MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_000853	CTT	2	6	1247336	1247341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643979
27503	NC_000853	CGT	2	6	1247365	1247370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643979
27504	NC_000853	GTT	2	6	1247432	1247437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643979
27505	NC_000853	TGGA	2	8	1247569	1247576	25 %	25 %	50 %	0 %	15643979
27506	NC_000853	TC	3	6	1247615	1247620	0 %	50 %	0 %	50 %	15643979
27507	NC_000853	AGAACG	2	12	1247658	1247669	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15643979
27508	NC_000853	ATTT	2	8	1247786	1247793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27509	NC_000853	ATT	2	6	1247797	1247802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27510	NC_000853	CAA	2	6	1247805	1247810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27511	NC_000853	GTT	2	6	1247825	1247830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643980
27512	NC_000853	CT	3	6	1247832	1247837	0 %	50 %	0 %	50 %	15643980
27513	NC_000853	GCT	2	6	1247864	1247869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643980
27514	NC_000853	GT	3	6	1247935	1247940	0 %	50 %	50 %	0 %	15643980
27515	NC_000853	CCT	2	6	1247996	1248001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643980
27516	NC_000853	TCA	2	6	1248071	1248076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643980
27517	NC_000853	AG	3	6	1248122	1248127	50 %	0 %	50 %	0 %	15643980
27518	NC_000853	AGAA	2	8	1248139	1248146	75 %	0 %	25 %	0 %	15643980
27519	NC_000853	AAC	2	6	1248157	1248162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643980
27520	NC_000853	CA	3	6	1248173	1248178	50 %	0 %	0 %	50 %	15643980
27521	NC_000853	TC	3	6	1248228	1248233	0 %	50 %	0 %	50 %	15643980
27522	NC_000853	GAT	3	9	1248271	1248279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643980
27523	NC_000853	CGT	2	6	1248369	1248374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643980
27524	NC_000853	ATG	3	9	1248458	1248466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643980
27525	NC_000853	TATC	2	8	1248477	1248484	25 %	50 %	0 %	25 %	15643980
27526	NC_000853	CAT	2	6	1248535	1248540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643980
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27528	NC_000853	ACG	2	6	1248770	1248775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643980
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27531	NC_000853	CTTC	2	8	1248932	1248939	0 %	50 %	0 %	50 %	15643981
27532	NC_000853	TCG	2	6	1248972	1248977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643981
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27542	NC_000853	CGAA	2	8	1249494	1249501	50 %	0 %	25 %	25 %	15643981
27543	NC_000853	GTC	2	6	1249547	1249552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643981
27544	NC_000853	GTA	2	6	1249568	1249573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643981
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27546	NC_000853	TCT	2	6	1249656	1249661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643981
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27551	NC_000853	TTC	2	6	1249874	1249879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643981
27552	NC_000853	CCT	2	6	1249928	1249933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27553	NC_000853	CCCA	2	8	1249946	1249953	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27554	NC_000853	ATTT	2	8	1249969	1249976	25 %	75 %	0 %	0 %	15643982
27555	NC_000853	CCA	2	6	1250019	1250024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643982
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27557	NC_000853	TC	3	6	1250153	1250158	0 %	50 %	0 %	50 %	15643982
27558	NC_000853	GTG	2	6	1250201	1250206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643982
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27585	NC_000853	CT	3	6	1251375	1251380	0 %	50 %	0 %	50 %	15643982
27586	NC_000853	AGTG	2	8	1251450	1251457	25 %	25 %	50 %	0 %	15643982
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27590	NC_000853	GAAAA	2	10	1251612	1251621	80 %	0 %	20 %	0 %	15643982
27591	NC_000853	CCT	2	6	1251663	1251668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643983
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27979	NC_000853	GAC	2	6	1269954	1269959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644001
27980	NC_000853	GAC	2	6	1269966	1269971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644001
27981	NC_000853	GGA	2	6	1269993	1269998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15644001
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27983	NC_000853	CTT	2	6	1270152	1270157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15644001
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