MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols chromosome

Total Repeats: 23959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000919	GCG	2	6	219513	219518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15639209
4502	NC_000919	TTC	2	6	219539	219544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639209
4503	NC_000919	CT	4	8	219616	219623	0 %	50 %	0 %	50 %	15639209
4504	NC_000919	TGA	2	6	219647	219652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639209
4505	NC_000919	TGG	2	6	219740	219745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639209
4506	NC_000919	AAG	2	6	219796	219801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639209
4507	NC_000919	AGG	2	6	219854	219859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639209
4508	NC_000919	G	7	7	219867	219873	0 %	0 %	100 %	0 %	15639209
4509	NC_000919	ACC	2	6	219966	219971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15639209
4510	NC_000919	TGC	2	6	220039	220044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639209
4511	NC_000919	TAG	2	6	220096	220101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639209
4512	NC_000919	AGC	2	6	220207	220212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639209
4513	NC_000919	AGG	2	6	220372	220377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639209
4514	NC_000919	CG	4	8	220404	220411	0 %	0 %	50 %	50 %	15639209
4515	NC_000919	CGA	2	6	220454	220459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639209
4516	NC_000919	GCA	2	6	220493	220498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639209
4517	NC_000919	GGA	2	6	220517	220522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639209
4518	NC_000919	AGC	3	9	220538	220546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639209
4519	NC_000919	AAG	2	6	220563	220568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639209
4520	NC_000919	GGT	2	6	220599	220604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639209
4521	NC_000919	GGGA	2	8	220662	220669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_000919	TG	3	6	220689	220694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_000919	TG	4	8	220846	220853	0 %	50 %	50 %	0 %	15640026
4524	NC_000919	ATT	2	6	220906	220911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640026
4525	NC_000919	GAA	2	6	220947	220952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640026
4526	NC_000919	CGG	2	6	220968	220973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640026
4527	NC_000919	GGA	2	6	221021	221026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640026
4528	NC_000919	AGG	2	6	221035	221040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640026
4529	NC_000919	CGC	2	6	221226	221231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640026
4530	NC_000919	ACG	2	6	221245	221250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640026
4531	NC_000919	GAA	2	6	221307	221312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640026
4532	NC_000919	CGA	2	6	221351	221356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640026
4533	NC_000919	GTA	2	6	221443	221448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640026
4534	NC_000919	T	6	6	221453	221458	0 %	100 %	0 %	0 %	15640026
4535	NC_000919	GC	3	6	221478	221483	0 %	0 %	50 %	50 %	15640026
4536	NC_000919	TGG	2	6	221486	221491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640026
4537	NC_000919	A	6	6	221557	221562	100 %	0 %	0 %	0 %	15640026
4538	NC_000919	AGA	2	6	221588	221593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640026
4539	NC_000919	GCG	2	6	221597	221602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640026
4540	NC_000919	GTGTTT	2	12	221663	221674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640026
4541	NC_000919	GC	3	6	221757	221762	0 %	0 %	50 %	50 %	15640026
4542	NC_000919	GCA	2	6	221794	221799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640026
4543	NC_000919	CCGG	2	8	221810	221817	0 %	0 %	50 %	50 %	15640026
4544	NC_000919	GC	3	6	221867	221872	0 %	0 %	50 %	50 %	15640026
4545	NC_000919	CCG	2	6	221984	221989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640026
4546	NC_000919	ATT	2	6	222047	222052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_000919	CGTG	2	8	222057	222064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_000919	TTTC	2	8	222068	222075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_000919	GT	3	6	222078	222083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_000919	TTC	2	6	222133	222138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_000919	AGC	2	6	222168	222173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_000919	T	9	9	222248	222256	0 %	100 %	0 %	0 %	15639210
4553	NC_000919	TCGTT	2	10	222300	222309	0 %	60 %	20 %	20 %	15639210
4554	NC_000919	GC	3	6	222313	222318	0 %	0 %	50 %	50 %	15639210
4555	NC_000919	TTC	2	6	222363	222368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639210
4556	NC_000919	TGCGCT	2	12	222411	222422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639210
4557	NC_000919	TTG	2	6	222461	222466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639210
4558	NC_000919	CTG	2	6	222511	222516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639210
4559	NC_000919	AAC	2	6	222536	222541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639210
4560	NC_000919	TTG	2	6	222542	222547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639210
4561	NC_000919	AGG	2	6	222557	222562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639210
4562	NC_000919	ACA	2	6	222626	222631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639210
