MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000919	CGC	2	6	50641	50646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639037
1002	NC_000919	GAA	2	6	50702	50707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639037
1003	NC_000919	GCGCA	2	10	50730	50739	20 %	0 %	40 %	40 %	15639037
1004	NC_000919	CA	3	6	50775	50780	50 %	0 %	0 %	50 %	15639037
1005	NC_000919	GCAG	2	8	50840	50847	25 %	0 %	50 %	25 %	15639037
1006	NC_000919	GCA	2	6	50866	50871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1007	NC_000919	CTA	2	6	50920	50925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639037
1008	NC_000919	GTT	2	6	50939	50944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639037
1009	NC_000919	TGC	2	6	50995	51000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1010	NC_000919	GA	3	6	51095	51100	50 %	0 %	50 %	0 %	15639037
1011	NC_000919	TTG	3	9	51107	51115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639037
1012	NC_000919	TC	3	6	51157	51162	0 %	50 %	0 %	50 %	15639037
1013	NC_000919	AGC	2	6	51175	51180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1014	NC_000919	GCG	2	6	51308	51313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639037
1015	NC_000919	AAG	2	6	51341	51346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639037
1016	NC_000919	GGC	2	6	51390	51395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639037
1017	NC_000919	TTCT	2	8	51454	51461	0 %	75 %	0 %	25 %	15639037
1018	NC_000919	TTG	2	6	51471	51476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639037
1019	NC_000919	CAC	2	6	51483	51488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639037
1020	NC_000919	GCA	2	6	51550	51555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1021	NC_000919	CG	4	8	51619	51626	0 %	0 %	50 %	50 %	15639037
1022	NC_000919	AGA	2	6	51661	51666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639037
1023	NC_000919	GC	3	6	51671	51676	0 %	0 %	50 %	50 %	15639037
1024	NC_000919	TTC	2	6	51709	51714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639037
1025	NC_000919	TGC	2	6	51733	51738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1026	NC_000919	CA	3	6	51939	51944	50 %	0 %	0 %	50 %	15639037
1027	NC_000919	GC	3	6	52007	52012	0 %	0 %	50 %	50 %	15639037
1028	NC_000919	GAG	2	6	52094	52099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639037
1029	NC_000919	CTG	2	6	52103	52108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1030	NC_000919	TC	3	6	52152	52157	0 %	50 %	0 %	50 %	15639037
1031	NC_000919	GGGC	2	8	52158	52165	0 %	0 %	75 %	25 %	15639037
1032	NC_000919	TGA	2	6	52185	52190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639037
1033	NC_000919	TCG	2	6	52297	52302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639037
1034	NC_000919	CG	3	6	52353	52358	0 %	0 %	50 %	50 %	15639037
1035	NC_000919	A	6	6	52370	52375	100 %	0 %	0 %	0 %	15639037
1036	NC_000919	GAT	2	6	52394	52399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639037
1037	NC_000919	GGA	2	6	52443	52448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639037
1038	NC_000919	TAT	2	6	52484	52489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639037
1039	NC_000919	TGT	2	6	52507	52512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639037
1040	NC_000919	GT	3	6	52511	52516	0 %	50 %	50 %	0 %	15639037
1041	NC_000919	TCT	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_000919	TCG	3	9	52620	52628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639038
1043	NC_000919	GTG	2	6	52629	52634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639038
1044	NC_000919	GCG	2	6	52652	52657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639038
1045	NC_000919	TCA	2	6	52692	52697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639038
1046	NC_000919	GGA	2	6	52745	52750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639038
1047	NC_000919	CGG	2	6	52789	52794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639038
1048	NC_000919	ATGC	2	8	52815	52822	25 %	25 %	25 %	25 %	15639038
1049	NC_000919	CAA	2	6	52843	52848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639038
1050	NC_000919	TGCAG	2	10	52861	52870	20 %	20 %	40 %	20 %	15639038
1051	NC_000919	GCA	2	6	52936	52941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639038
1052	NC_000919	TG	3	6	52975	52980	0 %	50 %	50 %	0 %	15639038
1053	NC_000919	GGT	2	6	53068	53073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639038
1054	NC_000919	GT	3	6	53103	53108	0 %	50 %	50 %	0 %	15639038
1055	NC_000919	A	6	6	53182	53187	100 %	0 %	0 %	0 %	15639038
1056	NC_000919	CG	4	8	53224	53231	0 %	0 %	50 %	50 %	15639038
1057	NC_000919	TAC	2	6	53232	53237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639038
1058	NC_000919	AAG	2	6	53271	53276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639038
1059	NC_000919	AATC	2	8	53317	53324	50 %	25 %	0 %	25 %	15639038
1060	NC_000919	ATTA	2	8	53345	53352	50 %	50 %	0 %	0 %	15639038
1061	NC_000919	GA	3	6	53360	53365	50 %	0 %	50 %	0 %	15639038
1062	NC_000919	TA	4	8	53535	53542	50 %	50 %	0 %	0 %	15639038
1063	NC_000919	CG	3	6	53612	53617	0 %	0 %	50 %	50 %	15639038
1064	NC_000919	TTA	2	6	53619	53624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639038
1065	NC_000919	CAAA	2	8	53687	53694	75 %	0 %	0 %	25 %	15639038
1066	NC_000919	GAA	2	6	53747	53752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639038
1067	NC_000919	TAT	2	6	53767	53772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639038
1068	NC_000919	CGCTG	2	10	53785	53794	0 %	20 %	40 %	40 %	15639038
1069	NC_000919	CG	3	6	53797	53802	0 %	0 %	50 %	50 %	15639038
1070	NC_000919	ATC	2	6	53826	53831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639038
1071	NC_000919	CGA	2	6	53848	53853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639038
1072	NC_000919	AT	3	6	53857	53862	50 %	50 %	0 %	0 %	15639038
1073	NC_000919	GAT	2	6	53876	53881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639038
1074	NC_000919	CG	3	6	53923	53928	0 %	0 %	50 %	50 %	15639038
