MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_000919	AAT	2	6	829450	829455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639752
17503	NC_000919	A	6	6	829552	829557	100 %	0 %	0 %	0 %	15639752
17504	NC_000919	GCAA	2	8	829589	829596	50 %	0 %	25 %	25 %	15639752
17505	NC_000919	GACC	2	8	829617	829624	25 %	0 %	25 %	50 %	15639752
17506	NC_000919	C	6	6	829648	829653	0 %	0 %	0 %	100 %	15639752
17507	NC_000919	ACT	2	6	829691	829696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639752
17508	NC_000919	CTT	2	6	829707	829712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639752
17509	NC_000919	GTG	2	6	829748	829753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639752
17510	NC_000919	CTT	2	6	829761	829766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639752
17511	NC_000919	CCG	2	6	829770	829775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639752
17512	NC_000919	GC	3	6	829780	829785	0 %	0 %	50 %	50 %	15639752
17513	NC_000919	A	6	6	829861	829866	100 %	0 %	0 %	0 %	15639752
17514	NC_000919	AGC	2	6	829874	829879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639752
17515	NC_000919	CG	3	6	829920	829925	0 %	0 %	50 %	50 %	15639752
17516	NC_000919	ACC	2	6	829940	829945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639752
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17518	NC_000919	AG	3	6	830020	830025	50 %	0 %	50 %	0 %	15639752
17519	NC_000919	GC	3	6	830056	830061	0 %	0 %	50 %	50 %	15639752
17520	NC_000919	ACA	2	6	830093	830098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639752
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17523	NC_000919	CGAG	2	8	830220	830227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17524	NC_000919	GAC	2	6	830267	830272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17525	NC_000919	G	6	6	830292	830297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_000919	A	6	6	830305	830310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_000919	GAA	2	6	830324	830329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_000919	GC	3	6	830384	830389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17529	NC_000919	AAG	2	6	830416	830421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_000919	TG	3	6	830439	830444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_000919	TGC	2	6	830494	830499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17532	NC_000919	A	7	7	830500	830506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_000919	CG	4	8	830511	830518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_000919	GC	3	6	830537	830542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17535	NC_000919	ACCT	2	8	830568	830575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17536	NC_000919	CGC	2	6	830613	830618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639753
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17539	NC_000919	CGA	2	6	830796	830801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639753
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17542	NC_000919	CTCC	2	8	830875	830882	0 %	25 %	0 %	75 %	15639753
17543	NC_000919	GCCC	2	8	830888	830895	0 %	0 %	25 %	75 %	15639753
17544	NC_000919	TTC	3	9	830910	830918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639753
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17547	NC_000919	CT	3	6	831149	831154	0 %	50 %	0 %	50 %	15639753
17548	NC_000919	GCA	2	6	831168	831173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639753
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17553	NC_000919	GATT	2	8	831267	831274	25 %	50 %	25 %	0 %	15639753
17554	NC_000919	CTCA	2	8	831372	831379	25 %	25 %	0 %	50 %	15639753
17555	NC_000919	GCG	2	6	831389	831394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639753
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17557	NC_000919	AGG	2	6	831427	831432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639753
17558	NC_000919	GC	3	6	831490	831495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17559	NC_000919	GGCG	2	8	831526	831533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17560	NC_000919	CTG	2	6	831576	831581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17561	NC_000919	GC	3	6	831623	831628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17562	NC_000919	GAA	2	6	831640	831645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_000919	GC	3	6	831695	831700	0 %	0 %	50 %	50 %	15639754
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17578	NC_000919	TGTT	2	8	832847	832854	0 %	75 %	25 %	0 %	15639754
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17581	NC_000919	CGG	2	6	833145	833150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639754
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17589	NC_000919	GCG	2	6	833517	833522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639754
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17594	NC_000919	GAG	2	6	833852	833857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17604	NC_000919	TAC	2	6	834407	834412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639755
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17611	NC_000919	GCAG	2	8	834789	834796	25 %	0 %	50 %	25 %	15639755
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17617	NC_000919	GC	3	6	835146	835151	0 %	0 %	50 %	50 %	15639756
17618	NC_000919	GC	3	6	835179	835184	0 %	0 %	50 %	50 %	15639756
17619	NC_000919	ATCG	2	8	835215	835222	25 %	25 %	25 %	25 %	15639756
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