MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 1142

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187147	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NT_187147	GTCG	2	8	245193	245200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NT_187147	GGA	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NT_187147	AGG	2	6	246576	246581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NT_187147	CGG	2	6	246721	246726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NT_187147	CGT	2	6	246758	246763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NT_187147	CCT	2	6	246776	246781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NT_187147	ACG	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NT_187147	CGGG	2	8	246828	246835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1010	NT_187147	TAGCT	2	10	248021	248030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1011	NT_187147	CCG	2	6	248062	248067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NT_187147	GCG	2	6	248086	248091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NT_187147	TCAA	2	8	248107	248114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NT_187147	TCC	2	6	248133	248138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NT_187147	TCG	2	6	248142	248147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NT_187147	CGG	2	6	248175	248180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NT_187147	GC	3	6	248208	248213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NT_187147	CGA	2	6	248214	248219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NT_187147	CCG	2	6	248230	248235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NT_187147	GC	3	6	248258	248263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NT_187147	TCT	2	6	248602	248607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NT_187147	GC	3	6	248623	248628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NT_187147	CTA	2	6	248631	248636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NT_187147	TCA	2	6	248647	248652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NT_187147	TTG	2	6	248653	248658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NT_187147	CG	3	6	248806	248811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NT_187147	GCC	2	6	248816	248821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NT_187147	CAT	2	6	248826	248831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NT_187147	CGGT	2	8	251392	251399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1030	NT_187147	CG	3	6	251411	251416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NT_187147	TTCG	2	8	251456	251463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NT_187147	A	6	6	251494	251499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NT_187147	GAA	2	6	251612	251617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NT_187147	GCC	2	6	251708	251713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NT_187147	GAT	2	6	251721	251726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NT_187147	GAA	2	6	251763	251768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NT_187147	GCC	2	6	251905	251910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NT_187147	GCA	2	6	251987	251992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NT_187147	GCGG	2	8	252025	252032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1040	NT_187147	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NT_187147	T	6	6	252057	252062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NT_187147	CTC	2	6	252112	252117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NT_187147	AG	3	6	252166	252171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NT_187147	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NT_187147	AGT	2	6	252231	252236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NT_187147	A	6	6	252271	252276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NT_187147	GCGA	2	8	252332	252339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NT_187147	GCCT	2	8	252425	252432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NT_187147	ATTG	2	8	253234	253241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NT_187147	GCC	2	6	253312	253317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NT_187147	CCA	2	6	253341	253346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NT_187147	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NT_187147	ACA	3	9	255111	255119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NT_187147	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NT_187147	ATA	2	6	255202	255207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NT_187147	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1057	NT_187147	TTG	2	6	255280	255285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NT_187147	CTC	2	6	255309	255314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NT_187147	CAG	2	6	255320	255325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NT_187147	CGT	2	6	255362	255367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NT_187147	TC	3	6	255456	255461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NT_187147	TGAC	2	8	257427	257434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NT_187147	CAG	2	6	257441	257446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NT_187147	CCGT	2	8	258766	258773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NT_187147	TGC	2	6	260029	260034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NT_187147	GTC	2	6	260092	260097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NT_187147	GTTG	2	8	260118	260125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NT_187147	AGTG	2	8	260139	260146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NT_187147	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NT_187147	TTC	2	6	260206	260211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NT_187147	TCT	2	6	260223	260228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NT_187147	ATTG	2	8	260254	260261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NT_187147	TGA	2	6	260324	260329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NT_187147	CGG	2	6	260345	260350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NT_187147	GCCA	2	8	260365	260372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NT_187147	CGA	2	6	261088	261093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NT_187147	AGG	2	6	262440	262445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NT_187147	CGG	2	6	262585	262590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NT_187147	CGT	2	6	262622	262627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NT_187147	CCT	2	6	262640	262645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NT_187147	ACG	2	6	262675	262680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NT_187147	CGGG	2	8	262692	262699	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1083	NT_187147	CAG	2	6	264060	264065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NT_187147	CGA	2	6	264080	264085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NT_187147	A	6	6	264184	264189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NT_187147	TGC	2	6	264304	264309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NT_187147	CAA	2	6	264371	264376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NT_187147	AGG	2	6	264406	264411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NT_187147	CCG	2	6	264438	264443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NT_187147	CCG	2	6	264453	264458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NT_187147	GAG	2	6	264475	264480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NT_187147	CAG	2	6	264527	264532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NT_187147	GCG	2	6	264559	264564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NT_187147	GATG	2	8	264607	264614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NT_187147	GAA	2	6	264658	264663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NT_187147	AGC	2	6	264705	264710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NT_187147	TCG	2	6	264737	264742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NT_187147	TTGC	2	8	265580	265587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NT_187147	CG	3	6	265622	265627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NT_187147	CTC	2	6	265702	265707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NT_187147	GC	3	6	265746	265751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NT_187147	CCG	2	6	265754	265759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NT_187147	CAT	2	6	265778	265783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NT_187147	CT	3	6	265966	265971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NT_187147	ATTT	2	8	266029	266036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NT_187147	TGC	2	6	266052	266057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NT_187147	GGT	2	6	266198	266203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NT_187147	GCG	2	6	266307	266312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NT_187147	ACG	2	6	266413	266418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NT_187147	CCT	2	6	266487	266492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NT_187147	AT	3	6	266550	266555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NT_187147	CT	3	6	266605	266610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NT_187147	GAG	2	6	266611	266616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NT_187147	TGA	2	6	266936	266941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NT_187147	GAG	2	6	266947	266952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NT_187147	GGC	2	6	267031	267036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NT_187147	GCC	2	6	267110	267115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NT_187147	GC	3	6	268468	268473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NT_187147	TCCTGC	2	12	268544	268555	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1120	NT_187147	GAT	2	6	268592	268597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NT_187147	GGA	2	6	268658	268663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NT_187147	ATGG	2	8	268680	268687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NT_187147	GAA	2	6	268782	268787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NT_187147	CG	3	6	268792	268797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NT_187147	TCA	2	6	269565	269570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NT_187147	GTC	2	6	269659	269664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NT_187147	GCG	2	6	272861	272866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NT_187147	TTCGTC	2	12	272890	272901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NT_187147	TCG	2	6	272908	272913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NT_187147	CGATG	2	10	272936	272945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1131	NT_187147	GCG	2	6	273207	273212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NT_187147	ATCG	2	8	273242	273249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NT_187147	GCC	3	9	273279	273287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NT_187147	CG	3	6	273304	273309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NT_187147	CAC	2	6	273316	273321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NT_187147	GGCC	2	8	273364	273371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1137	NT_187147	ATC	2	6	274284	274289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NT_187147	TGTT	2	8	274345	274352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NT_187147	TCGA	2	8	275378	275385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1140	NT_187147	TCA	2	6	275547	275552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NT_187147	GCT	3	9	275575	275583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NT_187147	CGC	2	6	275705	275710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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