MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187123	CCTG	2	8	71	78	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187123	CCGT	2	8	106	113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187123	TC	3	6	188	193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187123	AAT	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187123	T	9	9	232	240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187123	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187123	TCA	2	6	321	326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187123	ATT	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187123	TGTTT	2	10	1205	1214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187123	CCT	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187123	AGA	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187123	T	6	6	3230	3235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187123	AAG	2	6	3311	3316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187123	GC	3	6	3333	3338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187123	GGA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187123	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187123	A	7	7	3439	3445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187123	GTG	3	9	3562	3570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187123	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187123	T	8	8	3667	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187123	GAG	2	6	3693	3698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187123	ACG	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187123	GAA	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187123	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187123	GGC	2	6	6656	6661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187123	GTGA	2	8	6704	6711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187123	TAAA	2	8	6761	6768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187123	AAAGT	2	10	10195	10204	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187123	AT	3	6	12048	12053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187123	TGT	2	6	12075	12080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187123	ACA	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187123	GCC	2	6	13712	13717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NT_187123	CGG	2	6	14166	14171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187123	GAC	2	6	14233	14238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187123	TGCAG	2	10	14315	14324	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NT_187123	TCT	2	6	14484	14489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187123	TCCC	2	8	14513	14520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NT_187123	AAGCG	2	10	16579	16588	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NT_187123	GCC	2	6	18164	18169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NT_187123	TTG	2	6	19542	19547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187123	CGA	2	6	20003	20008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187123	TGT	2	6	20041	20046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187123	TTA	2	6	20133	20138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187123	T	6	6	20171	20176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187123	TTTTG	2	10	21668	21677	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187123	GTCAT	2	10	21692	21701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NT_187123	TCT	2	6	21791	21796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187123	GGA	2	6	27550	27555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187123	CG	3	6	28095	28100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NT_187123	TGA	2	6	34008	34013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187123	AGC	2	6	34018	34023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187123	GCT	2	6	34040	34045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187123	ACA	2	6	34051	34056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187123	TGA	2	6	34061	34066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187123	T	7	7	34087	34093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187123	CAA	2	6	34136	34141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187123	TAC	2	6	34167	34172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187123	TTTA	2	8	35625	35632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187123	TAT	2	6	35665	35670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187123	ATTT	2	8	35768	35775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187123	GGT	2	6	35791	35796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187123	GTG	2	6	35820	35825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187123	C	8	8	35990	35997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NT_187123	CAC	2	6	36001	36006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187123	A	6	6	36033	36038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187123	CT	3	6	36110	36115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187123	CGG	2	6	36141	36146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187123	T	6	6	36149	36154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187123	AAT	2	6	36249	36254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187123	CCG	2	6	36299	36304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NT_187123	GCG	2	6	36328	36333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187123	G	6	6	36333	36338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187123	T	7	7	36364	36370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187123	T	6	6	36385	36390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187123	AAT	2	6	36419	36424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187123	ATG	2	6	36484	36489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187123	TCA	2	6	36539	36544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187123	TGT	2	6	36583	36588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187123	T	7	7	36632	36638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187123	AAGCG	2	10	36678	36687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NT_187123	ATCA	2	8	40791	40798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NT_187123	AG	3	6	40821	40826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187123	GTGA	2	8	40848	40855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187123	GTC	2	6	40872	40877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187123	AAT	2	6	40888	40893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187123	TGTA	2	8	40951	40958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187123	TCTT	2	8	40964	40971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NT_187123	T	6	6	41016	41021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187123	TGC	2	6	43699	43704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187123	CGGC	2	8	43721	43728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NT_187123	AGG	3	9	43790	43798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187123	GAA	2	6	44182	44187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187123	T	6	6	44220	44225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187123	GTA	2	6	44240	44245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187123	AT	3	6	44894	44899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187123	T	6	6	44901	44906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187123	TTA	2	6	44908	44913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187123	TGC	2	6	44929	44934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187123	CA	3	6	44951	44956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NT_187123	