MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_000853	GAA	2	6	1519480	1519485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33502	NC_000853	AAT	2	6	1519530	1519535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33503	NC_000853	GAT	2	6	1519537	1519542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33504	NC_000853	ACG	2	6	1519579	1519584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33505	NC_000853	TAG	2	6	1519610	1519615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33506	NC_000853	CTT	2	6	1519642	1519647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33507	NC_000853	TCT	2	6	1519729	1519734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33508	NC_000853	T	6	6	1519736	1519741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33509	NC_000853	TTCTT	2	10	1519749	1519758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33510	NC_000853	ATT	2	6	1519772	1519777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33511	NC_000853	CT	3	6	1519806	1519811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33512	NC_000853	TG	3	6	1519812	1519817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33513	NC_000853	GGA	2	6	1519838	1519843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33514	NC_000853	A	6	6	1519855	1519860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33515	NC_000853	GT	3	6	1519876	1519881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33516	NC_000853	ACTCAT	2	12	1520011	1520022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33517	NC_000853	CCCT	2	8	1520023	1520030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33518	NC_000853	CTT	2	6	1520214	1520219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33519	NC_000853	TCG	2	6	1520307	1520312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33520	NC_000853	AAT	2	6	1520383	1520388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33521	NC_000853	CTC	2	6	1520409	1520414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33522	NC_000853	T	7	7	1520517	1520523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33523	NC_000853	ATA	2	6	1520583	1520588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33524	NC_000853	TGG	2	6	1520611	1520616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644272
33525	NC_000853	TGA	2	6	1520620	1520625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644272
33526	NC_000853	TTA	2	6	1520816	1520821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644272
33527	NC_000853	CA	3	6	1520844	1520849	50 %	0 %	0 %	50 %	15644272
33528	NC_000853	TCT	2	6	1520880	1520885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644272
33529	NC_000853	TTTC	2	8	1520908	1520915	0 %	75 %	0 %	25 %	15644272
33530	NC_000853	CAC	2	6	1520922	1520927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644272
33531	NC_000853	ATCG	2	8	1520996	1521003	25 %	25 %	25 %	25 %	15644272
33532	NC_000853	CAA	2	6	1521035	1521040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644272
33533	NC_000853	AGA	2	6	1521065	1521070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644272
33534	NC_000853	GA	3	6	1521097	1521102	50 %	0 %	50 %	0 %	15644272
33535	NC_000853	GAA	2	6	1521179	1521184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644272
33536	NC_000853	GCC	2	6	1521222	1521227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644272
33537	NC_000853	GA	3	6	1521377	1521382	50 %	0 %	50 %	0 %	15644272
33538	NC_000853	TTC	2	6	1521396	1521401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644273
33539	NC_000853	TGG	2	6	1521405	1521410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644273
33540	NC_000853	GCTCT	2	10	1521419	1521428	0 %	40 %	20 %	40 %	15644273
33541	NC_000853	TCC	2	6	1521431	1521436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644273
33542	NC_000853	GGT	2	6	1521439	1521444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644273
33543	NC_000853	ACA	2	6	1521588	1521593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644273
33544	NC_000853	TTC	2	6	1521597	1521602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644273
33545	NC_000853	CTA	2	6	1521640	1521645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644273
33546	NC_000853	TTC	2	6	1521687	1521692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644273
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33549	NC_000853	TGGTT	2	10	1521843	1521852	0 %	60 %	40 %	0 %	15644273
33550	NC_000853	ACA	2	6	1521855	1521860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644273
33551	NC_000853	CGG	2	6	1521874	1521879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644273
33552	NC_000853	ACA	2	6	1521902	1521907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644273
33553	NC_000853	GGGAT	2	10	1521964	1521973	20 %	20 %	60 %	0 %	15644273
33554	NC_000853	ACA	2	6	1521992	1521997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644273
33555	NC_000853	AAG	2	6	1522005	1522010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644273
33556	NC_000853	AAG	2	6	1522064	1522069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644273
33557	NC_000853	ACA	2	6	1522148	1522153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644273
33558	NC_000853	GCG	2	6	1522154	1522159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644273
33559	NC_000853	AGT	2	6	1522274	1522279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33560	NC_000853	ATA	2	6	1522280	1522285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33561	NC_000853	TG	3	6	1522296	1522301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33562	NC_000853	GA	3	6	1522415	1522420	50 %	0 %	50 %	0 %	15644274
