MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 41002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_000853	CTAT	2	8	661047	661054	25 %	50 %	0 %	25 %	15643391
14502	NC_000853	GAA	2	6	661118	661123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643391
14503	NC_000853	AATA	2	8	661256	661263	75 %	25 %	0 %	0 %	15643391
14504	NC_000853	TGT	2	6	661282	661287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643391
14505	NC_000853	GAA	2	6	661304	661309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643392
14506	NC_000853	A	6	6	661391	661396	100 %	0 %	0 %	0 %	15643392
14507	NC_000853	CA	3	6	661427	661432	50 %	0 %	0 %	50 %	15643392
14508	NC_000853	CT	4	8	661446	661453	0 %	50 %	0 %	50 %	15643392
14509	NC_000853	T	6	6	661458	661463	0 %	100 %	0 %	0 %	15643392
14510	NC_000853	CAC	2	6	661464	661469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643392
14511	NC_000853	TC	3	6	661478	661483	0 %	50 %	0 %	50 %	15643392
14512	NC_000853	CAC	2	6	661499	661504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643392
14513	NC_000853	ACC	2	6	661506	661511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643392
14514	NC_000853	TCA	2	6	661621	661626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643392
14515	NC_000853	A	6	6	661650	661655	100 %	0 %	0 %	0 %	15643392
14516	NC_000853	TTC	2	6	661672	661677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643392
14517	NC_000853	TGA	2	6	661826	661831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643392
14518	NC_000853	ATT	2	6	661843	661848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643392
14519	NC_000853	TTA	2	6	661855	661860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643392
14520	NC_000853	AAC	2	6	661926	661931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643392
14521	NC_000853	TGT	2	6	661942	661947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643392
14522	NC_000853	AAAT	2	8	662011	662018	75 %	25 %	0 %	0 %	15643392
14523	NC_000853	ATAGT	2	10	662118	662127	40 %	40 %	20 %	0 %	15643392
14524	NC_000853	GTT	2	6	662142	662147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643392
14525	NC_000853	AT	3	6	662151	662156	50 %	50 %	0 %	0 %	15643392
14526	NC_000853	AAT	2	6	662180	662185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643392
14527	NC_000853	T	6	6	662193	662198	0 %	100 %	0 %	0 %	15643392
14528	NC_000853	GAT	2	6	662234	662239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643392
14529	NC_000853	TCCT	2	8	662255	662262	0 %	50 %	0 %	50 %	15643392
14530	NC_000853	ATA	2	6	662302	662307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643392
14531	NC_000853	TAA	2	6	662361	662366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643392
14532	NC_000853	T	6	6	662387	662392	0 %	100 %	0 %	0 %	15643392
14533	NC_000853	AGA	2	6	662414	662419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643392
14534	NC_000853	T	6	6	662420	662425	0 %	100 %	0 %	0 %	15643392
14535	NC_000853	TCC	2	6	662477	662482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643392
14536	NC_000853	T	6	6	662494	662499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_000853	TAAA	2	8	662545	662552	75 %	25 %	0 %	0 %	15643393
14538	NC_000853	A	6	6	662575	662580	100 %	0 %	0 %	0 %	15643393
14539	NC_000853	TCTT	2	8	662612	662619	0 %	75 %	0 %	25 %	15643393
14540	NC_000853	TAA	2	6	662625	662630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643393
14541	NC_000853	CTTT	2	8	662810	662817	0 %	75 %	0 %	25 %	15643393
14542	NC_000853	T	7	7	662908	662914	0 %	100 %	0 %	0 %	15643393
14543	NC_000853	TCAAT	2	10	662988	662997	40 %	40 %	0 %	20 %	15643393
14544	NC_000853	CTT	2	6	663069	663074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643393
14545	NC_000853	TCG	2	6	663086	663091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643393
14546	NC_000853	AAC	2	6	663092	663097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643393
14547	NC_000853	TTG	2	6	663225	663230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15643393
14548	NC_000853	CCTT	2	8	663251	663258	0 %	50 %	0 %	50 %	15643393
14549	NC_000853	CTTTT	2	10	663315	663324	0 %	80 %	0 %	20 %	15643393
14550	NC_000853	AACA	2	8	663364	663371	75 %	0 %	0 %	25 %	15643393
14551	NC_000853	TTC	2	6	663397	663402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643393
14552	NC_000853	ATT	2	6	663413	663418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643393
14553	NC_000853	CAT	2	6	663474	663479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643393
14554	NC_000853	AAT	2	6	663494	663499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643393
14555	NC_000853	AGA	2	6	663547	663552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643393
14556	NC_000853	ATTC	2	8	663569	663576	25 %	50 %	0 %	25 %	15643394
14557	NC_000853	ACC	2	6	663577	663582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643394
14558	NC_000853	TTA	2	6	663583	663588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643394
14559	NC_000853	TA	3	6	663587	663592	50 %	50 %	0 %	0 %	15643394
14560	NC_000853	AAT	2	6	663686	663691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643394
14561	NC_000853	T	8	8	663703	663710	0 %	100 %	0 %	0 %	15643394
14562	NC_000853	GATAA	2	10	663724	663733	60 %	20 %	20 %	0 %	15643394
