCC	2	6	906088	906093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19093	NC_000919	ACC	2	6	906114	906119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19094	NC_000919	AGA	2	6	906149	906154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_000919	TGC	2	6	906166	906171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19099	NC_000919	TGCG	2	8	906370	906377	0 %	25 %	50 %	25 %	15639823
19100	NC_000919	GGT	2	6	906398	906403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639823
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19102	NC_000919	GAC	2	6	906477	906482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
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19104	NC_000919	CA	3	6	906672	906677	50 %	0 %	0 %	50 %	15639823
19105	NC_000919	GAA	2	6	906756	906761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639823
19106	NC_000919	CAG	2	6	906816	906821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
19107	NC_000919	A	6	6	907012	907017	100 %	0 %	0 %	0 %	15639823
19108	NC_000919	CCT	2	6	907190	907195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639823
19109	NC_000919	AGC	2	6	907264	907269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
19110	NC_000919	GAC	2	6	907278	907283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
19111	NC_000919	AGC	2	6	907328	907333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
19112	NC_000919	GCAC	2	8	907349	907356	25 %	0 %	25 %	50 %	15639823
19113	NC_000919	CAAC	2	8	907499	907506	50 %	0 %	0 %	50 %	15639823
19114	NC_000919	C	6	6	907595	907600	0 %	0 %	0 %	100 %	15639823
19115	NC_000919	GCAG	2	8	907616	907623	25 %	0 %	50 %	25 %	15639823
19116	NC_000919	GCA	2	6	907661	907666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639823
19117	NC_000919	GCAG	2	8	907703	907710	25 %	0 %	50 %	25 %	15639823
19118	NC_000919	GC	4	8	907799	907806	0 %	0 %	50 %	50 %	15639823
19119	NC_000919	CG	4	8	907894	907901	0 %	0 %	50 %	50 %	15639823
19120	NC_000919	GCT	2	6	907973	907978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19121	NC_000919	CCG	2	6	907987	907992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19122	NC_000919	GC	4	8	908000	908007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19123	NC_000919	CAT	2	6	908049	908054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639824
19124	NC_000919	CGAT	2	8	908056	908063	25 %	25 %	25 %	25 %	15639824
19125	NC_000919	CG	3	6	908069	908074	0 %	0 %	50 %	50 %	15639824
19126	NC_000919	TAAA	2	8	908132	908139	75 %	25 %	0 %	0 %	15639824
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19128	NC_000919	CGTA	2	8	908347	908354	25 %	25 %	25 %	25 %	15639824
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19247	NC_000919	CA	4	8	914668	914675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19499	NC_000919	CTT	2	6	926794	926799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639840
19500	NC_000919	GTT	2	6	926856	926861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639840

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