MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 1142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	TGC	3	9	51	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187147	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187147	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187147	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187147	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187147	AACC	2	8	1884	1891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187147	CGAT	2	8	1906	1913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187147	CCCAAT	2	12	1923	1934	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187147	CG	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NT_187147	GCC	3	9	2173	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187147	CGC	3	9	2214	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187147	GGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187147	TC	3	6	3950	3955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187147	A	7	7	3957	3963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187147	CTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187147	CAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187147	CGC	3	9	4183	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NT_187147	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187147	CGTGG	2	10	5781	5790	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NT_187147	ATC	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187147	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187147	TG	3	6	5814	5819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187147	ACG	3	9	5879	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187147	CGGAG	2	10	5919	5928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NT_187147	ATC	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187147	GGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187147	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NT_187147	ACCTT	2	10	7051	7060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NT_187147	AGC	2	6	7099	7104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187147	CT	3	6	7116	7121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187147	TCCC	2	8	7140	7147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NT_187147	G	6	6	7153	7158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187147	TGCT	2	8	7437	7444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187147	CGTC	2	8	7489	7496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187147	CTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187147	GAG	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187147	GCC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187147	CAAG	2	8	7636	7643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187147	CGT	2	6	10833	10838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187147	GAG	2	6	10843	10848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187147	CCG	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187147	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187147	TGC	2	6	11955	11960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187147	CCA	2	6	12031	12036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187147	GGC	2	6	12058	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187147	CAG	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187147	ATAA	2	8	12097	12104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187147	ACC	2	6	12131	12136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187147	CAC	2	6	12157	12162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187147	TC	3	6	12310	12315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NT_187147	TCG	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187147	GAC	2	6	12381	12386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187147	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NT_187147	GGC	2	6	13327	13332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187147	GACCG	2	10	13443	13452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NT_187147	AAGGG	2	10	13468	13477	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187147	GGGC	2	8	13481	13488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187147	GCA	2	6	14235	14240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187147	GCA	2	6	15261	15266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187147	AGA	2	6	15864	15869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187147	CGG	2	6	15881	15886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187147	TAT	2	6	16357	16362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187147	TGA	2	6	16363	16368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187147	TCA	2	6	18431	18436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187147	CAT	2	6	18553	18558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187147	ATT	2	6	18566	18571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187147	GCC	2	6	18616	18621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NT_187147	CGG	3	9	18658	18666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187147	GAC	2	6	20088	20093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187147	CTTC	2	8	20135	20142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187147	CGA	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187147	TATC	2	8	21307	21314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187147	ACCC	2	8	21337	21344	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NT_187147	ATCT	2	8	21368	21375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NT_187147	CAG	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187147	CCG	2	6	21423	21428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187147	CGC	2	6	23136	23141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NT_187147	GC	3	6	23160	23165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187147	GCG	2	6	23358	23363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187147	TTCG	2	8	23423	23430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NT_187147	CGC	2	6	23540	23545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_187147	CCG	2	6	24117	24122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187147	CGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NT_187147	GCTG	2	8	24171	24178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NT_187147	GAA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187147	CGA	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187147	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187147	GTTT	2	8	24355	24362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187147	TCGG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NT_187147	GGA	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187147	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NT_187147	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NT_187147	TTCTT	2	10	26435	26444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NT_187147	AGG	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187147	CGG	2	6	26522	26527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187147	GCT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187147	GCT	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187147	TGC	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187147	TTAA	2	8	27921	27928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187147	CGCC	2	8	27962	27969	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NT_187147	CCT	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NT_187147	TGCG	2	8	28539	28546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NT_187147	CTG	2	6	30146	30151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187147	A	7	7	