MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_000919	CG	3	6	520371	520376	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
11002	NC_000919	GGA	2	6	520391	520396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639478
11003	NC_000919	AGG	2	6	520397	520402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639478
11004	NC_000919	CTG	2	6	520445	520450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639478
11005	NC_000919	CAG	2	6	520456	520461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
11006	NC_000919	GGT	2	6	520471	520476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639478
11007	NC_000919	CAG	2	6	520480	520485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
11008	NC_000919	CCGT	2	8	520486	520493	0 %	25 %	25 %	50 %	15639478
11009	NC_000919	C	6	6	520522	520527	0 %	0 %	0 %	100 %	15639478
11010	NC_000919	CGC	2	6	520531	520536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639478
11011	NC_000919	CG	3	6	520557	520562	0 %	0 %	50 %	50 %	15639478
11012	NC_000919	GCA	2	6	520565	520570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639478
11013	NC_000919	CTGG	2	8	520603	520610	0 %	25 %	50 %	25 %	15639478
11014	NC_000919	AGG	2	6	520827	520832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_000919	GCG	2	6	520853	520858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_000919	TGCG	2	8	520863	520870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11017	NC_000919	GAGG	2	8	520971	520978	25 %	0 %	75 %	0 %	15639479
11018	NC_000919	GT	3	6	520979	520984	0 %	50 %	50 %	0 %	15639479
11019	NC_000919	GCG	2	6	521056	521061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
11020	NC_000919	CAT	2	6	521205	521210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639479
11021	NC_000919	TCA	2	6	521242	521247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639479
11022	NC_000919	TCT	2	6	521260	521265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639479
11023	NC_000919	GGTT	2	8	521292	521299	0 %	50 %	50 %	0 %	15639479
11024	NC_000919	GCT	2	6	521337	521342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11025	NC_000919	GTCTG	2	10	521352	521361	0 %	40 %	40 %	20 %	15639479
11026	NC_000919	CCT	2	6	521447	521452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639479
11027	NC_000919	GC	3	6	521474	521479	0 %	0 %	50 %	50 %	15639479
11028	NC_000919	GAAG	2	8	521565	521572	50 %	0 %	50 %	0 %	15639479
11029	NC_000919	T	6	6	521575	521580	0 %	100 %	0 %	0 %	15639479
11030	NC_000919	CG	3	6	521592	521597	0 %	0 %	50 %	50 %	15639479
11031	NC_000919	GGT	2	6	521604	521609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639479
11032	NC_000919	GGA	2	6	521634	521639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639479
11033	NC_000919	GCGG	2	8	521679	521686	0 %	0 %	75 %	25 %	15639479
11034	NC_000919	GTT	2	6	521696	521701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639479
11035	NC_000919	TCG	2	6	521728	521733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11036	NC_000919	CGG	2	6	521779	521784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
11037	NC_000919	TG	3	6	521825	521830	0 %	50 %	50 %	0 %	15639479
11038	NC_000919	G	7	7	521854	521860	0 %	0 %	100 %	0 %	15639479
11039	NC_000919	GCA	2	6	521928	521933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11040	NC_000919	CGTC	2	8	521978	521985	0 %	25 %	25 %	50 %	15639479
11041	NC_000919	CGT	2	6	522099	522104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11042	NC_000919	GC	3	6	522217	522222	0 %	0 %	50 %	50 %	15639479
11043	NC_000919	AGA	2	6	522261	522266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639479
11044	NC_000919	TGACC	2	10	522285	522294	20 %	20 %	20 %	40 %	15639479
11045	NC_000919	GCT	2	6	522330	522335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11046	NC_000919	GCG	2	6	522411	522416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
11047	NC_000919	ATC	2	6	522556	522561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639479
11048	NC_000919	TCC	2	6	522622	522627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639479
11049	NC_000919	TGA	2	6	522684	522689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639479
11050	NC_000919	GCTT	2	8	522785	522792	0 %	50 %	25 %	25 %	15639479
11051	NC_000919	CGC	2	6	522849	522854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639479
11052	NC_000919	GGC	2	6	522861	522866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639479
11053	NC_000919	GGT	2	6	522897	522902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639479
11054	NC_000919	GAG	2	6	523021	523026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639479
11055	NC_000919	GCC	2	6	523150	523155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639479
11056	NC_000919	AGG	2	6	523169	523174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639479
11057	NC_000919	GAC	2	6	523231	523236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11058	NC_000919	ATGA	2	8	523261	523268	50 %	25 %	25 %	0 %	15639479
11059	NC_000919	AGCA	2	8	523333	523340	50 %	0 %	25 %	25 %	15639479