4563	NC_000919	TGC	2	6	222633	222638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639210
4564	NC_000919	AC	3	6	222653	222658	50 %	0 %	0 %	50 %	15639210
4565	NC_000919	TA	3	6	222720	222725	50 %	50 %	0 %	0 %	15639210
4566	NC_000919	T	7	7	222726	222732	0 %	100 %	0 %	0 %	15639210
4567	NC_000919	GAT	3	9	222733	222741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639210
4568	NC_000919	TGT	3	9	222911	222919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639210
4569	NC_000919	ATG	2	6	222946	222951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639210
4570	NC_000919	GC	3	6	222963	222968	0 %	0 %	50 %	50 %	15639210
4571	NC_000919	ATT	2	6	223049	223054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639210
4572	NC_000919	ACG	2	6	223055	223060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639210
4573	NC_000919	TGA	2	6	223071	223076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639210
4574	NC_000919	CGT	2	6	223127	223132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639210
4575	NC_000919	ATC	2	6	223361	223366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639210
4576	NC_000919	AGT	2	6	223479	223484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639210
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4579	NC_000919	T	7	7	223678	223684	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4580	NC_000919	GC	3	6	223743	223748	0 %	0 %	50 %	50 %	15639211
4581	NC_000919	CTG	2	6	223756	223761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639211
4582	NC_000919	T	6	6	223794	223799	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4583	NC_000919	TTTA	2	8	223854	223861	25 %	75 %	0 %	0 %	15639211
4584	NC_000919	T	6	6	223876	223881	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4585	NC_000919	A	8	8	223933	223940	100 %	0 %	0 %	0 %	15639211
4586	NC_000919	ACG	2	6	223963	223968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639211
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4588	NC_000919	ATT	2	6	224054	224059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639211
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4590	NC_000919	T	8	8	224099	224106	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4591	NC_000919	A	6	6	224143	224148	100 %	0 %	0 %	0 %	15639211
4592	NC_000919	ATG	2	6	224155	224160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639211
4593	NC_000919	CAA	2	6	224179	224184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639211
4594	NC_000919	TTA	2	6	224231	224236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639211
4595	NC_000919	TCTTGT	2	12	224237	224248	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15639211
4596	NC_000919	GTGTTT	2	12	224266	224277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639211
4597	NC_000919	T	6	6	224275	224280	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4598	NC_000919	AGG	2	6	224286	224291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15639211
4599	NC_000919	GTG	2	6	224356	224361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639211
4600	NC_000919	CAG	2	6	224408	224413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15639211
4601	NC_000919	T	7	7	224475	224481	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4602	NC_000919	T	6	6	224536	224541	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4603	NC_000919	AGGC	2	8	224690	224697	25 %	0 %	50 %	25 %	15639211
4604	NC_000919	T	6	6	224769	224774	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4605	NC_000919	T	7	7	224856	224862	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4606	NC_000919	ACGC	2	8	224869	224876	25 %	0 %	25 %	50 %	15639211
4607	NC_000919	GAT	2	6	224880	224885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639211
4608	NC_000919	AAC	2	6	224941	224946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15639211
4609	NC_000919	TTAC	2	8	225018	225025	25 %	50 %	0 %	25 %	15639211
4610	NC_000919	ATT	2	6	225088	225093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639211
4611	NC_000919	TTG	2	6	225185	225190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639211
4612	NC_000919	GAA	2	6	225322	225327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15639211
4613	NC_000919	T	7	7	225396	225402	0 %	100 %	0 %	0 %	15639211
4614	NC_000919	CTA	2	6	225444	225449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15639211
4615	NC_000919	GTG	2	6	225502	225507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639211
4616	NC_000919	GTG	2	6	225598	225603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15639211
4617	NC_000919	TG	3	6	225740	225745	0 %	50 %	50 %	0 %	15639211
4618	NC_000919	GAT	2	6	225769	225774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15639211
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4620	NC_000919	TTA	2	6	225887	225892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15639212
4621	NC_000919	GTT	2	6	225971	225976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15639212
4622	NC_000919	TC	3	6	225982	225987	0 %	50 %	0 %	50 %	15639212
4623	NC_000919	TCT	2	6	226004	226009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15639212
4624	NC_000919	CGT	2	6	226061	226066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15639212
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4626	NC_000919	GTGC	2	8	226269	226276	0 %	25 %	50 %	25 %	15639213
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4997	NC_000919	TGT	2	6	243123	243128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_000919	T	6	6	243128	243133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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