MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187114	GCC	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187114	TAC	3	9	69	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187114	TAA	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187114	CTC	2	6	261	266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187114	A	7	7	283	289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187114	TCA	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187114	ATT	2	6	345	350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187114	GA	3	6	388	393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187114	GGC	2	6	1542	1547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187114	GT	3	6	1558	1563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187114	AGG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187114	AAAG	2	8	5279	5286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187114	CGC	2	6	7579	7584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NT_187114	GCG	2	6	7601	7606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187114	AAT	2	6	9805	9810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187114	TA	3	6	9862	9867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187114	ATT	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187114	ATA	2	6	9891	9896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187114	TAA	2	6	9946	9951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187114	AAACGG	2	12	9954	9965	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NT_187114	CT	3	6	9981	9986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187114	ATTA	2	8	10074	10081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187114	ATA	2	6	10287	10292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187114	CAGA	2	8	10309	10316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187114	CTT	2	6	10412	10417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187114	GTC	2	6	10428	10433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187114	CGC	2	6	10441	10446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NT_187114	GGCG	2	8	10504	10511	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187114	CTTAGG	2	12	10563	10574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NT_187114	TAA	3	9	10736	10744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187114	AAT	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187114	CTA	2	6	10772	10777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187114	CCAG	2	8	11860	11867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NT_187114	AT	3	6	11887	11892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187114	AG	4	8	11901	11908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187114	ATA	2	6	11987	11992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187114	ACG	2	6	12000	12005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187114	AGC	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187114	AAAT	2	8	12036	12043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187114	AT	3	6	12042	12047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187114	TGC	2	6	12080	12085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187114	ACTT	2	8	12109	12116	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187114	TCGC	2	8	12135	12142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187114	ATT	2	6	12165	12170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187114	TA	3	6	12176	12181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187114	ATT	2	6	12184	12189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187114	ATA	2	6	12194	12199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187114	TAC	2	6	12219	12224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187114	AAC	2	6	12309	12314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187114	CTT	2	6	12330	12335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187114	AGT	2	6	12390	12395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187114	GTA	2	6	12402	12407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187114	T	6	6	14551	14556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187114	TGA	2	6	14580	14585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187114	A	6	6	14592	14597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187114	ACC	2	6	14631	14636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NT_187114	TG	4	8	14759	14766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187114	GAT	3	9	14790	14798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187114	TCT	2	6	14817	14822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187114	AAC	2	6	14919	14924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187114	ACA	2	6	14988	14993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187114	GAA	2	6	15168	15173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187114	TTAA	2	8	16283	16290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187114	TCT	2	6	18577	18582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187114	A	6	6	18620	18625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187114	CTG	2	6	21578	21583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187114	C	6	6	21673	21678	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NT_187114	TGT	2	6	21738	21743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187114	AAT	2	6	21754	21759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187114	AGC	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187114	CAATAA	2	12	27021	27032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NT_187114	AC	3	6	29658	29663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187114	GCG	2	6	29704	29709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187114	GCC	2	6	29717	29722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187114	CG	3	6	29978	29983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187114	CCT	2	6	29996	30001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187114	CAC	2	6	30923	30928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NT_187114	GT	3	6	30939	30944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187114	AGG	2	6	30980	30985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187114	ATT	2	6	31720	31725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187114	ATTA	2	8	31777	31784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187114	TG	3	6	31824	31829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187114	TTC	2	6	31892	31897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187114	CCAT	2	8	31932	31939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NT_187114	GTC	2	6	31957	31962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187114	C	8	8	32003	32010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NT_187114	GCC	2	6	32051	32056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187114	AAC	2	6	32061	32066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187114	TA	3	6	32082	32087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187114	AAT	2	6	32162	32167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187114	ATC	3	9	32185	32193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187114	TAAT	2	8	32351	32358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187114	AAC	3	9	32363	32371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187114	CGC	2	6	32380	32385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NT_187114	A	6	6	32390	32395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187114	CAAA	2	8	32396	32403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NT_187114	TAAA	2	8	32433	32440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187114	TTA	2	6	32461	32466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187114	TA	3	6	32465	32470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187114	ACCA	2	8	32515	32522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NT_187114	TGAT	2	8	32534	32541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187114	CTTAC	2	10	33426	33435	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NT_187114	CAG	2	6	33501	33506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187114	GGA	2	6	33548	33553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187114	ACG	2	6	33885	33890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187114	CAT	2	6	33927	33932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187114	CT	3	6	35332	35337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187114	TCA	2	6	35369	35374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187114	GAG	2	6	35379	35384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187114	GCC	2	6	35925	35930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NT_187114	TCA	2	6	35946	35951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187114	AATC	2	8	35962	35969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NT_187114	ACA	2	6	39913	39918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187114	ATT	2	6	39943	39948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187114	TTC	2	6	39957	39962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187114	A	6	6	39993	39998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187114	TC	3	6	40001	40006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NT_187114	AAC	2	6	42511	42516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187114	T	6	6	43519	43524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187114	TC	3	6	43571	43576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NT_187114	TCA	2	6	43592	43597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187114	TCA	2	6	43617	43622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187114	AAT	2	6	43650	43655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187114	GAA	2	6	44969	44974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187114	TC	3	6	45140	45145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NT_187114	T	6	6	45150	45155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187114	GGC	2	6	45201	45206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187114	TAA	2	6	45290	45295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187114	TAA	2	6	45917	45922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187114	CTG	2	6	45952	45957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187114	ACA	2	6	45967	45972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187114	AAT	2	6	45992	45997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187114	AAC	2	6	46010	46015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187114	T	6	6	48773	48778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187114	CAA	2	6	48786	48791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187114	TAG	2	6	50227	50232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187114	TTA	2	6	50240	50245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187114	ATTA	2	8	50280	50287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187114	T	6	6	51041	51046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187114	ATC	3	9	51109	51117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187114	TAA	2	6	52758	52763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187114	GGC	2	6	52777	52782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NT_187114	ATT	2	6	53925	53930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187114	TATCT	2	10	53990	53999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NT_187114	GGA	2	6	54055	54060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187114	ACTT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NT_187114	GGA	2	6	54193	54198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187114	TCCT	2	8	54247	54254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NT_187114	TCA	2	6	54292	54297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NT_187114	GGA	2	6	54327	54332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.