MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_000919	GCA	2	6	707764	707769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15002	NC_000919	AC	3	6	707865	707870	50 %	0 %	0 %	50 %	15639633
15003	NC_000919	CAC	3	9	707868	707876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639633
15004	NC_000919	TACA	2	8	707895	707902	50 %	25 %	0 %	25 %	15639633
15005	NC_000919	CTG	2	6	707940	707945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15006	NC_000919	GCAT	2	8	707953	707960	25 %	25 %	25 %	25 %	15639633
15007	NC_000919	TCCT	2	8	707967	707974	0 %	50 %	0 %	50 %	15639633
15008	NC_000919	TTC	2	6	708012	708017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639633
15009	NC_000919	TGC	2	6	708025	708030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15010	NC_000919	CTA	2	6	708053	708058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639633
15011	NC_000919	GCACG	2	10	708116	708125	20 %	0 %	40 %	40 %	15639633
15012	NC_000919	GTA	2	6	708130	708135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639633
15013	NC_000919	TGC	2	6	708138	708143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15014	NC_000919	GAG	2	6	708167	708172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639633
15015	NC_000919	GCA	2	6	708250	708255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15016	NC_000919	A	6	6	708448	708453	100 %	0 %	0 %	0 %	15639633
15017	NC_000919	A	6	6	708456	708461	100 %	0 %	0 %	0 %	15639633
15018	NC_000919	AGC	2	6	708587	708592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639633
15019	NC_000919	CTT	2	6	708649	708654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639634
15020	NC_000919	GCGCC	2	10	708685	708694	0 %	0 %	40 %	60 %	15639634
15021	NC_000919	ACC	2	6	708739	708744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639634
15022	NC_000919	CA	3	6	708810	708815	50 %	0 %	0 %	50 %	15639634
15023	NC_000919	CCA	2	6	708819	708824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639634
15024	NC_000919	GCA	2	6	708977	708982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639634
15025	NC_000919	CTA	2	6	709092	709097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639634
15026	NC_000919	GATA	2	8	709122	709129	50 %	25 %	25 %	0 %	15639634
15027	NC_000919	CA	3	6	709164	709169	50 %	0 %	0 %	50 %	15639634
15028	NC_000919	CAAAC	2	10	709234	709243	60 %	0 %	0 %	40 %	15639634
15029	NC_000919	AGC	2	6	709262	709267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639634
15030	NC_000919	ATA	2	6	709285	709290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639634
15031	NC_000919	GC	3	6	709345	709350	0 %	0 %	50 %	50 %	15639634
15032	NC_000919	CGCT	2	8	709517	709524	0 %	25 %	25 %	50 %	15639634
15033	NC_000919	AC	3	6	709562	709567	50 %	0 %	0 %	50 %	15639634
15034	NC_000919	TGCA	2	8	709699	709706	25 %	25 %	25 %	25 %	15639634
15035	NC_000919	TC	3	6	709746	709751	0 %	50 %	0 %	50 %	15639634
15036	NC_000919	TAA	2	6	709752	709757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639634
15037	NC_000919	CTTA	2	8	709787	709794	25 %	50 %	0 %	25 %	15639634
15038	NC_000919	TGC	2	6	709831	709836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_000919	AAC	2	6	709848	709853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_000919	GTA	2	6	709955	709960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639635
15041	NC_000919	CTT	2	6	710059	710064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639635
15042	NC_000919	GA	3	6	710099	710104	50 %	0 %	50 %	0 %	15639635
15043	NC_000919	ATCA	2	8	710138	710145	50 %	25 %	0 %	25 %	15639635
15044	NC_000919	AC	3	6	710224	710229	50 %	0 %	0 %	50 %	15639635
15045	NC_000919	GT	3	6	710268	710273	0 %	50 %	50 %	0 %	15639635
15046	NC_000919	ACGC	2	8	710309	710316	25 %	0 %	25 %	50 %	15639635
15047	NC_000919	TGA	2	6	710344	710349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639635
15048	NC_000919	ATC	2	6	710360	710365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639635
15049	NC_000919	CG	3	6	710412	710417	0 %	0 %	50 %	50 %	15639635
15050	NC_000919	AGAA	2	8	710475	710482	75 %	0 %	25 %	0 %	15639635
15051	NC_000919	ATGCA	2	10	710498	710507	40 %	20 %	20 %	20 %	15639635
15052	NC_000919	CAGGAT	2	12	710512	710523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15639635
15053	NC_000919	A	6	6	710527	710532	100 %	0 %	0 %	0 %	15639635
15054	NC_000919	TCT	2	6	710608	710613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639635
15055	NC_000919	CAT	2	6	710629	710634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639635
15056	NC_000919	AGC	2	6	710738	710743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15057	NC_000919	CGT	2	6	710746	710751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15058	NC_000919	GC	3	6	710769	710774	0 %	0 %	50 %	50 %	15639635
15059	NC_000919	CG	3	6	710811	710816	0 %	0 %	50 %	50 %	15639635
15060	NC_000919	TCT	2	6	710898	710903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639635
15061	NC_000919	CG	3	6	711068	711073	0 %	0 %	50 %	50 %	15639635
15062	NC_000919	CGCGC	2	10	711080	711089	0 %	0 %	40 %	60 %	15639635
15063	NC_000919	CTG	2	6	711100	711105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15064	NC_000919	AAG	2	6	711107	711112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639635
15065	NC_000919	A	7	7	711212	711218	100 %	0 %	0 %	0 %	15639635
15066	NC_000919	ACGT	2	8	711261	711268	25 %	25 %	25 %	25 %	15639635
15067	NC_000919	ACA	2	6	711316	711321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639635
15068	NC_000919	GCT	2	6	711354	711359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15069	NC_000919	CCAAA	2	10	711412	711421	60 %	0 %	0 %	40 %	15639635
15070	NC_000919	GC	3	6	711446	711451	0 %	0 %	50 %	50 %	15639635
15071	NC_000919	AAG	2	6	711640	711645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639635
15072	NC_000919	T	9	9	711648	711656	0 %	100 %	0 %	0 %	15639635
15073	NC_000919	CTT	2	6	711661	711666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639635
