MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_000853	TTC	2	6	1088272	1088277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643831
24003	NC_000853	GAG	2	6	1088325	1088330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643831
24004	NC_000853	CGA	2	6	1088405	1088410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643831
24005	NC_000853	GAC	2	6	1088594	1088599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643831
24006	NC_000853	TGA	2	6	1088611	1088616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643831
24007	NC_000853	GA	3	6	1088647	1088652	50 %	0 %	50 %	0 %	15643831
24008	NC_000853	GTGA	2	8	1088655	1088662	25 %	25 %	50 %	0 %	15643831
24009	NC_000853	GGT	2	6	1088765	1088770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643831
24010	NC_000853	CCG	2	6	1088772	1088777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15643831
24011	NC_000853	A	6	6	1088805	1088810	100 %	0 %	0 %	0 %	15643831
24012	NC_000853	TGT	2	6	1088855	1088860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643831
24013	NC_000853	GGAA	2	8	1088879	1088886	50 %	0 %	50 %	0 %	15643831
24014	NC_000853	GA	3	6	1088961	1088966	50 %	0 %	50 %	0 %	15643831
24015	NC_000853	ACGA	2	8	1088973	1088980	50 %	0 %	25 %	25 %	15643831
24016	NC_000853	A	6	6	1089008	1089013	100 %	0 %	0 %	0 %	15643831
24017	NC_000853	GAA	2	6	1089056	1089061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643831
24018	NC_000853	ATT	2	6	1089064	1089069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643831
24019	NC_000853	ATC	2	6	1089075	1089080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643831
24020	NC_000853	AGA	2	6	1089131	1089136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643831
24021	NC_000853	GTG	2	6	1089318	1089323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643831
24022	NC_000853	TGA	2	6	1089349	1089354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643831
24023	NC_000853	GGT	2	6	1089383	1089388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643831
24024	NC_000853	GAA	2	6	1089518	1089523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643831
24025	NC_000853	GAA	2	6	1089549	1089554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643831
24026	NC_000853	GAG	2	6	1089659	1089664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643832
24027	NC_000853	CTT	2	6	1089712	1089717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24028	NC_000853	CT	3	6	1089752	1089757	0 %	50 %	0 %	50 %	15643832
24029	NC_000853	GAG	2	6	1089758	1089763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643832
24030	NC_000853	AAG	2	6	1089778	1089783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24031	NC_000853	GGA	2	6	1089860	1089865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643832
24032	NC_000853	GATCA	2	10	1089923	1089932	40 %	20 %	20 %	20 %	15643832
24033	NC_000853	AGA	2	6	1089937	1089942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24034	NC_000853	GAA	2	6	1089974	1089979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24035	NC_000853	AG	3	6	1090055	1090060	50 %	0 %	50 %	0 %	15643832
24036	NC_000853	AC	3	6	1090085	1090090	50 %	0 %	0 %	50 %	15643832
24037	NC_000853	GA	3	6	1090091	1090096	50 %	0 %	50 %	0 %	15643832
24038	NC_000853	A	6	6	1090100	1090105	100 %	0 %	0 %	0 %	15643832
24039	NC_000853	AGA	2	6	1090264	1090269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24040	NC_000853	CTT	2	6	1090273	1090278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24041	NC_000853	TTC	2	6	1090313	1090318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24042	NC_000853	CGA	2	6	1090326	1090331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643832
24043	NC_000853	GTG	2	6	1090369	1090374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643832
24044	NC_000853	GAA	2	6	1090376	1090381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24045	NC_000853	AGA	2	6	1090414	1090419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
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24049	NC_000853	GAA	2	6	1090564	1090569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24050	NC_000853	GAGAG	2	10	1090699	1090708	40 %	0 %	60 %	0 %	15643832
24051	NC_000853	TCT	2	6	1090734	1090739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24052	NC_000853	TGG	2	6	1090751	1090756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643832
24053	NC_000853	CA	3	6	1090807	1090812	50 %	0 %	0 %	50 %	15643832
24054	NC_000853	AG	4	8	1090818	1090825	50 %	0 %	50 %	0 %	15643832
24055	NC_000853	GTG	2	6	1090861	1090866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643832
24056	NC_000853	TG	3	6	1090865	1090870	0 %	50 %	50 %	0 %	15643832
24057	NC_000853	CGA	2	6	1090966	1090971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643832
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24062	NC_000853	TTC	2	6	1091153	1091158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24063	NC_000853	GGAA	2	8	1091170	1091177	50 %	0 %	50 %	0 %	15643832
24064	NC_000853	GAA	2	6	1091184	1091189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
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24067	NC_000853	ACGAAA	2	12	1091279	1091290	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15643832
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24071	NC_000853	TGG	2	6	1091451	1091456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643832
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24074	NC_000853	TGAAG	2	10	1091608	1091617	40 %	20 %	40 %	0 %	15643832
