MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13503	NC_000919	GC	3	6	638425	638430	0 %	0 %	50 %	50 %	15639574
13504	NC_000919	AAAC	2	8	638480	638487	75 %	0 %	0 %	25 %	15639574
13505	NC_000919	CTG	2	6	638511	638516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639574
13506	NC_000919	GGT	2	6	638608	638613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639574
13507	NC_000919	CGT	2	6	638732	638737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639574
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13509	NC_000919	ACG	2	6	638774	638779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639574
13510	NC_000919	GTC	2	6	638875	638880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639574
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13513	NC_000919	GGC	2	6	639036	639041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639574
13514	NC_000919	GCC	2	6	639075	639080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639574
13515	NC_000919	GCAC	2	8	639090	639097	25 %	0 %	25 %	50 %	15639574
13516	NC_000919	GCA	2	6	639110	639115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639574
13517	NC_000919	CGA	2	6	639162	639167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639574
13518	NC_000919	TCAG	2	8	639197	639204	25 %	25 %	25 %	25 %	15639574
13519	NC_000919	ATG	2	6	639205	639210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639574
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13588	NC_000919	GTC	2	6	642184	642189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13591	NC_000919	CA	3	6	642299	642304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13595	NC_000919	GCC	2	6	642545	642550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13596	NC_000919	A	6	6	642551	642556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_000919	CAC	2	6	642569	642574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13598	NC_000919	T	8	8	642589	642596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13601	NC_000919	TCG	2	6	642718	642723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13607	NC_000919	AGA	2	6	643039	643044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639580
13608	NC_000919	ACG	2	6	643104	643109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639580
13609	NC_000919	T	6	6	643111	643116	0 %	100 %	0 %	0 %	15639580
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13611	NC_000919	TCA	2	6	643215	643220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639580
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13621	NC_000919	GCAC	2	8	643778	643785	25 %	0 %	25 %	50 %	15639580
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13998	NC_000919	CTG	2	6	660017	660022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639597
13999	NC_000919	AGA	2	6	660038	660043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639597
14000	NC_000919	TGCG	2	8	660065	660072	0 %	25 %	50 %	25 %	15639597

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