MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000853	CT	3	6	158510	158515	0 %	50 %	0 %	50 %	15642927
3502	NC_000853	GAA	2	6	158614	158619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642927
3503	NC_000853	AGA	2	6	158645	158650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642927
3504	NC_000853	TTTC	2	8	158803	158810	0 %	75 %	0 %	25 %	15642927
3505	NC_000853	AGG	2	6	158816	158821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642927
3506	NC_000853	TTC	2	6	158874	158879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642927
3507	NC_000853	ATG	2	6	158895	158900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642927
3508	NC_000853	TTTC	2	8	159107	159114	0 %	75 %	0 %	25 %	15642927
3509	NC_000853	TTC	2	6	159232	159237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642927
3510	NC_000853	TCC	3	9	159278	159286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642927
3511	NC_000853	CATG	2	8	159298	159305	25 %	25 %	25 %	25 %	15642927
3512	NC_000853	TGCG	2	8	159350	159357	0 %	25 %	50 %	25 %	15642927
3513	NC_000853	TTTC	2	8	159370	159377	0 %	75 %	0 %	25 %	15642927
3514	NC_000853	GAA	2	6	159391	159396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642927
3515	NC_000853	GAC	2	6	159479	159484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642927
3516	NC_000853	GT	5	10	159503	159512	0 %	50 %	50 %	0 %	15642927
3517	NC_000853	GAA	2	6	159581	159586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642927
3518	NC_000853	GAA	2	6	159611	159616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642927
3519	NC_000853	T	6	6	159701	159706	0 %	100 %	0 %	0 %	15642927
3520	NC_000853	ACC	2	6	159849	159854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642927
3521	NC_000853	TTTC	2	8	159961	159968	0 %	75 %	0 %	25 %	15642927
3522	NC_000853	CT	3	6	159972	159977	0 %	50 %	0 %	50 %	15642927
3523	NC_000853	TAT	3	9	159980	159988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642927
3524	NC_000853	TAA	2	6	160117	160122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_000853	TG	3	6	160126	160131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_000853	TGA	2	6	160193	160198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_000853	GA	3	6	160227	160232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_000853	AGG	2	6	160243	160248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_000853	TAT	2	6	160388	160393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642928
3530	NC_000853	TGT	2	6	160524	160529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642928
3531	NC_000853	GTGTT	2	10	160586	160595	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_000853	GAT	2	6	160612	160617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_000853	GATC	2	8	160686	160693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_000853	TCT	2	6	160704	160709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_000853	GGA	2	6	160716	160721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_000853	AAG	2	6	160751	160756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_000853	GAAG	2	8	160774	160781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_000853	GCT	2	6	160822	160827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_000853	GA	3	6	160830	160835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_000853	AG	3	6	160905	160910	50 %	0 %	50 %	0 %	15642929
3541	NC_000853	GAAAA	2	10	160939	160948	80 %	0 %	20 %	0 %	15642929
3542	NC_000853	AGAC	2	8	160949	160956	50 %	0 %	25 %	25 %	15642929
3543	NC_000853	AGA	2	6	160980	160985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642929
3544	NC_000853	AGA	2	6	160988	160993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642929
3545	NC_000853	GGACA	2	10	161007	161016	40 %	0 %	40 %	20 %	15642929
3546	NC_000853	AAT	2	6	161055	161060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642929
3547	NC_000853	AGA	2	6	161073	161078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642929
3548	NC_000853	TGA	2	6	161142	161147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642929
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3553	NC_000853	CGA	2	6	161486	161491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642929
3554	NC_000853	CCT	2	6	161505	161510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642929
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3556	NC_000853	AG	3	6	161538	161543	50 %	0 %	50 %	0 %	15642929
3557	NC_000853	GAG	3	9	161574	161582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642929
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3559	NC_000853	CAT	2	6	161622	161627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642929
3560	NC_000853	AAG	2	6	161628	161633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642929
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3562	NC_000853	AGA	2	6	161823	161828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642929
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3564	NC_000853	TGA	2	6	161883	161888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642929
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3580	NC_000853	CT	3	6	162659	162664	0 %	50 %	0 %	50 %	15642930
3581	NC_000853	TA	4	8	162675	162682	50 %	50 %	0 %	0 %	15642930
3582	NC_000853	TCAA	2	8	162702	162709	50 %	25 %	0 %	25 %	15642930
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3589	NC_000853	GTT	2	6	162980	162985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642930
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3593	NC_000853	TTC	2	6	163170	163175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642930
3594	NC_000853	AGCG	2	8	163187	163194	25 %	0 %	50 %	25 %	15642930
3595	NC_000853	CAG	2	6	163199	163204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642930
3596	NC_000853	ATCAGT	2	12	163209	163220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15642930
3597	NC_000853	T	6	6	163272	163277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_000853	A	6	6	163299	163304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_000853	GAG	2	6	163359	163364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642931
3600	NC_000853	T	6	6	163513	163518	0 %	100 %	0 %	0 %	15642931
3601	NC_000853	CA	3	6	163592	163597	50 %	0 %	0 %	50 %	15642931
3602	NC_000853	CTGTC	2	10	163608	163617	0 %	40 %	20 %	40 %	15642931
3603	NC_000853	CCA	2	6	163659	163664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642931
3604	NC_000853	ATT	2	6	163778	163783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642931
3605	NC_000853	C	6	6	163787	163792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3606	NC_000853	A	6	6	163794	163799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_000853	G	6	6	163818	163823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_000853	GAA	2	6	163850	163855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_000853	TTC	2	6	163862	163867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_000853	ATA	2	6	163951	163956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_000853	CAAG	2	8	163975	163982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_000853	TGT	2	6	164010	164015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_000853	GAA	2	6	164066	164071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_000853	GAA	2	6	164075	164080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642932
3615	NC_000853	TGC	2	6	164102	164107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642932
3616	NC_000853	TTC	2	6	164121	164126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642932
3617	NC_000853	CAG	2	6	164177	164182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642932
3618	NC_000853	AAGA	2	8	164267	164274	75 %	0 %	25 %	0 %	15642932
3619	NC_000853	GAA	2	6	164279	164284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642932
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3621	NC_000853	TTG	2	6	164344	164349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642932
3622	NC_000853	GC	3	6	164352	164357	0 %	0 %	50 %	50 %	15642932
3623	NC_000853	TAT	2	6	164361	164366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642932
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3626	NC_000853	CCTT	2	8	164496	164503	0 %	50 %	0 %	50 %	15642932
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