30165	30171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187147	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187147	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NT_187147	GAGC	2	8	31654	31661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NT_187147	CTCTT	2	10	31701	31710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NT_187147	AGA	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187147	GCG	2	6	31886	31891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187147	GCA	2	6	31905	31910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187147	GC	3	6	32937	32942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NT_187147	ACG	2	6	33050	33055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187147	GCC	2	6	33071	33076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NT_187147	AG	3	6	37180	37185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187147	CGC	3	9	37868	37876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187147	ACG	2	6	37934	37939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187147	CTCC	2	8	38006	38013	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NT_187147	CAC	2	6	38016	38021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187147	GCC	2	6	38070	38075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NT_187147	TCA	2	6	38105	38110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187147	CGA	2	6	38118	38123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187147	TCG	2	6	38133	38138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187147	GCC	2	6	38152	38157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NT_187147	GCA	2	6	38165	38170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187147	CGG	2	6	38181	38186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187147	GGC	2	6	38190	38195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187147	GCCT	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NT_187147	CCG	2	6	38308	38313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187147	GCC	2	6	38333	38338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NT_187147	CTC	2	6	38503	38508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NT_187147	A	6	6	38598	38603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187147	TTGTAT	2	12	38696	38707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187147	CAG	2	6	38709	38714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187147	CG	4	8	38755	38762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NT_187147	A	6	6	38811	38816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187147	GAAC	2	8	38954	38961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NT_187147	TG	3	6	38995	39000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187147	AGCGGC	2	12	39661	39672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187147	A	6	6	41371	41376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187147	TGT	2	6	44721	44726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187147	GAA	2	6	44731	44736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187147	CTGA	2	8	44746	44753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NT_187147	GAT	2	6	44760	44765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187147	CGC	2	6	44768	44773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NT_187147	AGG	2	6	44898	44903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NT_187147	TGT	2	6	45048	45053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NT_187147	CGG	3	9	46934	46942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NT_187147	CTGC	2	8	47036	47043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NT_187147	CGC	2	6	47086	47091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NT_187147	CGGA	2	8	47141	47148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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169	NT_187147	GCA	2	6	48078	48083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NT_187147	CCA	2	6	48189	48194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NT_187147	CGT	2	6	48565	48570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NT_187147	TGC	2	6	48600	48605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NT_187147	CGC	2	6	48678	48683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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190	NT_187147	TCC	3	9	49859	49867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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272	NT_187147	CTA	2	6	61846	61851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NT_187147	CATGA	2	10	61958	61967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NT_187147	TGCT	2	8	62779	62786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
275	NT_187147	T	6	6	62856	62861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NT_187147	GGCT	2	8	62874	62881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
277	NT_187147	TGC	2	6	63000	63005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NT_187147	CTGG	2	8	63063	63070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
279	NT_187147	GCC	2	6	63114	63119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
280	NT_187147	GCA	2	6	63163	63168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NT_187147	A	7	7	63186	63192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NT_187147	CGAT	2	8	63197	63204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NT_187147	CGA	2	6	63212	63217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NT_187147	GCAC	2	8	63303	63310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
285	NT_187147	GCC	2	6	63346	63351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NT_187147	AAC	2	6	63414	63419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NT_187147	GAT	2	6	63499	63504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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420	NT_187147	GTGGC	2	10	110775	110784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
421	NT_187147	CCA	2	6	110850	110855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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423	NT_187147	CGG	2	6	110966	110971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NT_187147	TTC	2	6	111085	111090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NT_187147	GAGCC	2	10	111224	111233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
428	NT_187147	GTC	2	6	111311	111316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NT_187147	CGC	2	6	112078	112083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NT_187147	CTG	2	6	112091	112096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NT_187147	GCC	2	6	117285	117290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NT_187147	TGA	2	6	117493	117498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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461	NT_187147	TCAA	2	8	117625	117632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NT_187147	GCA	2	6	117644	117649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NT_187147	AACT	2	8	121397	121404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NT_187147	TG	3	6	121488	121493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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492	NT_187147	TCA	2	6	126769	126774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NT_187147	CG	3	6	126795	126800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NT_187147	GATC	2	8	126839	126846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NT_187147	GCCC	2	8	127816	127823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NT_187147	GCA	2	6	127920	127925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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