33563	NC_000853	AGA	2	6	1522424	1522429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644274
33564	NC_000853	CTA	2	6	1522644	1522649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644274
33565	NC_000853	ATC	2	6	1522702	1522707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644274
33566	NC_000853	AAT	2	6	1522806	1522811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644275
33567	NC_000853	ACC	2	6	1522957	1522962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644275
33568	NC_000853	T	6	6	1522964	1522969	0 %	100 %	0 %	0 %	15644275
33569	NC_000853	TGA	2	6	1523037	1523042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644275
33570	NC_000853	TTCT	2	8	1523044	1523051	0 %	75 %	0 %	25 %	15644275
33571	NC_000853	GAA	2	6	1523063	1523068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644275
33572	NC_000853	AGG	2	6	1523162	1523167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33573	NC_000853	GATA	2	8	1523168	1523175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33574	NC_000853	GCTG	2	8	1523247	1523254	0 %	25 %	50 %	25 %	15644276
33575	NC_000853	AACG	2	8	1523325	1523332	50 %	0 %	25 %	25 %	15644276
33576	NC_000853	ATT	2	6	1523333	1523338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644276
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33579	NC_000853	CTGCT	2	10	1523495	1523504	0 %	40 %	20 %	40 %	15644276
33580	NC_000853	CTGGT	2	10	1523519	1523528	0 %	40 %	40 %	20 %	15644276
33581	NC_000853	TAT	2	6	1523632	1523637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15644276
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33587	NC_000853	GA	3	6	1523963	1523968	50 %	0 %	50 %	0 %	15644276
33588	NC_000853	T	7	7	1524100	1524106	0 %	100 %	0 %	0 %	15644277
33589	NC_000853	TGG	2	6	1524147	1524152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644277
33590	NC_000853	T	6	6	1524175	1524180	0 %	100 %	0 %	0 %	15644277
33591	NC_000853	TCTT	2	8	1524193	1524200	0 %	75 %	0 %	25 %	15644277
33592	NC_000853	AGC	2	6	1524263	1524268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644277
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33595	NC_000853	TCC	2	6	1524311	1524316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644277
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33602	NC_000853	CTT	2	6	1524570	1524575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644277
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33605	NC_000853	TGC	2	6	1524707	1524712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33606	NC_000853	GGA	2	6	1524745	1524750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33613	NC_000853	ACC	2	6	1524958	1524963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644278
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33619	NC_000853	TGGA	2	8	1525146	1525153	25 %	25 %	50 %	0 %	15644278
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33622	NC_000853	AGA	2	6	1525265	1525270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644278
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33624	NC_000853	A	7	7	1525429	1525435	100 %	0 %	0 %	0 %	15644278
33625	NC_000853	CAT	2	6	1525504	1525509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644278
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33627	NC_000853	A	6	6	1525562	1525567	100 %	0 %	0 %	0 %	15644278
33628	NC_000853	TGAG	2	8	1525624	1525631	25 %	25 %	50 %	0 %	15644278
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33631	NC_000853	TGG	2	6	1525954	1525959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644279
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33635	NC_000853	CAT	2	6	1526072	1526077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644279
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33643	NC_000853	ATA	2	6	1526496	1526501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644279
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33646	NC_000853	A	6	6	1526631	1526636	100 %	0 %	0 %	0 %	15644279
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33650	NC_000853	TCA	2	6	1526898	1526903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644280
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33654	NC_000853	AGGA	2	8	1527167	1527174	50 %	0 %	50 %	0 %	15644280
33655	NC_000853	CA	3	6	1527186	1527191	50 %	0 %	0 %	50 %	15644280
33656	NC_000853	TGG	2	6	1527192	1527197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644280
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33659	NC_000853	CTT	2	6	1527413	1527418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644280
33660	NC_000853	ACA	2	6	1527471	1527476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15644280
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33664	NC_000853	TAC	2	6	1527695	1527700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644280
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33667	NC_000853	TGT	2	6	1528079	1528084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644281
33668	NC_000853	TTGT	2	8	1528164	1528171	0 %	75 %	25 %	0 %	15644281
33669	NC_000853	TATG	2	8	1528246	1528253	25 %	50 %	25 %	0 %	15644282
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33671	NC_000853	TG	3	6	1528280	1528285	0 %	50 %	50 %	0 %	15644282