11060	NC_000919	CAG	2	6	523347	523352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11061	NC_000919	CTG	2	6	523406	523411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639479
11062	NC_000919	CG	3	6	523469	523474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_000919	GCT	2	6	523740	523745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_000919	CGTGCG	2	12	523785	523796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_000919	CG	3	6	523795	523800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_000919	GGA	2	6	523822	523827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_000919	CGTG	2	8	523833	523840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11068	NC_000919	G	6	6	523850	523855	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_000919	CTGC	2	8	523981	523988	0 %	25 %	25 %	50 %	15639480
11070	NC_000919	TAC	2	6	524016	524021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639480
11071	NC_000919	TGGAGA	2	12	524027	524038	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15639480
11072	NC_000919	ACC	2	6	524141	524146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639480
11073	NC_000919	GAG	2	6	524359	524364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639480
11074	NC_000919	TGG	2	6	524448	524453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639480
11075	NC_000919	GAA	2	6	524454	524459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639480
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11077	NC_000919	A	6	6	524587	524592	100 %	0 %	0 %	0 %	15639480
11078	NC_000919	G	6	6	524645	524650	0 %	0 %	100 %	0 %	15639480
11079	NC_000919	CCA	2	6	524670	524675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639480
11080	NC_000919	ATG	2	6	524687	524692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639480
11081	NC_000919	GTT	2	6	524700	524705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639480
11082	NC_000919	CTG	2	6	524724	524729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639480
11083	NC_000919	AGGA	2	8	524777	524784	50 %	0 %	50 %	0 %	15639480
11084	NC_000919	TGAG	2	8	524800	524807	25 %	25 %	50 %	0 %	15639480
11085	NC_000919	GAG	3	9	524805	524813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639480
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11087	NC_000919	TCG	2	6	524864	524869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639481
11088	NC_000919	GAG	2	6	524949	524954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639481
11089	NC_000919	T	6	6	524963	524968	0 %	100 %	0 %	0 %	15639481
11090	NC_000919	CTTTT	2	10	525008	525017	0 %	80 %	0 %	20 %	15639481
11091	NC_000919	CTG	2	6	525084	525089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11092	NC_000919	GC	3	6	525172	525177	0 %	0 %	50 %	50 %	15639482
11093	NC_000919	CG	5	10	525248	525257	0 %	0 %	50 %	50 %	15639482
11094	NC_000919	GTGCG	2	10	525301	525310	0 %	20 %	60 %	20 %	15639482
11095	NC_000919	CGA	2	6	525326	525331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11096	NC_000919	AAC	3	9	525337	525345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639482
11097	NC_000919	TGC	2	6	525392	525397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11098	NC_000919	GCG	2	6	525429	525434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639482
11099	NC_000919	T	7	7	525524	525530	0 %	100 %	0 %	0 %	15639482
11100	NC_000919	CG	3	6	525543	525548	0 %	0 %	50 %	50 %	15639482
11101	NC_000919	TGG	2	6	525556	525561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639482
11102	NC_000919	CGT	2	6	525604	525609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11103	NC_000919	GCA	2	6	525690	525695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11104	NC_000919	T	6	6	525709	525714	0 %	100 %	0 %	0 %	15639482
11105	NC_000919	TGC	2	6	525908	525913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11106	NC_000919	GCAC	2	8	525969	525976	25 %	0 %	25 %	50 %	15639482
11107	NC_000919	TGC	2	6	526020	526025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639482
11108	NC_000919	TGG	2	6	526113	526118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639483
11109	NC_000919	GCG	2	6	526138	526143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639483
11110	NC_000919	TGG	2	6	526154	526159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639483
11111	NC_000919	TCA	2	6	526174	526179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639483
11112	NC_000919	TGG	2	6	526246	526251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639483
11113	NC_000919	T	6	6	526265	526270	0 %	100 %	0 %	0 %	15639483
11114	NC_000919	TG	3	6	526395	526400	0 %	50 %	50 %	0 %	15639483
11115	NC_000919	GC	4	8	526466	526473	0 %	0 %	50 %	50 %	15639483
11116	NC_000919	GAT	2	6	526499	526504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639483
11117	NC_000919	CCG	2	6	526535	526540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15639483
11118	NC_000919	GTT	2	6	526552	526557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639483
