MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187117	CGC	2	6	187498	187503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NT_187117	AAT	2	6	187515	187520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NT_187117	CT	3	6	187558	187563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NT_187117	CTA	2	6	187598	187603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NT_187117	ATC	2	6	189023	189028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NT_187117	CAA	2	6	189048	189053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NT_187117	GGC	2	6	189054	189059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NT_187117	GAGC	2	8	189105	189112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NT_187117	GAC	2	6	189139	189144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NT_187117	TCG	2	6	191860	191865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NT_187117	A	6	6	193895	193900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NT_187117	CGG	2	6	193946	193951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NT_187117	T	7	7	193974	193980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NT_187117	CGA	2	6	194067	194072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NT_187117	CGA	2	6	194090	194095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NT_187117	GCT	2	6	194104	194109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NT_187117	A	6	6	194153	194158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NT_187117	CTG	2	6	194167	194172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NT_187117	GGACG	2	10	194187	194196	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
520	NT_187117	ATGA	2	8	194260	194267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NT_187117	GAT	2	6	194371	194376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NT_187117	ATTT	2	8	194390	194397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NT_187117	TCAA	2	8	194440	194447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NT_187117	TTCTA	2	10	194454	194463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
525	NT_187117	GAC	2	6	194465	194470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NT_187117	T	6	6	195839	195844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NT_187117	AT	3	6	195854	195859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NT_187117	CAT	2	6	195889	195894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NT_187117	TAA	2	6	195901	195906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NT_187117	GGC	2	6	195915	195920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NT_187117	A	8	8	195965	195972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NT_187117	ACC	2	6	196049	196054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NT_187117	CCA	2	6	196078	196083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NT_187117	A	7	7	196586	196592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NT_187117	GTT	2	6	196603	196608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NT_187117	T	6	6	196607	196612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NT_187117	GGC	2	6	196624	196629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NT_187117	CCG	2	6	196632	196637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NT_187117	A	6	6	198870	198875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NT_187117	TGT	2	6	198924	198929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NT_187117	ACA	2	6	198930	198935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NT_187117	GCT	2	6	198955	198960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NT_187117	TTTC	2	8	200943	200950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NT_187117	CT	3	6	202100	202105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NT_187117	CTTT	2	8	202139	202146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NT_187117	CAA	2	6	202156	202161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NT_187117	GCT	2	6	202707	202712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NT_187117	AGCC	2	8	202714	202721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NT_187117	A	7	7	202751	202757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NT_187117	GC	3	6	202769	202774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NT_187117	GTA	2	6	202865	202870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NT_187117	ATC	2	6	202923	202928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NT_187117	A	6	6	206745	206750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NT_187117	GC	3	6	207381	207386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NT_187117	GAA	2	6	207459	207464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NT_187117	A	8	8	207463	207470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NT_187117	TAA	2	6	208617	208622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NT_187117	GCC	2	6	208692	208697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NT_187117	CGT	2	6	208749	208754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NT_187117	GTT	2	6	208758	208763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NT_187117	GATG	2	8	208792	208799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NT_187117	AAGC	2	8	208806	208813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NT_187117	TGC	2	6	210829	210834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NT_187117	CATT	2	8	210895	210902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NT_187117	GAA	2	6	214206	214211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NT_187117	TGT	2	6	220437	220442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NT_187117	GACAG	2	10	220496	220505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
568	NT_187117	ATAA	2	8	220525	220532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NT_187117	GAG	2	6	221044	221049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NT_187117	TGA	2	6	221066	221071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NT_187117	TGA	2	6	222228	222233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NT_187117	GCCT	2	8	222261	222268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NT_187117	A	6	6	222350	222355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NT_187117	TTTCG	2	10	222356	222365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
575	NT_187117	TCT	2	6	222431	222436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NT_187117	CGC	2	6	223116	223121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NT_187117	ATTA	2	8	223133	223140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NT_187117	TAA	2	6	224547	224552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NT_187117	CA	3	6	224575	224580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NT_187117	TGCG	2	8	224627	224634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NT_187117	CAT	3	9	224661	224669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NT_187117	T	8	8	224742	224749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NT_187117	ATA	2	6	227104	227109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NT_187117	TCA	2	6	227161	227166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NT_187117	CGCTA	2	10	227167	227176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
586	NT_187117	GGT	2	6	227179	227184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NT_187117	ATA	2	6	228201	228206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NT_187117	TCAT	2	8	228226	228233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NT_187117	TGA	2	6	228242	228247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NT_187117	T	6	6	228268	228273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NT_187117	AGC	2	6	228433	228438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NT_187117	A	6	6	228447	228452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NT_187117	TCA	2	6	228589	228594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NT_187117	ATG	2	6	228679	228684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NT_187117	CG	3	6	228717	228722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NT_187117	GA	3	6	228732	228737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NT_187117	TGT	2	6	228771	228776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NT_187117	TCCTC	2	10	234711	234720	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
599	NT_187117	TC	3	6	234725	234730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NT_187117	ATGAC	2	10	234861	234870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
601	NT_187117	A	7	7	235998	236004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NT_187117	TAT	2	6	236043	236048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NT_187117	GCG	2	6	236049	236054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NT_187117	T	6	6	236057	236062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NT_187117	ACA	2	6	236095	236100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NT_187117	CAC	2	6	238635	238640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NT_187117	GCC	2	6	238692	238697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NT_187117	GGC	2	6	242290	242295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NT_187117	TGT	2	6	242324	242329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NT_187117	TCT	2	6	242376	242381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NT_187117	CTAC	2	8	243290	243297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NT_187117	AGC	2	6	243326	243331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NT_187117	ATA	2	6	243334	243339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NT_187117	T	6	6	243402	243407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NT_187117	T	7	7	243411	243417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NT_187117	GAG	2	6	244255	244260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NT_187117	CAAA	2	8	244263	244270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NT_187117	ATT	2	6	244293	244298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NT_187117	TAC	2	6	244300	244305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NT_187117	CCAG	2	8	245490	245497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NT_187117	A	6	6	245518	245523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NT_187117	CAT	2	6	245526	245531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NT_187117	A	6	6	245548	245553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NT_187117	GAT	2	6	245586	245591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NT_187117	TAC	2	6	245710	245715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NT_187117	AAT	2	6	246543	246548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NT_187117	GGA	2	6	246560	246565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NT_187117	A	7	7	246594	246600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NT_187117	CCG	2	6	246602	246607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NT_187117	T	6	6	246615	246620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NT_187117	A	6	6	247622	247627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NT_187117	CT	3	6	247628	247633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NT_187117	GCGCT	2	10	247774	247783	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
634	NT_187117	CGT	2	6	248950	248955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NT_187117	A	7	7	248968	248974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NT_187117	TGC	2	6	248997	249002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NT_187117	CT	4	8	249550	249557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NT_187117	TAT	2	6	249575	249580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NT_187117	TTCA	2	8	249637	249644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NT_187117	AGC	2	6	249654	249659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NT_187117	A	6	6	249667	249672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NT_187117	GATGT	2	10	251060	251069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
643	NT_187117	TGC	3	9	251087	251095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NT_187117	T	6	6	251103	251108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NT_187117	ACG	2	6	251110	251115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NT_187117	CAT	2	6	251120	251125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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