MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_000919	A	6	6	613888	613893	100 %	0 %	0 %	0 %	15639554
13002	NC_000919	A	6	6	614066	614071	100 %	0 %	0 %	0 %	15639554
13003	NC_000919	TTA	2	6	614101	614106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639554
13004	NC_000919	TGT	2	6	614148	614153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639554
13005	NC_000919	CAT	2	6	614154	614159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639554
13006	NC_000919	TAA	2	6	614180	614185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639554
13007	NC_000919	AAAGAA	2	12	614227	614238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15639555
13008	NC_000919	CGC	2	6	614239	614244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639555
13009	NC_000919	AGCA	2	8	614280	614287	50 %	0 %	25 %	25 %	15639555
13010	NC_000919	CG	4	8	614290	614297	0 %	0 %	50 %	50 %	15639555
13011	NC_000919	AC	3	6	614324	614329	50 %	0 %	0 %	50 %	15639555
13012	NC_000919	CA	3	6	614334	614339	50 %	0 %	0 %	50 %	15639555
13013	NC_000919	ACT	2	6	614533	614538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639555
13014	NC_000919	T	6	6	614571	614576	0 %	100 %	0 %	0 %	15639555
13015	NC_000919	A	8	8	614677	614684	100 %	0 %	0 %	0 %	15639555
13016	NC_000919	CA	3	6	614688	614693	50 %	0 %	0 %	50 %	15639555
13017	NC_000919	AAATAC	2	12	614732	614743	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15639555
13018	NC_000919	ACTG	2	8	614795	614802	25 %	25 %	25 %	25 %	15639555
13019	NC_000919	TGA	2	6	614916	614921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639555
13020	NC_000919	GGAA	2	8	614953	614960	50 %	0 %	50 %	0 %	15639555
13021	NC_000919	AGAA	2	8	614989	614996	75 %	0 %	25 %	0 %	15639555
13022	NC_000919	ACC	2	6	615041	615046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639555
13023	NC_000919	GC	3	6	615089	615094	0 %	0 %	50 %	50 %	15639555
13024	NC_000919	A	7	7	615115	615121	100 %	0 %	0 %	0 %	15639555
13025	NC_000919	A	7	7	615160	615166	100 %	0 %	0 %	0 %	15639555
13026	NC_000919	CT	3	6	615196	615201	0 %	50 %	0 %	50 %	15639555
13027	NC_000919	AT	3	6	615282	615287	50 %	50 %	0 %	0 %	15639555
13028	NC_000919	TG	3	6	615313	615318	0 %	50 %	50 %	0 %	15639555
13029	NC_000919	GCAC	2	8	615344	615351	25 %	0 %	25 %	50 %	15639555
13030	NC_000919	AAAAG	2	10	615387	615396	80 %	0 %	20 %	0 %	15639555
13031	NC_000919	CAA	2	6	615403	615408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639555
13032	NC_000919	AGC	2	6	615557	615562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639555
13033	NC_000919	A	8	8	615610	615617	100 %	0 %	0 %	0 %	15639555
13034	NC_000919	AGC	2	6	615628	615633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639555
13035	NC_000919	GA	3	6	615643	615648	50 %	0 %	50 %	0 %	15639555
13036	NC_000919	A	7	7	615648	615654	100 %	0 %	0 %	0 %	15639555
13037	NC_000919	CAG	2	6	615700	615705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_000919	AGG	2	6	615746	615751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639556
13039	NC_000919	AG	3	6	615777	615782	50 %	0 %	50 %	0 %	15639556
13040	NC_000919	CCA	2	6	615811	615816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639556
13041	NC_000919	ATC	2	6	615842	615847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639556
13042	NC_000919	CAG	2	6	615854	615859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639556
13043	NC_000919	CAA	2	6	615943	615948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639556
13044	NC_000919	GC	4	8	615979	615986	0 %	0 %	50 %	50 %	15639556
13045	NC_000919	TCCTTT	2	12	616023	616034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639556
13046	NC_000919	CAG	2	6	616129	616134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639556
13047	NC_000919	CTCC	2	8	616144	616151	0 %	25 %	0 %	75 %	15639556
13048	NC_000919	AAT	2	6	616216	616221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639556
13049	NC_000919	AGC	2	6	616266	616271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639556
13050	NC_000919	GCC	2	6	616332	616337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639556
13051	NC_000919	CT	3	6	616353	616358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_000919	CCA	2	6	616378	616383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_000919	CTG	2	6	616415	616420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639557
13054	NC_000919	ATT	2	6	616529	616534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639557
13055	NC_000919	C	6	6	616545	616550	0 %	0 %	0 %	100 %	15639557
13056	NC_000919	CCG	2	6	616567	616572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639557
13057	NC_000919	TCA	2	6	616594	616599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639557
13058	NC_000919	TAC	2	6	616637	616642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639557
13059	NC_000919	CAA	2	6	616729	616734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639557
13060	NC_000919	CTG	2	6	616774	616779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639557
13061	NC_000919	CTG	2	6	616787	616792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639557
13062	NC_000919	GCA	2	6	616872	616877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639557
13063	NC_000919	ACC	2	6	616913	616918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639557
13064	NC_000919	CAC	2	6	616970	616975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639557
13065	NC_000919	CTC	2	6	617027	617032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639557
13066	NC_000919	GC	3	6	617173	617178	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
