MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187098	TCAA	2	8	19	26	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187098	ATAA	2	8	27	34	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187098	AG	3	6	46	51	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187098	TAC	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187098	GGA	2	6	94	99	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187098	AAC	2	6	1565	1570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187098	ATG	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187098	TTA	2	6	2719	2724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187098	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187098	GAG	2	6	2868	2873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187098	CACT	2	8	4362	4369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187098	GGT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187098	T	7	7	4461	4467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187098	CAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187098	TGA	2	6	4536	4541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187098	AC	3	6	6406	6411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187098	GA	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187098	GCTT	2	8	7101	7108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NT_187098	TCAG	2	8	7129	7136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187098	GC	3	6	8381	8386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187098	TA	3	6	8389	8394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187098	GCC	2	6	8438	8443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NT_187098	TA	3	6	8457	8462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187098	CTT	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187098	ATT	2	6	9267	9272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187098	CAT	2	6	9985	9990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187098	GGAT	2	8	10014	10021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187098	A	6	6	10156	10161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187098	CG	3	6	12219	12224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NT_187098	ATTC	2	8	12952	12959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NT_187098	GTC	2	6	13700	13705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187098	TA	3	6	13728	13733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187098	T	6	6	13979	13984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187098	GCC	2	6	13988	13993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NT_187098	ATG	2	6	14032	14037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187098	ATTG	2	8	14049	14056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187098	TAA	2	6	15735	15740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187098	A	6	6	15739	15744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187098	T	7	7	15773	15779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187098	CT	3	6	15911	15916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187098	TTTA	2	8	15967	15974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187098	ACA	2	6	16091	16096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187098	CG	4	8	16523	16530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187098	TGA	2	6	16832	16837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187098	GAA	2	6	16840	16845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187098	GGC	2	6	16860	16865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187098	G	7	7	16881	16887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187098	AC	3	6	16905	16910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NT_187098	GTG	2	6	17168	17173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187098	AAT	2	6	17294	17299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187098	T	6	6	17494	17499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187098	ATC	2	6	17543	17548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187098	GTC	2	6	18684	18689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187098	AAT	2	6	18726	18731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187098	CAGGC	2	10	18784	18793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NT_187098	TGA	2	6	18806	18811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187098	GAT	2	6	18812	18817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187098	GTA	2	6	18856	18861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187098	G	6	6	18862	18867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187098	ATTT	2	8	18950	18957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187098	AG	3	6	19001	19006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187098	TAAT	2	8	19047	19054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187098	GCG	2	6	21091	21096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187098	TGC	2	6	21101	21106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187098	TGC	2	6	21191	21196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187098	CAGT	2	8	21218	21225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NT_187098	TCA	2	6	21252	21257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187098	GTT	2	6	21272	21277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187098	TAGT	2	8	21317	21324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187098	CTA	2	6	21336	21341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187098	TAT	2	6	21374	21379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187098	TGCT	2	8	21447	21454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187098	AT	3	6	21455	21460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187098	AC	3	6	22103	22108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187098	ATG	2	6	22142	22147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187098	ATGA	2	8	22149	22156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187098	GCAA	2	8	22242	22249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NT_187098	A	6	6	22271	22276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187098	TTA	2	6	22282	22287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187098	ATT	2	6	22379	22384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187098	TTA	2	6	22389	22394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187098	A	7	7	23332	23338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187098	A	6	6	23360	23365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187098	TTC	2	6	23374	23379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187098	T	6	6	23386	23391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187098	AGA	2	6	23419	23424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187098	GCA	2	6	23504	23509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187098	TGAAGA	2	12	23555	23566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187098	TCA	2	6	23569	23574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187098	TTG	2	6	23589	23594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187098	GAT	2	6	23633	23638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187098	AAG	2	6	23720	23725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187098	CGG	2	6	23741	23746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187098	AAT	2	6	23822	23827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187098	TGTT	2	8	23828	23835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187098	A	6	6	23850	23855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187098	AGG	2	6	23882	23887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187098	ACC	2	6	23954	23959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NT_187098	TGATG	2	10	24016	24025	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187098	GCG	2	6	