MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_000853	CTA	2	6	1655183	1655188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644416
36502	NC_000853	GAA	2	6	1655222	1655227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644416
36503	NC_000853	CTT	2	6	1655231	1655236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644416
36504	NC_000853	AGT	2	6	1655363	1655368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644417
36505	NC_000853	TCCA	2	8	1655373	1655380	25 %	25 %	0 %	50 %	15644417
36506	NC_000853	ATC	2	6	1655386	1655391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644417
36507	NC_000853	TCCA	2	8	1655414	1655421	25 %	25 %	0 %	50 %	15644418
36508	NC_000853	CGA	2	6	1655458	1655463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644418
36509	NC_000853	TGT	2	6	1655473	1655478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644418
36510	NC_000853	TCGA	2	8	1655529	1655536	25 %	25 %	25 %	25 %	15644418
36511	NC_000853	GAA	2	6	1655555	1655560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644418
36512	NC_000853	TAG	2	6	1655577	1655582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644418
36513	NC_000853	GTT	2	6	1655611	1655616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644418
36514	NC_000853	AGA	2	6	1655642	1655647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644418
36515	NC_000853	TCA	2	6	1655734	1655739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644418
36516	NC_000853	CGA	2	6	1655755	1655760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36517	NC_000853	GCT	2	6	1655769	1655774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36518	NC_000853	AC	3	6	1655830	1655835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36519	NC_000853	TTTC	2	8	1655836	1655843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36520	NC_000853	ATC	2	6	1655849	1655854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36521	NC_000853	C	6	6	1655854	1655859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36522	NC_000853	TAT	2	6	1655860	1655865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36523	NC_000853	TAT	2	6	1655872	1655877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36524	NC_000853	T	6	6	1655907	1655912	0 %	100 %	0 %	0 %	15644419
36525	NC_000853	GAA	2	6	1655913	1655918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644419
36526	NC_000853	AAAACA	2	12	1655946	1655957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15644419
36527	NC_000853	CGG	2	6	1656046	1656051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36528	NC_000853	GAAA	2	8	1656102	1656109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36529	NC_000853	CGAA	2	8	1656168	1656175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36530	NC_000853	CGG	2	6	1656223	1656228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36531	NC_000853	GC	3	6	1656248	1656253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36532	NC_000853	TCT	2	6	1656449	1656454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644420
36533	NC_000853	ATGCC	2	10	1656461	1656470	20 %	20 %	20 %	40 %	15644420
36534	NC_000853	TGG	2	6	1656543	1656548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644420
36535	NC_000853	CTTT	2	8	1656570	1656577	0 %	75 %	0 %	25 %	15644420
36536	NC_000853	TCCC	2	8	1656599	1656606	0 %	25 %	0 %	75 %	15644421
36537	NC_000853	AGA	2	6	1656631	1656636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644421
36538	NC_000853	TCC	2	6	1656699	1656704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644421
36539	NC_000853	TTC	2	6	1656708	1656713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644421
36540	NC_000853	GA	4	8	1656732	1656739	50 %	0 %	50 %	0 %	15644421
36541	NC_000853	AAC	2	6	1656791	1656796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644421
36542	NC_000853	TTG	2	6	1656810	1656815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644421
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36544	NC_000853	AAG	2	6	1656847	1656852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644421
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36547	NC_000853	CCA	2	6	1656925	1656930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644421
36548	NC_000853	GAG	2	6	1656947	1656952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644421
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36553	NC_000853	AG	4	8	1657145	1657152	50 %	0 %	50 %	0 %	15644421
36554	NC_000853	TTC	2	6	1657167	1657172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644421
36555	NC_000853	AG	3	6	1657187	1657192	50 %	0 %	50 %	0 %	15644421
36556	NC_000853	TTCA	2	8	1657196	1657203	25 %	50 %	0 %	25 %	15644421
36557	NC_000853	TTC	2	6	1657258	1657263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644421
36558	NC_000853	GATT	2	8	1657288	1657295	25 %	50 %	25 %	0 %	15644421
36559	NC_000853	AAG	2	6	1657320	1657325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644421
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36568	NC_000853	GAGGAT	2	12	1657664	1657675	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15644421
36569	NC_000853	GA	3	6	1657689	1657694	50 %	0 %	50 %	0 %	15644421
36570	NC_000853	TTC	2	6	1657738	1657743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644421
36571	NC_000853	TCC	2	6	1657745	1657750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36572	NC_000853	GAA	2	6	1657796	1657801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644422
36573	NC_000853	A	6	6	1657811	1657816	100 %	0 %	0 %	0 %	15644422
36574	NC_000853	A	6	6	1657885	1657890	100 %	0 %	0 %	0 %	15644422
36575	NC_000853	CAG	2	6	1657935	1657940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644422
36576	NC_000853	TTTCTC	2	12	1657954	1657965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644422
36577	NC_000853	ACG	2	6	1658009	1658014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644422
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36580	NC_000853	GAAA	2	8	1658044	1658051	75 %	0 %	25 %	0 %	15644422
36581	NC_000853	AGA	2	6	1658120	1658125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644422
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36588	NC_000853	TTCC	2	8	1658425	1658432	0 %	50 %	0 %	50 %	15644422
36589	NC_000853	GAT	2	6	1658557	1658562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644423
36590	NC_000853	GGTGC	2	10	1658576	1658585	0 %	20 %	60 %	20 %	15644423
36591	NC_000853	GGT	2	6	1658587	1658592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644423
36592	NC_000853	CAG	2	6	1658654	1658659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644423
36593	NC_000853	AGA	2	6	1658669	1658674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644423
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36600	NC_000853	GTT	2	6	1658933	1658938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644423
36601	NC_000853	GAA	2	6	1659011	1659016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644423
36602	NC_000853	A	6	6	1659025	1659030	100 %	0 %	0 %	0 %	15644423
36603	NC_000853	G	6	6	1659034	1659039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36604	NC_000853	GTC	2	6	1659080	1659085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644424
36605	NC_000853	AGA	2	6	1659132	1659137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36606	NC_000853	ATC	2	6	1659170	1659175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644424
36607	NC_000853	AAG	2	6	1659231	1659236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36608	NC_000853	A	7	7	1659243	1659249	100 %	0 %	0 %	0 %	15644424
36609	NC_000853	GAA	2	6	1659254	1659259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36610	NC_000853	GAA	2	6	1659266	1659271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36611	NC_000853	TAC	2	6	1659353	1659358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644424
36612	NC_000853	GAA	2	6	1659419	1659424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36613	NC_000853	AGA	2	6	1659516	1659521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644424
36614	NC_000853	TTTC	2	8	1659573	1659580	0 %	75 %	0 %	25 %	15644424
36615	NC_000853	TCA	2	6	1659612	1659617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644424
36616	NC_000853	GAT	2	6	1659679	1659684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644424
36617	NC_000853	AAGA	2	8	1659698	1659705	75 %	0 %	25 %	0 %	15644424
36618	NC_000853	GAAA	2	8	1659759	1659766	75 %	0 %	25 %	0 %	15644424
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