13067	NC_000919	TACA	2	8	617208	617215	50 %	25 %	0 %	25 %	15639558
13068	NC_000919	CGC	3	9	617373	617381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639558
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13070	NC_000919	TCCC	2	8	617394	617401	0 %	25 %	0 %	75 %	15639558
13071	NC_000919	TCCT	2	8	617403	617410	0 %	50 %	0 %	50 %	15639558
13072	NC_000919	CA	4	8	617413	617420	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
13073	NC_000919	ACC	2	6	617446	617451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
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13080	NC_000919	ACCC	2	8	617667	617674	25 %	0 %	0 %	75 %	15639558
13081	NC_000919	GC	3	6	617769	617774	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
13082	NC_000919	GGT	2	6	617868	617873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639558
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13086	NC_000919	CG	4	8	617917	617924	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
13087	NC_000919	TGC	2	6	617931	617936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13088	NC_000919	GCA	2	6	617947	617952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13089	NC_000919	TGC	2	6	617994	617999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13090	NC_000919	TTC	2	6	618033	618038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639558
13091	NC_000919	GCA	2	6	618064	618069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13092	NC_000919	TCA	2	6	618094	618099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639558
13093	NC_000919	GCT	2	6	618119	618124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13094	NC_000919	GCTC	2	8	618190	618197	0 %	25 %	25 %	50 %	15639558
13095	NC_000919	CTC	2	6	618276	618281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639558
13096	NC_000919	CTG	2	6	618302	618307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13097	NC_000919	CTG	2	6	618355	618360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13098	NC_000919	AGA	2	6	618393	618398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639558
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13100	NC_000919	GCG	2	6	618446	618451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639558
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13102	NC_000919	GCA	2	6	618475	618480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13103	NC_000919	CAA	2	6	618498	618503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
13104	NC_000919	CAC	2	6	618504	618509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
13105	NC_000919	CTGC	2	8	618517	618524	0 %	25 %	25 %	50 %	15639558
13106	NC_000919	GC	3	6	618588	618593	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
13107	NC_000919	AC	3	6	618594	618599	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
13108	NC_000919	A	7	7	618606	618612	100 %	0 %	0 %	0 %	15639558
13109	NC_000919	ATGCA	2	10	618657	618666	40 %	20 %	20 %	20 %	15639558
13110	NC_000919	GAA	2	6	618667	618672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639558
13111	NC_000919	AAAG	2	8	618692	618699	75 %	0 %	25 %	0 %	15639558
13112	NC_000919	GAC	2	6	618714	618719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639558
13113	NC_000919	CCA	2	6	618728	618733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
13114	NC_000919	GC	3	6	618760	618765	0 %	0 %	50 %	50 %	15639558
13115	NC_000919	CA	3	6	618781	618786	50 %	0 %	0 %	50 %	15639558
13116	NC_000919	ACA	2	6	618800	618805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
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13118	NC_000919	CAA	2	6	618891	618896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639558
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13122	NC_000919	CAC	3	9	619224	619232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639558
13123	NC_000919	ATCT	2	8	619278	619285	25 %	50 %	0 %	25 %	15639558
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13125	NC_000919	TC	3	6	619388	619393	0 %	50 %	0 %	50 %	15639558
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13188	NC_000919	CGCA	2	8	622256	622263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13221	NC_000919	CT	3	6	624038	624043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13223	NC_000919	GCAC	2	8	624258	624265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13224	NC_000919	CAT	2	6	624333	624338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13227	NC_000919	CTC	2	6	624454	624459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13235	NC_000919	CGT	2	6	624831	624836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13236	NC_000919	GCT	2	6	624907	624912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13238	NC_000919	GAA	2	6	625093	625098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13239	NC_000919	CGA	2	6	625134	625139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13240	NC_000919	CG	3	6	625147	625152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13241	NC_000919	GCA	2	6	625219	625224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13243	NC_000919	ACGA	2	8	625261	625268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13244	NC_000919	CGC	2	6	625287	625292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13247	NC_000919	GCG	2	6	625445	625450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13249	NC_000919	CTT	2	6	625517	625522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13250	NC_000919	CAGT	2	8	625615	625622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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