24075	NC_000853	TTC	2	6	1091634	1091639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24076	NC_000853	TCG	2	6	1091796	1091801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643832
24077	NC_000853	GAGGT	2	10	1091846	1091855	20 %	20 %	60 %	0 %	15643832
24078	NC_000853	GAAA	2	8	1091858	1091865	75 %	0 %	25 %	0 %	15643832
24079	NC_000853	GTT	2	6	1091957	1091962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643832
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24083	NC_000853	GACGA	2	10	1092092	1092101	40 %	0 %	40 %	20 %	15643832
24084	NC_000853	A	6	6	1092206	1092211	100 %	0 %	0 %	0 %	15643832
24085	NC_000853	GGC	2	6	1092253	1092258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15643832
24086	NC_000853	GATA	2	8	1092319	1092326	50 %	25 %	25 %	0 %	15643832
24087	NC_000853	A	6	6	1092349	1092354	100 %	0 %	0 %	0 %	15643832
24088	NC_000853	AC	3	6	1092378	1092383	50 %	0 %	0 %	50 %	15643832
24089	NC_000853	GAG	2	6	1092425	1092430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643832
24090	NC_000853	AGA	2	6	1092437	1092442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643832
24091	NC_000853	CAC	2	6	1092467	1092472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643832
24092	NC_000853	CTG	2	6	1092488	1092493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643832
24093	NC_000853	CTT	2	6	1092528	1092533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643832
24094	NC_000853	TCT	2	6	1092552	1092557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24098	NC_000853	CTCGAT	2	12	1092676	1092687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15643833
24099	NC_000853	CCT	2	6	1092717	1092722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643833
24100	NC_000853	TCT	2	6	1092821	1092826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643833
24101	NC_000853	CGA	2	6	1092840	1092845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643833
24102	NC_000853	TCA	2	6	1092852	1092857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643833
24103	NC_000853	TGG	2	6	1092865	1092870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643833
24104	NC_000853	GAT	2	6	1092916	1092921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643833
24105	NC_000853	TTC	2	6	1092955	1092960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643833
24106	NC_000853	TCT	2	6	1093080	1093085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643833
24107	NC_000853	TCT	2	6	1093124	1093129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643833
24108	NC_000853	GTG	2	6	1093146	1093151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643833
24109	NC_000853	GGAA	2	8	1093324	1093331	50 %	0 %	50 %	0 %	15643833
24110	NC_000853	GT	3	6	1093337	1093342	0 %	50 %	50 %	0 %	15643833
24111	NC_000853	TC	4	8	1093377	1093384	0 %	50 %	0 %	50 %	15643833
24112	NC_000853	TC	3	6	1093387	1093392	0 %	50 %	0 %	50 %	15643833
24113	NC_000853	TCT	2	6	1093436	1093441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643833
24114	NC_000853	CCA	2	6	1093467	1093472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643833
24115	NC_000853	CGA	2	6	1093542	1093547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24116	NC_000853	TCC	2	6	1093666	1093671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643834
24117	NC_000853	GT	3	6	1093681	1093686	0 %	50 %	50 %	0 %	15643834
24118	NC_000853	CACCC	2	10	1093754	1093763	20 %	0 %	0 %	80 %	15643834
24119	NC_000853	AAG	2	6	1093884	1093889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643834
24120	NC_000853	CGA	2	6	1094088	1094093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643835
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24122	NC_000853	TCT	2	6	1094109	1094114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643835
24123	NC_000853	ATC	2	6	1094192	1094197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643835
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24125	NC_000853	CTG	2	6	1094281	1094286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643835
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24231	NC_000853	CGCC	2	8	1098611	1098618	0 %	0 %	25 %	75 %	15643842
24232	NC_000853	TTC	2	6	1098651	1098656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643842
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24238	NC_000853	TGC	2	6	1098873	1098878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643842
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24241	NC_000853	CAA	2	6	1099126	1099131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643842
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24243	NC_000853	CTT	2	6	1099212	1099217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643842
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24303	NC_000853	GTA	2	6	1102164	1102169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643843
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24306	NC_000853	CTAT	2	8	1102218	1102225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24342	NC_000853	CA	3	6	1103699	1103704	50 %	0 %	0 %	50 %	15643845
24343	NC_000853	GAT	2	6	1103724	1103729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643845
24344	NC_000853	AT	3	6	1103736	1103741	50 %	50 %	0 %	0 %	15643845
24345	NC_000853	CAGATA	2	12	1103763	1103774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15643845