33672	NC_000853	ACC	2	6	1528310	1528315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15644282
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33678	NC_000853	GCA	2	6	1528507	1528512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644282
33679	NC_000853	CTTT	2	8	1528701	1528708	0 %	75 %	0 %	25 %	15644283
33680	NC_000853	TCT	2	6	1528746	1528751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644283
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33682	NC_000853	ACG	2	6	1528792	1528797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644283
33683	NC_000853	AGC	2	6	1528862	1528867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644283
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33688	NC_000853	TGGAA	2	10	1529183	1529192	40 %	20 %	40 %	0 %	15644283
33689	NC_000853	CTT	2	6	1529236	1529241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644283
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33691	NC_000853	GA	3	6	1529327	1529332	50 %	0 %	50 %	0 %	15644283
33692	NC_000853	GAA	2	6	1529378	1529383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644283
33693	NC_000853	ATA	2	6	1529388	1529393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644283
33694	NC_000853	GA	3	6	1529408	1529413	50 %	0 %	50 %	0 %	15644283
33695	NC_000853	AAAATC	2	12	1529433	1529444	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15644283
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33697	NC_000853	TGTT	2	8	1529467	1529474	0 %	75 %	25 %	0 %	15644284
33698	NC_000853	TGT	2	6	1529501	1529506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644284
33699	NC_000853	GCG	2	6	1529589	1529594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644284
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33701	NC_000853	CGC	2	6	1529708	1529713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15644284
33702	NC_000853	GGGAT	2	10	1529732	1529741	20 %	20 %	60 %	0 %	15644284
33703	NC_000853	ACG	2	6	1529751	1529756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644284
33704	NC_000853	CAT	2	6	1529804	1529809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644284
33705	NC_000853	TGTGG	2	10	1529888	1529897	0 %	40 %	60 %	0 %	15644284
33706	NC_000853	CTT	2	6	1529955	1529960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644284
33707	NC_000853	A	8	8	1530049	1530056	100 %	0 %	0 %	0 %	15644284
33708	NC_000853	CTT	2	6	1530070	1530075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33709	NC_000853	CTC	2	6	1530117	1530122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644285
33710	NC_000853	TAC	3	9	1530144	1530152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644285
33711	NC_000853	TCC	2	6	1530170	1530175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644285
33712	NC_000853	TCC	2	6	1530198	1530203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15644285
33713	NC_000853	TGG	2	6	1530292	1530297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644285
33714	NC_000853	AAG	2	6	1530345	1530350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644285
33715	NC_000853	GGT	2	6	1530371	1530376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644285
33716	NC_000853	CTA	2	6	1530401	1530406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644285
33717	NC_000853	CGT	2	6	1530440	1530445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15644285
33718	NC_000853	GGAGAA	2	12	1530450	1530461	50 %	0 %	50 %	0 %	15644285
33719	NC_000853	AG	3	6	1530482	1530487	50 %	0 %	50 %	0 %	15644285
33720	NC_000853	AGCA	2	8	1530491	1530498	50 %	0 %	25 %	25 %	15644285
33721	NC_000853	AG	3	6	1530606	1530611	50 %	0 %	50 %	0 %	15644285
33722	NC_000853	GA	3	6	1530645	1530650	50 %	0 %	50 %	0 %	15644285
33723	NC_000853	CGA	2	6	1530652	1530657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644285
33724	NC_000853	TCT	2	6	1530802	1530807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644285
33725	NC_000853	ATG	2	6	1530861	1530866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644285
33726	NC_000853	GTG	2	6	1530887	1530892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644285
33727	NC_000853	TGA	2	6	1530908	1530913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644285
33728	NC_000853	TGG	2	6	1530934	1530939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644285
33729	NC_000853	TGA	2	6	1531051	1531056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15644285
33730	NC_000853	GAA	2	6	1531064	1531069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644285
33731	NC_000853	A	6	6	1531135	1531140	100 %	0 %	0 %	0 %	15644285
33732	NC_000853	A	6	6	1531155	1531160	100 %	0 %	0 %	0 %	15644285
33733	NC_000853	GAG	2	6	1531316	1531321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644285
33734	NC_000853	CTA	2	6	1531337	1531342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15644285
33735	NC_000853	TTTC	2	8	1531448	1531455	0 %	75 %	0 %	25 %	15644286
33736	NC_000853	GCTCT	2	10	1531490	1531499	0 %	40 %	20 %	40 %	15644286
33737	NC_000853	GCG	2	6	1531500	1531505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15644286
33738	NC_000853	GTT	2	6	1531554	1531559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15644286
33739	NC_000853	AGA	2	6	1531615	1531620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644286
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33741	NC_000853	AGA	2	6	1531667	1531672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15644286
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