TAA	2	6	44975	44980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187123	ATT	2	6	44997	45002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187123	A	6	6	45007	45012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187123	GTCT	2	8	45028	45035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NT_187123	GCA	2	6	45082	45087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187123	TAACC	2	10	45155	45164	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NT_187123	GTTG	3	12	45189	45200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187123	TTC	2	6	45302	45307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187123	AAT	2	6	48170	48175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187123	CGC	2	6	48186	48191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NT_187123	GCTT	2	8	48221	48228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NT_187123	GAT	2	6	48245	48250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187123	AGT	2	6	51676	51681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187123	AAGCG	2	10	51752	51761	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NT_187123	CGG	2	6	51795	51800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187123	ATT	2	6	54138	54143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187123	AC	3	6	54232	54237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NT_187123	T	6	6	54333	54338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187123	TG	3	6	54389	54394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187123	ACC	2	6	55425	55430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187123	CGT	2	6	56249	56254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187123	C	6	6	56273	56278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NT_187123	T	6	6	56296	56301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187123	AAT	2	6	56316	56321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187123	AAC	2	6	57238	57243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187123	CTT	2	6	57768	57773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187123	TTG	2	6	57776	57781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187123	AAG	2	6	57793	57798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187123	TAAC	2	8	57802	57809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NT_187123	TG	3	6	57815	57820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187123	TC	3	6	58786	58791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NT_187123	A	6	6	60682	60687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187123	CAT	2	6	61377	61382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187123	TGTGT	2	10	62065	62074	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187123	ACG	2	6	62080	62085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187123	A	6	6	62087	62092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187123	TTGT	2	8	63964	63971	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187123	ACTT	2	8	65922	65929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NT_187123	CGC	2	6	65957	65962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NT_187123	AATAA	2	10	66005	66014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187123	GCA	2	6	68319	68324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187123	GCG	2	6	68327	68332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NT_187123	TCT	2	6	68384	68389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NT_187123	ATA	2	6	68452	68457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187123	T	6	6	68653	68658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187123	TTG	2	6	69990	69995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187123	CAA	2	6	70025	70030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NT_187123	A	6	6	70881	70886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187123	GT	3	6	70910	70915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187123	ATT	2	6	70971	70976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187123	CTT	2	6	71084	71089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NT_187123	GAG	2	6	71109	71114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187123	CT	3	6	71888	71893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NT_187123	CTTTT	2	10	71918	71927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NT_187123	AGT	2	6	73462	73467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187123	CTT	2	6	73512	73517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NT_187123	T	6	6	76558	76563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NT_187123	GAT	2	6	79812	79817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NT_187123	ATG	2	6	79830	79835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NT_187123	CCTA	2	8	82160	82167	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NT_187123	ATTA	2	8	82183	82190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NT_187123	TAA	2	6	82246	82251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NT_187123	TA	3	6	82297	82302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NT_187123	ATTT	2	8	82309	82316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NT_187123	AGTT	2	8	82341	82348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NT_187123	ATTT	2	8	82349	82356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NT_187123	A	6	6	84214	84219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187123	CGGG	2	8	84231	84238	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
173	NT_187123	TTG	2	6	84285	84290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NT_187123	GT	3	6	87807	87812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187123	TAA	2	6	87822	87827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NT_187123	AAAT	2	8	87833	87840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NT_187123	A	7	7	87925	87931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NT_187123	GTT	2	6	89313	89318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NT_187123	A	7	7	89328	89334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NT_187123	TTA	2	6	89341	89346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NT_187123	AGTC	2	8	89395	89402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NT_187123	GC	3	6	89421	89426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
184	NT_187123	TG	3	6	89433	89438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NT_187123	GTGG	2	8	89441	89448	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
186	NT_187123	GAC	2	6	89460	89465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NT_187123	GAC	2	6	89487	89492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NT_187123	CGG	2	6	89500	89505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NT_187123	GGCA	2	8	89510	89517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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192	NT_187123	CTA	2	6	89579	89584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NT_187123	CTG	2	6	89595	89600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
195	NT_187123	CGGG	2	8	89605	89612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
196	NT_187123	CG	3	6	91434	91439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
197	NT_187123	AGA	2	6	91513	91518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NT_187123	TGG	2	6	91659	91664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
199	NT_187123	CGC	2	6	91686	91691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
200	NT_187123	CG	3	6	91705	91710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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209	NT_187123	ATT	2	6	91971	91976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.