MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_000919	GCA	2	6	472833	472838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639437
10003	NC_000919	GCTG	2	8	472989	472996	0 %	25 %	50 %	25 %	15639437
10004	NC_000919	TGG	2	6	473031	473036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639437
10005	NC_000919	GGA	2	6	473214	473219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639437
10006	NC_000919	T	8	8	473228	473235	0 %	100 %	0 %	0 %	15639437
10007	NC_000919	ATA	2	6	473299	473304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15639437
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10009	NC_000919	TGC	2	6	473378	473383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639438
10010	NC_000919	GGA	2	6	473438	473443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639438
10011	NC_000919	CGG	2	6	473535	473540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639438
10012	NC_000919	GCAC	2	8	473577	473584	25 %	0 %	25 %	50 %	15639438
10013	NC_000919	GAG	2	6	473647	473652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639438
10014	NC_000919	GCA	2	6	473825	473830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639438
10015	NC_000919	CGCT	2	8	473876	473883	0 %	25 %	25 %	50 %	15639438
10016	NC_000919	TCAG	2	8	473923	473930	25 %	25 %	25 %	25 %	15639438
10017	NC_000919	CTC	2	6	474038	474043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15639438
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10019	NC_000919	GC	3	6	474098	474103	0 %	0 %	50 %	50 %	15639438
10020	NC_000919	GTAC	2	8	474125	474132	25 %	25 %	25 %	25 %	15639438
10021	NC_000919	T	6	6	474206	474211	0 %	100 %	0 %	0 %	15639438
10022	NC_000919	ATTT	2	8	474253	474260	25 %	75 %	0 %	0 %	15639438
10023	NC_000919	CG	3	6	474422	474427	0 %	0 %	50 %	50 %	15639438
10024	NC_000919	TGC	2	6	474431	474436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639438
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10026	NC_000919	GTG	2	6	474462	474467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639438
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10028	NC_000919	GAG	2	6	474508	474513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_000919	GC	3	6	474534	474539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_000919	TGA	2	6	474566	474571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639439
10031	NC_000919	TAT	2	6	474594	474599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639439
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10034	NC_000919	ATC	2	6	474699	474704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639439
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10039	NC_000919	GCGT	2	8	474875	474882	0 %	25 %	50 %	25 %	15639439
10040	NC_000919	CGG	2	6	474908	474913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639439
10041	NC_000919	TTA	2	6	474940	474945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639439
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10054	NC_000919	T	8	8	475629	475636	0 %	100 %	0 %	0 %	15639440
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10058	NC_000919	CTG	2	6	475849	475854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639440
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10070	NC_000919	AGT	2	6	476278	476283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_000919	TGCA	2	8	478268	478275	25 %	25 %	25 %	25 %	15639441
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10112	NC_000919	GCG	2	6	478434	478439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639442
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10119	NC_000919	TGTA	2	8	478830	478837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_000919	GCG	2	6	478877	478882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639443
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10124	NC_000919	GTG	2	6	479309	479314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639443
10125	NC_000919	CTG	2	6	479343	479348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639443
10126	NC_000919	GAATT	2	10	479409	479418	40 %	40 %	20 %	0 %	15639443
10127	NC_000919	TGT	2	6	479477	479482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639443
10128	NC_000919	CTG	2	6	479494	479499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639443
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10143	NC_000919	TTG	2	6	480482	480487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639443
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10155	NC_000919	GTG	2	6	481239	481244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639443
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10177	NC_000919	TG	3	6	482524	482529	0 %	50 %	50 %	0 %	15639444
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10180	NC_000919	A	6	6	482667	482672	100 %	0 %	0 %	0 %	15639444
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10186	NC_000919	TCG	2	6	482926	482931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639444
10187	NC_000919	CGGAG	2	10	482962	482971	20 %	0 %	60 %	20 %	15639444
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10189	NC_000919	TTTCT	2	10	483090	483099	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10190	NC_000919	TCCT	2	8	483159	483166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10191	NC_000919	C	6	6	483207	483212	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10192	NC_000919	C	6	6	483227	483232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10193	NC_000919	TGCT	2	8	483277	483284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10194	NC_000919	GT	4	8	483289	483296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10230	NC_000919	GAAG	2	8	485163	485170	50 %	0 %	50 %	0 %	15639447
10231	NC_000919	CGTG	2	8	485203	485210	0 %	25 %	50 %	25 %	15639447
10232	NC_000919	TCT	2	6	485224	485229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639447
10233	NC_000919	GC	3	6	485281	485286	0 %	0 %	50 %	50 %	15639447
10234	NC_000919	GTG	2	6	485313	485318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639447
10235	NC_000919	TCA	2	6	485326	485331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639447
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10237	NC_000919	CG	3	6	485417	485422	0 %	0 %	50 %	50 %	15639447
10238	NC_000919	CAAG	2	8	485423	485430	50 %	0 %	25 %	25 %	15639447
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10245	NC_000919	AACA	2	8	485853	485860	75 %	0 %	0 %	25 %	15639447
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10247	NC_000919	TG	3	6	485932	485937	0 %	50 %	50 %	0 %	15639447
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