1075	NC_000919	AGA	2	6	54006	54011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639038
1076	NC_000919	CTG	2	6	54015	54020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639038
1077	NC_000919	A	7	7	54033	54039	100 %	0 %	0 %	0 %	15639038
1078	NC_000919	CAA	2	6	54079	54084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639038
1079	NC_000919	GCTAC	2	10	54149	54158	20 %	20 %	20 %	40 %	15639038
1080	NC_000919	TCGCT	2	10	54186	54195	0 %	40 %	20 %	40 %	15639038
1081	NC_000919	GGAA	2	8	54310	54317	50 %	0 %	50 %	0 %	15639038
1082	NC_000919	CG	3	6	54343	54348	0 %	0 %	50 %	50 %	15639038
1083	NC_000919	TC	3	6	54358	54363	0 %	50 %	0 %	50 %	15639038
1084	NC_000919	AGC	2	6	54480	54485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639038
1085	NC_000919	AGA	2	6	54498	54503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_000919	CAGG	2	8	54514	54521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_000919	GTAC	2	8	54527	54534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_000919	A	6	6	54627	54632	100 %	0 %	0 %	0 %	15639039
1089	NC_000919	CATC	2	8	54671	54678	25 %	25 %	0 %	50 %	15639039
1090	NC_000919	T	8	8	54680	54687	0 %	100 %	0 %	0 %	15639039
1091	NC_000919	TTTC	2	8	54760	54767	0 %	75 %	0 %	25 %	15639039
1092	NC_000919	CTTT	2	8	54890	54897	0 %	75 %	0 %	25 %	15639039
1093	NC_000919	T	6	6	54895	54900	0 %	100 %	0 %	0 %	15639039
1094	NC_000919	CAT	2	6	55002	55007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639039
1095	NC_000919	TTC	2	6	55137	55142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639039
1096	NC_000919	ACG	2	6	55183	55188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639039
1097	NC_000919	AAT	2	6	55278	55283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639039
1098	NC_000919	TCG	2	6	55294	55299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639039
1099	NC_000919	ACT	2	6	55333	55338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639039
1100	NC_000919	TCGT	2	8	55356	55363	0 %	50 %	25 %	25 %	15639039
1101	NC_000919	ATA	2	6	55416	55421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639039
1102	NC_000919	ATGCT	2	10	55477	55486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_000919	A	6	6	55529	55534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_000919	AGG	2	6	55577	55582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_000919	GT	3	6	55620	55625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_000919	ACG	2	6	55631	55636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_000919	CAG	2	6	55650	55655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_000919	CAC	2	6	55691	55696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_000919	AC	3	6	55720	55725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_000919	GTG	2	6	55739	55744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_000919	CA	3	6	55775	55780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_000919	GT	3	6	55787	55792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_000919	ACA	2	6	55816	55821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639040
1114	NC_000919	CAT	2	6	55843	55848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639040
1115	NC_000919	ATA	2	6	55863	55868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639040
1116	NC_000919	T	7	7	55871	55877	0 %	100 %	0 %	0 %	15639040
1117	NC_000919	CTG	2	6	55910	55915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639040
1118	NC_000919	CAA	2	6	55925	55930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639040
1119	NC_000919	GC	4	8	55935	55942	0 %	0 %	50 %	50 %	15639040
1120	NC_000919	GCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639040
1121	NC_000919	CTA	2	6	55962	55967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639040
1122	NC_000919	CTT	2	6	55974	55979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639040
1123	NC_000919	CTAA	2	8	56036	56043	50 %	25 %	0 %	25 %	15639040
1124	NC_000919	CTT	2	6	56094	56099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639040
1125	NC_000919	GCA	2	6	56174	56179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639040
1126	NC_000919	TATG	2	8	56193	56200	25 %	50 %	25 %	0 %	15639040
1127	NC_000919	TCCT	2	8	56410	56417	0 %	50 %	0 %	50 %	15639040
1128	NC_000919	GCG	2	6	56430	56435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639040
1129	NC_000919	TCC	2	6	56551	56556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639041
1130	NC_000919	GTG	2	6	56710	56715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639041
1131	NC_000919	GCG	2	6	56767	56772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639041
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1247	NC_000919	TTC	2	6	62607	62612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639047
1248	NC_000919	GTT	2	6	62625	62630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639047
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1252	NC_000919	CAT	2	6	62787	62792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639047
1253	NC_000919	CCT	3	9	62800	62808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_000919	GTA	2	6	62824	62829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_000919	GCG	2	6	62857	62862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_000919	TGTC	2	8	62873	62880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1257	NC_000919	TG	3	6	62898	62903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_000919	CCT	2	6	63014	63019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639048
1259	NC_000919	GCG	2	6	63022	63027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639048
1260	NC_000919	CT	3	6	63034	63039	0 %	50 %	0 %	50 %	15639048
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1262	NC_000919	T	6	6	63107	63112	0 %	100 %	0 %	0 %	15639048
1263	NC_000919	TGCG	2	8	63120	63127	0 %	25 %	50 %	25 %	15639048
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1265	NC_000919	TGC	2	6	63157	63162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639048
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