MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_000919	A	6	6	545094	545099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11503	NC_000919	CTTC	2	8	545200	545207	0 %	50 %	0 %	50 %	15639501
11504	NC_000919	CG	3	6	545293	545298	0 %	0 %	50 %	50 %	15639501
11505	NC_000919	CCG	2	6	545310	545315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639501
11506	NC_000919	CTG	2	6	545342	545347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639501
11507	NC_000919	CA	3	6	545374	545379	50 %	0 %	0 %	50 %	15639501
11508	NC_000919	TAA	2	6	545449	545454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639501
11509	NC_000919	CG	3	6	545633	545638	0 %	0 %	50 %	50 %	15639501
11510	NC_000919	CA	3	6	545761	545766	50 %	0 %	0 %	50 %	15639501
11511	NC_000919	GCT	2	6	545854	545859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639501
11512	NC_000919	ACT	2	6	545862	545867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639501
11513	NC_000919	CGT	2	6	545950	545955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639501
11514	NC_000919	TCA	2	6	545997	546002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639501
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11516	NC_000919	CA	3	6	546160	546165	50 %	0 %	0 %	50 %	15639501
11517	NC_000919	TCT	2	6	546207	546212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639501
11518	NC_000919	GGA	2	6	546369	546374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639501
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11521	NC_000919	ACC	2	6	546609	546614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639501
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11524	NC_000919	AC	3	6	546734	546739	50 %	0 %	0 %	50 %	15639501
11525	NC_000919	TGT	2	6	546784	546789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639501
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11529	NC_000919	TAG	2	6	546931	546936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639501
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11534	NC_000919	GCT	2	6	547165	547170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639502
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11537	NC_000919	GC	3	6	547276	547281	0 %	0 %	50 %	50 %	15639502
11538	NC_000919	TCTG	2	8	547291	547298	0 %	50 %	25 %	25 %	15639502
11539	NC_000919	GTG	2	6	547365	547370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639502
11540	NC_000919	GCTC	2	8	547398	547405	0 %	25 %	25 %	50 %	15639502
11541	NC_000919	ACC	2	6	547407	547412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639502
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11544	NC_000919	GGT	2	6	547654	547659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_000919	GT	3	6	547662	547667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_000919	CCT	2	6	547716	547721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639503
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11553	NC_000919	TGC	2	6	548076	548081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639503
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11557	NC_000919	GGA	2	6	548292	548297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639503
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11571	NC_000919	A	7	7	548886	548892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_000919	CTA	2	6	548900	548905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11573	NC_000919	TTG	3	9	548928	548936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_000919	CGT	2	6	548966	548971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639504
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11582	NC_000919	CT	3	6	549425	549430	0 %	50 %	0 %	50 %	15639504
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11595	NC_000919	CATA	2	8	550069	550076	50 %	25 %	0 %	25 %	15639504
11596	NC_000919	C	6	6	550128	550133	0 %	0 %	0 %	100 %	15639504
11597	NC_000919	CTT	2	6	550174	550179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639504
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11601	NC_000919	ATGG	2	8	550384	550391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_000919	CTG	2	6	550439	550444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11605	NC_000919	A	6	6	550703	550708	100 %	0 %	0 %	0 %	15639505
11606	NC_000919	ACT	2	6	550760	550765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639505
11607	NC_000919	CTG	2	6	550771	550776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639505
11608	NC_000919	CG	3	6	550792	550797	0 %	0 %	50 %	50 %	15639505
11609	NC_000919	TTG	2	6	550847	550852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639505
11610	NC_000919	TTGC	2	8	550891	550898	0 %	50 %	25 %	25 %	15639505
11611	NC_000919	GGT	2	6	550902	550907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639505
11612	NC_000919	A	7	7	550914	550920	100 %	0 %	0 %	0 %	15639505
11613	NC_000919	AC	3	6	550924	550929	50 %	0 %	0 %	50 %	15639505
11614	NC_000919	A	7	7	551027	551033	100 %	0 %	0 %	0 %	15639505
11615	NC_000919	GAC	2	6	551109	551114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639505
11616	NC_000919	GA	3	6	551156	551161	50 %	0 %	50 %	0 %	15639505
11617	NC_000919	T	7	7	551218	551224	0 %	100 %	0 %	0 %	15639505
11618	NC_000919	A	7	7	551228	551234	100 %	0 %	0 %	0 %	15639505
11619	NC_000919	GC	3	6	551240	551245	0 %	0 %	50 %	50 %	15639505
11620	NC_000919	T	6	6	551400	551405	0 %	100 %	0 %	0 %	15639505
11621	NC_000919	TGC	2	6	551445	551450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639505
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11623	NC_000919	GAT	2	6	551479	551484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639505
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11997	NC_000919	AGA	2	6	569325	569330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639516
11998	NC_000919	AGA	2	6	569355	569360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639516
11999	NC_000919	ATG	2	6	569389	569394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639516
12000	NC_000919	GAT	2	6	569427	569432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639516

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