MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_000919	GCG	2	6	569485	569490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639516
12003	NC_000919	TCTG	2	8	569493	569500	0 %	50 %	25 %	25 %	15639516
12004	NC_000919	GAA	2	6	569533	569538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639516
12005	NC_000919	A	6	6	569537	569542	100 %	0 %	0 %	0 %	15639516
12006	NC_000919	A	6	6	569544	569549	100 %	0 %	0 %	0 %	15639516
12007	NC_000919	T	6	6	569592	569597	0 %	100 %	0 %	0 %	15639516
12008	NC_000919	CG	3	6	569608	569613	0 %	0 %	50 %	50 %	15639516
12009	NC_000919	AACA	2	8	569629	569636	75 %	0 %	0 %	25 %	15639516
12010	NC_000919	AGC	2	6	569699	569704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639516
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12012	NC_000919	GAA	2	6	569758	569763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639516
12013	NC_000919	GTGC	2	8	569802	569809	0 %	25 %	50 %	25 %	15639516
12014	NC_000919	TCGC	2	8	569829	569836	0 %	25 %	25 %	50 %	15639516
12015	NC_000919	TG	3	6	569872	569877	0 %	50 %	50 %	0 %	15639516
12016	NC_000919	GTAT	2	8	569930	569937	25 %	50 %	25 %	0 %	15639516
12017	NC_000919	A	7	7	569962	569968	100 %	0 %	0 %	0 %	15639516
12018	NC_000919	GCACG	2	10	570021	570030	20 %	0 %	40 %	40 %	15639516
12019	NC_000919	CG	3	6	570038	570043	0 %	0 %	50 %	50 %	15639516
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12041	NC_000919	CGATA	2	10	570999	571008	40 %	20 %	20 %	20 %	15639518
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12043	NC_000919	GGTCA	2	10	571378	571387	20 %	20 %	40 %	20 %	15639518
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12095	NC_000919	ATA	2	6	573361	573366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639519
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12109	NC_000919	AG	3	6	574077	574082	50 %	0 %	50 %	0 %	15639519
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12111	NC_000919	CGTCC	2	10	574250	574259	0 %	20 %	20 %	60 %	15639520
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12124	NC_000919	G	6	6	574972	574977	0 %	0 %	100 %	0 %	15639521
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12239	NC_000919	CCCAA	2	10	579891	579900	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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12274	NC_000919	TG	3	6	581606	581611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12362	NC_000919	GC	3	6	586143	586148	0 %	0 %	50 %	50 %	15639533
12363	NC_000919	T	6	6	586153	586158	0 %	100 %	0 %	0 %	15639533
12364	NC_000919	CGGTA	2	10	586247	586256	20 %	20 %	40 %	20 %	15639533
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12369	NC_000919	CAA	2	6	586466	586471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639533
12370	NC_000919	CG	3	6	586523	586528	0 %	0 %	50 %	50 %	15639533
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12375	NC_000919	TCC	2	6	586839	586844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639533
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