24346	NC_000853	A	7	7	1103803	1103809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24347	NC_000853	A	6	6	1103811	1103816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24348	NC_000853	GTCGTG	2	12	1103894	1103905	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24349	NC_000853	GTG	2	6	1103960	1103965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24350	NC_000853	ACGA	2	8	1104035	1104042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24351	NC_000853	TTC	2	6	1104056	1104061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24352	NC_000853	GAA	2	6	1104143	1104148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24353	NC_000853	CCG	2	6	1104171	1104176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24354	NC_000853	TCA	2	6	1104204	1104209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24355	NC_000853	GAA	2	6	1104218	1104223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24356	NC_000853	ATA	2	6	1104235	1104240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15644627
24357	NC_000853	ACG	2	6	1104253	1104258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15644627
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24359	NC_000853	TGG	2	6	1104428	1104433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15644627
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24372	NC_000853	AGGA	2	8	1105124	1105131	50 %	0 %	50 %	0 %	15643846
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24387	NC_000853	TCT	2	6	1105899	1105904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643846
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24389	NC_000853	ATG	2	6	1105930	1105935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643846
24390	NC_000853	TGG	2	6	1105947	1105952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643846
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24392	NC_000853	ATC	2	6	1106002	1106007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643846
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24397	NC_000853	TC	3	6	1106220	1106225	0 %	50 %	0 %	50 %	15643846
24398	NC_000853	GGTG	2	8	1106253	1106260	0 %	25 %	75 %	0 %	15643846
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24405	NC_000853	TAC	3	9	1106694	1106702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643847
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24442	NC_000853	GAA	2	6	1108744	1108749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643849
24443	NC_000853	TGG	2	6	1108756	1108761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643849
24444	NC_000853	A	6	6	1108768	1108773	100 %	0 %	0 %	0 %	15643849
24445	NC_000853	TCT	2	6	1108959	1108964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643849
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24447	NC_000853	CAG	2	6	1109025	1109030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24450	NC_000853	TTC	2	6	1109303	1109308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643850
24451	NC_000853	CGAA	2	8	1109313	1109320	50 %	0 %	25 %	25 %	15643850
24452	NC_000853	A	6	6	1109354	1109359	100 %	0 %	0 %	0 %	15643850
24453	NC_000853	GA	4	8	1109371	1109378	50 %	0 %	50 %	0 %	15643850
24454	NC_000853	ATC	2	6	1109462	1109467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643850
24455	NC_000853	TA	3	6	1109528	1109533	50 %	50 %	0 %	0 %	15643850
24456	NC_000853	ACG	2	6	1109535	1109540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643850
24457	NC_000853	GATA	2	8	1109684	1109691	50 %	25 %	25 %	0 %	15643850
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24459	NC_000853	GGA	2	6	1109716	1109721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643850
24460	NC_000853	ACAG	2	8	1109731	1109738	50 %	0 %	25 %	25 %	15643850
24461	NC_000853	TC	3	6	1109752	1109757	0 %	50 %	0 %	50 %	15643850
24462	NC_000853	TTC	2	6	1109788	1109793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643850
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24464	NC_000853	GTT	2	6	1109876	1109881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643850
24465	NC_000853	TG	3	6	1109899	1109904	0 %	50 %	50 %	0 %	15643850
24466	NC_000853	TACA	2	8	1109962	1109969	50 %	25 %	0 %	25 %	15643850
24467	NC_000853	AG	3	6	1110012	1110017	50 %	0 %	50 %	0 %	15643850
24468	NC_000853	CGA	2	6	1110106	1110111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643850
24469	NC_000853	TTC	2	6	1110113	1110118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643850
24470	NC_000853	GTG	2	6	1110153	1110158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643850
24471	NC_000853	CGA	2	6	1110217	1110222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643850
24472	NC_000853	TGG	2	6	1110258	1110263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15643850
24473	NC_000853	TAC	2	6	1110329	1110334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643850
24474	NC_000853	TCT	2	6	1110366	1110371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643850
24475	NC_000853	AAAG	2	8	1110382	1110389	75 %	0 %	25 %	0 %	15643850
24476	NC_000853	GAA	3	9	1110434	1110442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643850
24477	NC_000853	TGA	2	6	1110450	1110455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643850
24478	NC_000853	CG	3	6	1110610	1110615	0 %	0 %	50 %	50 %	15643850
24479	NC_000853	AG	3	6	1110685	1110690	50 %	0 %	50 %	0 %	15643850
24480	NC_000853	AGA	2	6	1110723	1110728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643851
24481	NC_000853	AG	3	6	1110827	1110832	50 %	0 %	50 %	0 %	15643851
24482	NC_000853	GTT	2	6	1110857	1110862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643851
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