24110	24115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187098	TTG	2	6	24193	24198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187098	TTTG	2	8	24285	24292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187098	TTAA	2	8	24408	24415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187098	TTG	2	6	24450	24455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187098	T	7	7	24483	24489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187098	AAT	2	6	24514	24519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187098	TAT	2	6	24633	24638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187098	GTG	2	6	24662	24667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187098	TA	3	6	24723	24728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187098	GTC	2	6	24729	24734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187098	CAA	2	6	24806	24811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187098	T	6	6	24813	24818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187098	GGC	2	6	24902	24907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187098	ATCA	2	8	24912	24919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NT_187098	AGG	2	6	24945	24950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187098	TCA	2	6	25012	25017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187098	ACTGA	2	10	25026	25035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NT_187098	CTGA	2	8	25230	25237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NT_187098	CT	3	6	26365	26370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NT_187098	TTCT	2	8	26429	26436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NT_187098	GGT	2	6	26446	26451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187098	CTG	2	6	26476	26481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187098	TGT	2	6	26508	26513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187098	TTGA	2	8	26605	26612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187098	TGT	2	6	26648	26653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187098	TGT	2	6	26666	26671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187098	CCTT	2	8	26703	26710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NT_187098	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187098	ATC	2	6	27042	27047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187098	TTAT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187098	TGC	2	6	27825	27830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187098	TGG	2	6	27866	27871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187098	AT	3	6	27879	27884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187098	TGG	2	6	27890	27895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187098	AC	3	6	27901	27906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NT_187098	GGC	2	6	28038	28043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187098	TA	3	6	28075	28080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187098	CTG	2	6	28131	28136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187098	ATTA	2	8	28153	28160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187098	AGA	2	6	28199	28204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187098	ATTA	2	8	28773	28780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187098	TGC	2	6	28889	28894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NT_187098	GTCG	2	8	28895	28902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NT_187098	TAT	2	6	28996	29001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187098	TGT	2	6	29441	29446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187098	TTG	2	6	29456	29461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187098	AGC	2	6	29468	29473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NT_187098	AAT	3	9	29498	29506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187098	ATT	2	6	29562	29567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187098	T	7	7	29580	29586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187098	CATTT	2	10	29610	29619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NT_187098	ATA	2	6	29648	29653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NT_187098	TA	3	6	29652	29657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187098	TTAA	2	8	29666	29673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187098	GTG	2	6	29697	29702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187098	AGC	2	6	29740	29745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NT_187098	AAC	2	6	29799	29804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NT_187098	ATAA	2	8	29811	29818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187098	TG	3	6	29837	29842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NT_187098	GCA	2	6	29845	29850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NT_187098	A	9	9	29932	29940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NT_187098	AAAAT	2	10	29975	29984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NT_187098	TA	3	6	30875	30880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NT_187098	CGT	2	6	30911	30916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NT_187098	TTA	2	6	30972	30977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NT_187098	T	7	7	31005	31011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187098	GTT	2	6	31024	31029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NT_187098	GAT	2	6	31052	31057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NT_187098	GAT	2	6	31359	31364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NT_187098	AAT	2	6	38238	38243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NT_187098	AAT	2	6	38265	38270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NT_187098	TA	3	6	38338	38343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NT_187098	AGGCC	2	10	39631	39640	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NT_187098	A	6	6	41708	41713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NT_187098	T	9	9	41723	41731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NT_187098	GTC	2	6	41745	41750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NT_187098	TAA	2	6	44200	44205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NT_187098	AAT	3	9	44222	44230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NT_187098	GTT	2	6	44248	44253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NT_187098	TTA	2	6	45163	45168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NT_187098	T	7	7	45210	45216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NT_187098	ATA	2	6	45250	45255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NT_187098	ATT	2	6	45286	45291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NT_187098	AGT	2	6	72715	72720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NT_187098	TAA	2	6	72736	72741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NT_187098	T	6	6	72950	72955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NT_187098	AGG	2	6	73080	73085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NT_187098	CGC	2	6	73307	73312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NT_187098	GTG	2	6	73316	73321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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286	NT_187098	GT	3	6	73780	73785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NT_187098	CAATT	2	10	74359	74368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NT_187098	GAAAT	2	10	74385	74394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NT_187098	AG	3	6	76055	76060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NT_187098	AGCG	2	8	76062	76069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
291	NT_187098	CGA	2	6	76070	76075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.