11119	NC_000919	GTT	2	6	526609	526614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639483
11120	NC_000919	A	8	8	526618	526625	100 %	0 %	0 %	0 %	15639483
11121	NC_000919	T	6	6	526641	526646	0 %	100 %	0 %	0 %	15639483
11122	NC_000919	GC	4	8	526703	526710	0 %	0 %	50 %	50 %	15639483
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11124	NC_000919	TCA	2	6	526864	526869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639483
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11317	NC_000919	GGT	2	6	536848	536853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639492
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11322	NC_000919	GCT	2	6	536935	536940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639492
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11326	NC_000919	TTG	2	6	537168	537173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639492
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11329	NC_000919	CAT	2	6	537226	537231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639492
11330	NC_000919	TGA	2	6	537241	537246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639492
11331	NC_000919	GT	3	6	537273	537278	0 %	50 %	50 %	0 %	15639492
11332	NC_000919	TGG	2	6	537370	537375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639492
11333	NC_000919	GAT	2	6	537394	537399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639492
11334	NC_000919	TGA	2	6	537414	537419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639492
11335	NC_000919	AAGGA	2	10	537450	537459	60 %	0 %	40 %	0 %	15639492
11336	NC_000919	GGT	2	6	537473	537478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11337	NC_000919	TGC	2	6	537512	537517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639493
11338	NC_000919	T	8	8	537639	537646	0 %	100 %	0 %	0 %	15639493
11339	NC_000919	TTTTC	2	10	537682	537691	0 %	80 %	0 %	20 %	15639493
11340	NC_000919	TGC	2	6	537721	537726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639493
11341	NC_000919	ACA	2	6	537735	537740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639493
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11343	NC_000919	TTTC	2	8	537809	537816	0 %	75 %	0 %	25 %	15639493
11344	NC_000919	GA	3	6	537828	537833	50 %	0 %	50 %	0 %	15639493
11345	NC_000919	AAG	2	6	537849	537854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639493
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11348	NC_000919	ATGG	2	8	537924	537931	25 %	25 %	50 %	0 %	15639493
11349	NC_000919	ATATTG	2	12	537934	537945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15639493
11350	NC_000919	ACGC	2	8	537988	537995	25 %	0 %	25 %	50 %	15639493
11351	NC_000919	TGT	2	6	538006	538011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639493
11352	NC_000919	GC	3	6	538059	538064	0 %	0 %	50 %	50 %	15639493
11353	NC_000919	CG	3	6	538095	538100	0 %	0 %	50 %	50 %	15639493
11354	NC_000919	AGC	2	6	538118	538123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639493
11355	NC_000919	TGCA	2	8	538159	538166	25 %	25 %	25 %	25 %	15639493
11356	NC_000919	GGA	2	6	538283	538288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639493
11357	NC_000919	TGG	2	6	538351	538356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639493
11358	NC_000919	GAG	2	6	538366	538371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639493
11359	NC_000919	CA	3	6	538435	538440	50 %	0 %	0 %	50 %	15639494
11360	NC_000919	TGG	2	6	538584	538589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639494
11361	NC_000919	GC	3	6	538660	538665	0 %	0 %	50 %	50 %	15639494
11362	NC_000919	GCA	2	6	538687	538692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639494
11363	NC_000919	AAG	2	6	538712	538717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639494
11364	NC_000919	ATT	2	6	538743	538748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639494
11365	NC_000919	CCCGA	2	10	538810	538819	20 %	0 %	20 %	60 %	15639494
11366	NC_000919	ACT	2	6	538852	538857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639494
11367	NC_000919	CGA	2	6	538965	538970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639495
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11369	NC_000919	ATC	2	6	539012	539017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639495
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11494	NC_000919	GAT	2	6	544654	544659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639500
11495	NC_000919	GTT	2	6	544699	544704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639500
11496	NC_000919	TCAG	2	8	544825	544832	25 %	25 %	25 %	25 %	15639500
11497	NC_000919	GC	3	6	544947	544952	0 %	0 %	50 %	50 %	15639500
11498	NC_000919	TGC	2	6	544985	544990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11499	NC_000919	TG	3	6	544997	545002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_000919	GCA	2	6	545038	545043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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