14563	NC_000853	TAA	2	6	663869	663874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643394
14564	NC_000853	CAA	2	6	663905	663910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643394
14565	NC_000853	TA	3	6	663948	663953	50 %	50 %	0 %	0 %	15643394
14566	NC_000853	TCA	2	6	664001	664006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643394
14567	NC_000853	GAA	2	6	664013	664018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643394
14568	NC_000853	ATA	2	6	664019	664024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643394
14569	NC_000853	ATATTA	2	12	664046	664057	50 %	50 %	0 %	0 %	15643394
14570	NC_000853	A	7	7	664096	664102	100 %	0 %	0 %	0 %	15643394
14571	NC_000853	A	6	6	664111	664116	100 %	0 %	0 %	0 %	15643394
14572	NC_000853	CAAAA	2	10	664128	664137	80 %	0 %	0 %	20 %	15643394
14573	NC_000853	ACTTGC	2	12	664146	664157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15643394
14574	NC_000853	TAA	2	6	664228	664233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643394
14575	NC_000853	ATC	2	6	664237	664242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643394
14576	NC_000853	A	6	6	664248	664253	100 %	0 %	0 %	0 %	15643394
14577	NC_000853	GGCT	2	8	664275	664282	0 %	25 %	50 %	25 %	15643394
14578	NC_000853	TTC	2	6	664307	664312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643394
14579	NC_000853	T	7	7	664356	664362	0 %	100 %	0 %	0 %	15643394
14580	NC_000853	ATT	2	6	664444	664449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643394
14581	NC_000853	TAT	2	6	664458	664463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15643394
14582	NC_000853	TA	3	6	664476	664481	50 %	50 %	0 %	0 %	15643394
14583	NC_000853	ATC	2	6	664576	664581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643394
14584	NC_000853	AGA	2	6	664674	664679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643394
14585	NC_000853	GAA	2	6	664722	664727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643394
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14587	NC_000853	T	7	7	664873	664879	0 %	100 %	0 %	0 %	15643395
14588	NC_000853	CTTT	2	8	664962	664969	0 %	75 %	0 %	25 %	15643395
14589	NC_000853	CTTGG	2	10	664994	665003	0 %	40 %	40 %	20 %	15643395
14590	NC_000853	TTC	2	6	665013	665018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643395
14591	NC_000853	GTTC	2	8	665055	665062	0 %	50 %	25 %	25 %	15643395
14592	NC_000853	CTTCC	2	10	665091	665100	0 %	40 %	0 %	60 %	15643395
14593	NC_000853	CAA	2	6	665152	665157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643395
14594	NC_000853	CAA	2	6	665163	665168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15643395
14595	NC_000853	GAA	2	6	665308	665313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643395
14596	NC_000853	AGG	2	6	665409	665414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643395
14597	NC_000853	AT	3	6	665506	665511	50 %	50 %	0 %	0 %	15643395
14598	NC_000853	A	6	6	665596	665601	100 %	0 %	0 %	0 %	15643395
14599	NC_000853	CT	3	6	665643	665648	0 %	50 %	0 %	50 %	15643395
14600	NC_000853	CAG	2	6	665686	665691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15643395
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14603	NC_000853	CAC	2	6	665808	665813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15643395
14604	NC_000853	CT	3	6	665826	665831	0 %	50 %	0 %	50 %	15643395
14605	NC_000853	TAA	2	6	665840	665845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643395
14606	NC_000853	CAT	2	6	665866	665871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15643395
14607	NC_000853	CTC	2	6	665878	665883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15643396
14608	NC_000853	T	6	6	665900	665905	0 %	100 %	0 %	0 %	15643396
14609	NC_000853	CTG	2	6	665915	665920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643396
14610	NC_000853	GGA	2	6	665928	665933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15643396
14611	NC_000853	TCT	2	6	665941	665946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643396
14612	NC_000853	TTCC	2	8	665962	665969	0 %	50 %	0 %	50 %	15643396
14613	NC_000853	CT	3	6	665976	665981	0 %	50 %	0 %	50 %	15643396
14614	NC_000853	GAA	2	6	666005	666010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15643396
14615	NC_000853	TCT	2	6	666011	666016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643396
14616	NC_000853	CTG	2	6	666125	666130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15643396
14617	NC_000853	ATA	2	6	666133	666138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15643396
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14620	NC_000853	GAT	2	6	666324	666329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643396
14621	NC_000853	ATTC	2	8	666356	666363	25 %	50 %	0 %	25 %	15643396
14622	NC_000853	ATTT	2	8	666462	666469	25 %	75 %	0 %	0 %	15643396
14623	NC_000853	TTC	2	6	666524	666529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643396
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14999	NC_000853	ATG	2	6	683659	683664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15643416
15000	NC_000853	TCT	2	6	683687	683692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15643416

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