MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17003	NC_000919	CGCT	2	8	805041	805048	0 %	25 %	25 %	50 %	15639726
17004	NC_000919	CG	3	6	805127	805132	0 %	0 %	50 %	50 %	15639726
17005	NC_000919	ATA	2	6	805145	805150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639726
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17010	NC_000919	GAG	2	6	805301	805306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639726
17011	NC_000919	A	7	7	805308	805314	100 %	0 %	0 %	0 %	15639726
17012	NC_000919	TCG	2	6	805364	805369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639726
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17014	NC_000919	CA	3	6	805504	805509	50 %	0 %	0 %	50 %	15639727
17015	NC_000919	CACT	2	8	805517	805524	25 %	25 %	0 %	50 %	15639727
17016	NC_000919	GCA	2	6	805531	805536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639727
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17022	NC_000919	GC	3	6	805732	805737	0 %	0 %	50 %	50 %	15639727
17023	NC_000919	CGCA	2	8	805790	805797	25 %	0 %	25 %	50 %	15639727
17024	NC_000919	GCA	3	9	805795	805803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639727
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17031	NC_000919	GAA	2	6	806077	806082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_000919	AAG	2	6	806099	806104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_000919	CG	3	6	806132	806137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17034	NC_000919	ATA	2	6	806138	806143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17056	NC_000919	CG	3	6	807301	807306	0 %	0 %	50 %	50 %	15639729
17057	NC_000919	A	7	7	807312	807318	100 %	0 %	0 %	0 %	15639729
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17104	NC_000919	CCTT	2	8	809090	809097	0 %	50 %	0 %	50 %	15639733
17105	NC_000919	CA	3	6	809229	809234	50 %	0 %	0 %	50 %	15639733
17106	NC_000919	CG	3	6	809301	809306	0 %	0 %	50 %	50 %	15639733
17107	NC_000919	GC	3	6	809446	809451	0 %	0 %	50 %	50 %	15639733
17108	NC_000919	GCAG	2	8	809477	809484	25 %	0 %	50 %	25 %	15639733
17109	NC_000919	CACC	2	8	809496	809503	25 %	0 %	0 %	75 %	15639733
17110	NC_000919	CCT	2	6	809514	809519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639733
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17113	NC_000919	CTC	2	6	809809	809814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639733
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17116	NC_000919	TCT	2	6	810059	810064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639733
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17122	NC_000919	CAA	2	6	810396	810401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639733
17123	NC_000919	C	7	7	810421	810427	0 %	0 %	0 %	100 %	15639733
17124	NC_000919	AGAA	2	8	810433	810440	75 %	0 %	25 %	0 %	15639733
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17486	NC_000919	CG	3	6	828600	828605	0 %	0 %	50 %	50 %	15639752
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17498	NC_000919	AGC	2	6	829309	829314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639752
17499	NC_000919	GGT	2	6	829330	829335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639752
17500	NC_000919	CCAT	2	8	829346	829353	25 %	25 %	0 %	50 %	15639752

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