MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_000853	GAA	2	6	1814120	1814125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644581
40002	NC_000853	ATA	2	6	1814139	1814144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644581
40003	NC_000853	CCTC	2	8	1814248	1814255	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40004	NC_000853	CTT	2	6	1814290	1814295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40005	NC_000853	ATT	2	6	1814317	1814322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644582
40006	NC_000853	T	6	6	1814341	1814346	0 %	100 %	0 %	0 %	15644582
40007	NC_000853	ATG	2	6	1814394	1814399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644582
40008	NC_000853	CAGAC	2	10	1814419	1814428	40 %	0 %	20 %	40 %	15644582
40009	NC_000853	CAA	2	6	1814488	1814493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644582
40010	NC_000853	TTTCT	2	10	1814575	1814584	0 %	80 %	0 %	20 %	15644582
40011	NC_000853	TTTG	2	8	1814621	1814628	0 %	75 %	25 %	0 %	15644582
40012	NC_000853	CAA	2	6	1814662	1814667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644582
40013	NC_000853	TGA	2	6	1814764	1814769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644582
40014	NC_000853	CTT	2	6	1814785	1814790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644582
40015	NC_000853	TTCG	2	8	1814885	1814892	0 %	50 %	25 %	25 %	15644582
40016	NC_000853	TGTC	2	8	1814902	1814909	0 %	50 %	25 %	25 %	15644582
40017	NC_000853	TCC	2	6	1814945	1814950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644582
40018	NC_000853	AGAAGT	2	12	1814974	1814985	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15644582
40019	NC_000853	TCC	2	6	1815017	1815022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644582
40020	NC_000853	ATCT	2	8	1815032	1815039	25 %	50 %	0 %	25 %	15644582
40021	NC_000853	TTG	2	6	1815096	1815101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644582
40022	NC_000853	TTC	2	6	1815189	1815194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644582
40023	NC_000853	CAA	2	6	1815265	1815270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644582
40024	NC_000853	CCCTGT	2	12	1815282	1815293	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15644582
40025	NC_000853	GCC	2	6	1815297	1815302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644582
40026	NC_000853	TTC	2	6	1815377	1815382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644582
40027	NC_000853	GGA	2	6	1815394	1815399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644582
40028	NC_000853	TTTG	2	8	1815435	1815442	0 %	75 %	25 %	0 %	15644582
40029	NC_000853	CAA	2	6	1815466	1815471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644582
40030	NC_000853	CCT	2	6	1815505	1815510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40031	NC_000853	TCA	2	6	1815622	1815627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40032	NC_000853	TTCA	2	8	1815633	1815640	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40033	NC_000853	GAG	2	6	1815745	1815750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644583
40034	NC_000853	GAA	2	6	1815761	1815766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644583
40035	NC_000853	T	6	6	1815770	1815775	0 %	100 %	0 %	0 %	15644583
40036	NC_000853	TGCT	2	8	1815778	1815785	0 %	50 %	25 %	25 %	15644583
40037	NC_000853	CCT	2	6	1815808	1815813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644583
40038	NC_000853	GAA	2	6	1815900	1815905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644583
40039	NC_000853	CGT	2	6	1815917	1815922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644583
40040	NC_000853	TG	3	6	1816031	1816036	0 %	50 %	50 %	0 %	15644583
40041	NC_000853	ACT	2	6	1816087	1816092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644583
40042	NC_000853	TAA	2	6	1816171	1816176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644583
40043	NC_000853	CA	3	6	1816194	1816199	50 %	0 %	0 %	50 %	15644583
40044	NC_000853	ACT	2	6	1816261	1816266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644583
40045	NC_000853	CACTGG	2	12	1816302	1816313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15644583
40046	NC_000853	GA	3	6	1816400	1816405	50 %	0 %	50 %	0 %	15644583
40047	NC_000853	TGC	2	6	1816466	1816471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644583
40048	NC_000853	AT	3	6	1816479	1816484	50 %	50 %	0 %	0 %	15644583
40049	NC_000853	AAC	2	6	1816698	1816703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644583
40050	NC_000853	GAG	2	6	1816710	1816715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644583
40051	NC_000853	TTC	2	6	1816752	1816757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644583
40052	NC_000853	TCA	2	6	1816807	1816812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644583
40053	NC_000853	A	6	6	1816812	1816817	100 %	0 %	0 %	0 %	15644583
40054	NC_000853	TGC	2	6	1816820	1816825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644583
40055	NC_000853	CTA	2	6	1816871	1816876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644583
40056	NC_000853	CGG	2	6	1816877	1816882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644583
40057	NC_000853	GA	3	6	1816937	1816942	50 %	0 %	50 %	0 %	15644583
40058	NC_000853	GAA	2	6	1817085	1817090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644583
40059	NC_000853	TCA	2	6	1817122	1817127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644583
40060	NC_000853	ATTC	2	8	1817129	1817136	25 %	50 %	0 %	25 %	15644583
40061	NC_000853	ACG	2	6	1817155	1817160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644583
40062	NC_000853	TCC	2	6	1817226	1817231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644583
