MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187108	CCTG	2	8	33	40	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187108	AACG	2	8	84	91	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187108	CA	3	6	121	126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187108	AGC	3	9	474	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187108	GA	3	6	559	564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187108	GAC	3	9	792	800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187108	ATC	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187108	T	6	6	862	867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187108	CAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187108	AATA	2	8	910	917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187108	AAT	2	6	1137	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187108	TCA	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187108	ATT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187108	GAA	2	6	3560	3565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187108	TGAA	2	8	3594	3601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187108	GAA	2	6	3634	3639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187108	GAA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187108	TCTT	2	8	5408	5415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187108	TTC	2	6	5443	5448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187108	A	6	6	5474	5479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187108	TAA	2	6	5517	5522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187108	CAA	2	6	5529	5534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187108	GGA	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187108	CAG	3	9	6669	6677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187108	GTTTT	2	10	6738	6747	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187108	AT	4	8	6861	6868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187108	TCA	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187108	GCA	2	6	6896	6901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187108	CGA	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187108	TTG	2	6	6924	6929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187108	ATTC	2	8	6951	6958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187108	CAA	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187108	TCG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187108	ACTA	2	8	7101	7108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187108	CA	3	6	7115	7120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187108	TCCA	2	8	7164	7171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187108	ATG	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187108	TTC	2	6	7439	7444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187108	TCA	2	6	7456	7461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187108	CATT	2	8	7482	7489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NT_187108	TCT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187108	TGC	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187108	GTC	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187108	AAT	2	6	8758	8763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187108	ATG	2	6	8779	8784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187108	TGT	3	9	8838	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187108	TTC	2	6	13654	13659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187108	CCT	2	6	13702	13707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187108	CTAT	2	8	15178	15185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NT_187108	AAT	2	6	15209	15214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187108	GGC	2	6	15229	15234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187108	GAGT	2	8	15239	15246	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187108	CCT	2	6	15623	15628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187108	ATTTT	2	10	15725	15734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187108	GCCT	2	8	15891	15898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NT_187108	ATG	2	6	15966	15971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187108	TGA	2	6	16004	16009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187108	AAGT	2	8	16018	16025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187108	GAT	2	6	16054	16059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187108	ATT	2	6	16107	16112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187108	ATA	2	6	17098	17103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187108	T	6	6	17162	17167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187108	CGG	2	6	17175	17180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187108	TCA	2	6	17198	17203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187108	AAT	2	6	17362	17367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187108	CT	3	6	17395	17400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187108	GTAAGT	2	12	17409	17420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187108	GA	3	6	17447	17452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187108	CATTT	2	10	17479	17488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NT_187108	TGA	2	6	17520	17525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187108	AAAT	2	8	17542	17549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187108	TCC	2	6	17551	17556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.