15074	NC_000919	AGC	2	6	711680	711685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15075	NC_000919	TCC	2	6	711693	711698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639635
15076	NC_000919	TTC	2	6	711712	711717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639635
15077	NC_000919	TGC	2	6	711757	711762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15078	NC_000919	CAG	2	6	711785	711790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639635
15079	NC_000919	ATA	2	6	711910	711915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639636
15080	NC_000919	TCC	2	6	712099	712104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639636
15081	NC_000919	CAA	2	6	712136	712141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639636
15082	NC_000919	AAT	2	6	712149	712154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639636
15083	NC_000919	CGC	2	6	712181	712186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639636
15084	NC_000919	AGA	2	6	712240	712245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639636
15085	NC_000919	AAG	2	6	712273	712278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639636
15086	NC_000919	GCA	2	6	712286	712291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639636
15087	NC_000919	CCT	2	6	712307	712312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639636
15088	NC_000919	TTA	2	6	712331	712336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639636
15089	NC_000919	CACC	2	8	712355	712362	25 %	0 %	0 %	75 %	15639636
15090	NC_000919	ATC	2	6	712480	712485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639636
15091	NC_000919	TTCA	2	8	712545	712552	25 %	50 %	0 %	25 %	15639636
15092	NC_000919	GAT	2	6	712623	712628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639636
15093	NC_000919	TGC	2	6	712641	712646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639636
15094	NC_000919	TGA	2	6	712807	712812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639637
15095	NC_000919	A	7	7	712829	712835	100 %	0 %	0 %	0 %	15639637
15096	NC_000919	GCA	2	6	712946	712951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639637
15097	NC_000919	CA	4	8	712999	713006	50 %	0 %	0 %	50 %	15639637
15098	NC_000919	AGG	2	6	713030	713035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639637
15099	NC_000919	GCT	3	9	713124	713132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639638
15100	NC_000919	GTA	2	6	713173	713178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639638
15101	NC_000919	GAC	2	6	713209	713214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639638
15102	NC_000919	TCT	2	6	713265	713270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639638
15103	NC_000919	TCG	2	6	713310	713315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639638
15104	NC_000919	AGCA	2	8	713353	713360	50 %	0 %	25 %	25 %	15639638
15105	NC_000919	CAC	2	6	713362	713367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639638
15106	NC_000919	GAG	2	6	713385	713390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639638
15107	NC_000919	TAA	2	6	713463	713468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639638
15108	NC_000919	CCT	2	6	713505	713510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639638
15109	NC_000919	ATA	2	6	713665	713670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639638
15110	NC_000919	CAT	2	6	713740	713745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639638
15111	NC_000919	GTAC	2	8	713755	713762	25 %	25 %	25 %	25 %	15639638
15112	NC_000919	AGC	2	6	713774	713779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639638
15113	NC_000919	T	7	7	713781	713787	0 %	100 %	0 %	0 %	15639638
15114	NC_000919	AGG	2	6	713921	713926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639638
15115	NC_000919	AGC	2	6	713971	713976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639638
15116	NC_000919	AG	3	6	714070	714075	50 %	0 %	50 %	0 %	15639638
15117	NC_000919	GAAA	2	8	714254	714261	75 %	0 %	25 %	0 %	15639638
15118	NC_000919	AGG	2	6	714325	714330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639638
15119	NC_000919	AAG	2	6	714356	714361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639638
15120	NC_000919	GACA	2	8	714418	714425	50 %	0 %	25 %	25 %	15639638
15121	NC_000919	GCC	2	6	714629	714634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639638
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15123	NC_000919	TGA	2	6	714696	714701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639638
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15373	NC_000919	TCC	2	6	727125	727130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639652
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15420	NC_000919	ATG	2	6	729250	729255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639654
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15422	NC_000919	CGGTA	2	10	729402	729411	20 %	20 %	40 %	20 %	15639654
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15424	NC_000919	TGGCA	2	10	729575	729584	20 %	20 %	40 %	20 %	15639654
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15426	NC_000919	CG	3	6	729654	729659	0 %	0 %	50 %	50 %	15639654
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15429	NC_000919	AC	3	6	729788	729793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15432	NC_000919	CGA	2	6	729906	729911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15435	NC_000919	CG	3	6	730042	730047	0 %	0 %	50 %	50 %	15639655
15436	NC_000919	AC	3	6	730063	730068	50 %	0 %	0 %	50 %	15639655
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15439	NC_000919	CAGCAA	2	12	730260	730271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15639655
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15477	NC_000919	TATTT	2	10	732114	732123	20 %	80 %	0 %	0 %	15639656
15478	NC_000919	AT	3	6	732147	732152	50 %	50 %	0 %	0 %	15639656
15479	NC_000919	AATG	2	8	732158	732165	50 %	25 %	25 %	0 %	15639656
15480	NC_000919	TCC	2	6	732207	732212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639656
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