40063	NC_000853	TGG	2	6	1817245	1817250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644583
40064	NC_000853	GAA	2	6	1817292	1817297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644583
40065	NC_000853	GAT	2	6	1817306	1817311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644583
40066	NC_000853	GAG	2	6	1817419	1817424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644583
40067	NC_000853	A	6	6	1817436	1817441	100 %	0 %	0 %	0 %	15644584
40068	NC_000853	ACC	2	6	1817495	1817500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644584
40069	NC_000853	GTC	2	6	1817502	1817507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644584
40070	NC_000853	CAC	2	6	1817519	1817524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644584
40071	NC_000853	TC	3	6	1817532	1817537	0 %	50 %	0 %	50 %	15644584
40072	NC_000853	GCA	2	6	1817568	1817573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644584
40073	NC_000853	GAT	2	6	1817574	1817579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644584
40074	NC_000853	AGG	2	6	1817666	1817671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644584
40075	NC_000853	TCTT	2	8	1817689	1817696	0 %	75 %	0 %	25 %	15644584
40076	NC_000853	GATC	2	8	1817702	1817709	25 %	25 %	25 %	25 %	15644584
40077	NC_000853	CGG	2	6	1818043	1818048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644584
40078	NC_000853	TGG	2	6	1818053	1818058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644584
40079	NC_000853	CAGC	2	8	1818066	1818073	25 %	0 %	25 %	50 %	15644584
40080	NC_000853	TGT	2	6	1818077	1818082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644584
40081	NC_000853	GTT	2	6	1818090	1818095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644584
40082	NC_000853	AAG	2	6	1818103	1818108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644584
40083	NC_000853	GTGA	2	8	1818114	1818121	25 %	25 %	50 %	0 %	15644584
40084	NC_000853	AGC	2	6	1818148	1818153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644584
40085	NC_000853	TTG	2	6	1818169	1818174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644584
40086	NC_000853	CAA	2	6	1818211	1818216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644584
40087	NC_000853	GAA	2	6	1818391	1818396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644584
40088	NC_000853	TGG	2	6	1818444	1818449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644584
40089	NC_000853	G	6	6	1818453	1818458	0 %	0 %	100 %	0 %	15644584
40090	NC_000853	AAC	2	6	1818474	1818479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644584
40091	NC_000853	GGA	2	6	1818531	1818536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644584
40092	NC_000853	TAG	2	6	1818560	1818565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644584
40093	NC_000853	GGA	2	6	1818609	1818614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644584
40094	NC_000853	GGT	2	6	1818648	1818653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644584
40095	NC_000853	TGA	3	9	1818680	1818688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644584
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40098	NC_000853	GAG	2	6	1818763	1818768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644584
40099	NC_000853	TTG	2	6	1818802	1818807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644585
40100	NC_000853	TTTC	2	8	1818814	1818821	0 %	75 %	0 %	25 %	15644585
40101	NC_000853	CTTC	2	8	1818946	1818953	0 %	50 %	0 %	50 %	15644585
40102	NC_000853	GGTTGT	2	12	1818993	1819004	0 %	50 %	50 %	0 %	15644585
40103	NC_000853	GAAA	2	8	1819137	1819144	75 %	0 %	25 %	0 %	15644585
40104	NC_000853	CAA	2	6	1819173	1819178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644585
40105	NC_000853	GTTT	2	8	1819215	1819222	0 %	75 %	25 %	0 %	15644585
40106	NC_000853	ATACA	2	10	1819258	1819267	60 %	20 %	0 %	20 %	15644585
40107	NC_000853	GAA	2	6	1819300	1819305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644585
40108	NC_000853	GTGAG	2	10	1819428	1819437	20 %	20 %	60 %	0 %	15644585
40109	NC_000853	A	6	6	1819445	1819450	100 %	0 %	0 %	0 %	15644586
40110	NC_000853	TCT	2	6	1819471	1819476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644586
40111	NC_000853	TC	3	6	1819514	1819519	0 %	50 %	0 %	50 %	15644586
40112	NC_000853	TGG	2	6	1819662	1819667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644586
40113	NC_000853	CTA	2	6	1819678	1819683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644586
40114	NC_000853	TCT	2	6	1819971	1819976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644586
40115	NC_000853	ACT	2	6	1820052	1820057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644586
40116	NC_000853	GAC	2	6	1820110	1820115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644586
40117	NC_000853	GGAA	3	12	1820214	1820225	50 %	0 %	50 %	0 %	15644586
40118	NC_000853	CTT	2	6	1820407	1820412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644586
40119	NC_000853	CT	3	6	1820436	1820441	0 %	50 %	0 %	50 %	15644586
40120	NC_000853	CTA	2	6	1820461	1820466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644586
40121	NC_000853	CT	4	8	1820504	1820511	0 %	50 %	0 %	50 %	15644586
40122	NC_000853	TGGCGA	2	12	1820512	1820523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15644586
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40129	NC_000853	GGT	2	6	1820710	1820715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644587
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40153	NC_000853	CT	3	6	1821698	1821703	0 %	50 %	0 %	50 %	15644587
40154	NC_000853	TTC	2	6	1821764	1821769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644587
40155	NC_000853	TC	3	6	1821824	1821829	0 %	50 %	0 %	50 %	15644587
40156	NC_000853	ACTC	2	8	1821844	1821851	25 %	25 %	0 %	50 %	15644587
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40161	NC_000853	GA	3	6	1822122	1822127	50 %	0 %	50 %	0 %	15644587
40162	NC_000853	CTTG	2	8	1822156	1822163	0 %	50 %	25 %	25 %	15644587
40163	NC_000853	A	6	6	1822170	1822175	100 %	0 %	0 %	0 %	15644587
40164	NC_000853	TCT	2	6	1822204	1822209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644587
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40167	NC_000853	AGA	2	6	1822333	1822338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644587
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40172	NC_000853	GTT	2	6	1822659	1822664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644588
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40175	NC_000853	GATG	2	8	1822744	1822751	25 %	25 %	50 %	0 %	15644588
40176	NC_000853	GAT	2	6	1822819	1822824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644588
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40178	NC_000853	GGCA	2	8	1822898	1822905	25 %	0 %	50 %	25 %	15644588
40179	NC_000853	TCT	2	6	1823018	1823023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644588
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40181	NC_000853	AGA	3	9	1823211	1823219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644588
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40191	NC_000853	CTTT	2	8	1823834	1823841	0 %	75 %	0 %	25 %	15644588
40192	NC_000853	CGA	2	6	1823856	1823861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644588
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40195	NC_000853	CT	3	6	1824064	1824069	0 %	50 %	0 %	50 %	15644588
40196	NC_000853	TAC	2	6	1824091	1824096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644588
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40200	NC_000853	GGAAA	2	10	1824481	1824490	60 %	0 %	40 %	0 %	15644588
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40209	NC_000853	TTCCT	2	10	1824722	1824731	0 %	60 %	0 %	40 %	15644588
40210	NC_000853	GAA	2	6	1824759	1824764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644588
40211	NC_000853	GAAA	2	8	1824817	1824824	75 %	0 %	25 %	0 %	15644588
40212	NC_000853	A	6	6	1824919	1824924	100 %	0 %	0 %	0 %	15644588
40213	NC_000853	CGGG	2	8	1824941	1824948	0 %	0 %	75 %	25 %	15644588
40214	NC_000853	AGA	2	6	1824949	1824954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644588
40215	NC_000853	GGT	2	6	1824985	1824990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644588
40216	NC_000853	GTG	2	6	1825009	1825014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644588
40217	NC_000853	AGA	2	6	1825034	1825039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644588
40218	NC_000853	AG	3	6	1825165	1825170	50 %	0 %	50 %	0 %	15644588
40219	NC_000853	AGG	2	6	1825235	1825240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40220	NC_000853	A	6	6	1825252	1825257	100 %	0 %	0 %	0 %	15644589
40221	NC_000853	TC	3	6	1825298	1825303	0 %	50 %	0 %	50 %	15644589
40222	NC_000853	ATC	2	6	1825399	1825404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644589
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40225	NC_000853	CTC	2	6	1825549	1825554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644589
40226	NC_000853	TTC	2	6	1825575	1825580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644589
40227	NC_000853	CCT	2	6	1825613	1825618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644589
40228	NC_000853	TCT	2	6	1825666	1825671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644589
40229	NC_000853	GTT	2	6	1825690	1825695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644589
40230	NC_000853	CGC	2	6	1825701	1825706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644589
40231	NC_000853	CGT	2	6	1825722	1825727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644589
40232	NC_000853	AATC	2	8	1825768	1825775	50 %	25 %	0 %	25 %	15644589
40233	NC_000853	TCC	2	6	1825904	1825909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644589
40234	NC_000853	CGA	2	6	1825977	1825982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644589
40235	NC_000853	GTG	2	6	1826020	1826025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644589
40236	NC_000853	AATC	2	8	1826027	1826034	50 %	25 %	0 %	25 %	15644589
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40238	NC_000853	GCA	2	6	1826078	1826083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644589
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40350	NC_000853	AAT	2	6	1831568	1831573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40479	NC_000853	GTA	2	6	1837094	1837099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644597
40480	NC_000853	CGA	2	6	1837102	1837107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644597
40481	NC_000853	TGA	2	6	1837259	1837264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644597
40482	NC_000853	A	6	6	1837278	1837283	100 %	0 %	0 %	0 %	15644597
40483	NC_000853	GAAA	2	8	1837374	1837381	75 %	0 %	25 %	0 %	15644597
40484	NC_000853	GAA	2	6	1837433	1837438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644597
40485	NC_000853	TA	3	6	1837537	1837542	50 %	50 %	0 %	0 %	15644597
40486	NC_000853	CTTCT	2	10	1837579	1837588	0 %	60 %	0 %	40 %	15644597
40487	NC_000853	CCT	2	6	1837607	1837612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40491	NC_000853	GGC	2	6	1837874	1837879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644598
40492	NC_000853	GC	3	6	1837900	1837905	0 %	0 %	50 %	50 %	15644598
40493	NC_000853	TGA	2	6	1837935	1837940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644598
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