MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187091	GT	3	6	932	937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187091	ATT	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187091	TAT	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187091	AAATG	2	10	1032	1041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187091	ATT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187091	GTG	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187091	TAA	2	6	1130	1135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187091	GAT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187091	A	7	7	1167	1173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187091	TCAT	2	8	1848	1855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187091	CGC	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187091	TTA	2	6	1917	1922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187091	AC	3	6	1946	1951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187091	ACC	2	6	1966	1971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187091	A	6	6	2162	2167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187091	T	7	7	2177	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187091	AGT	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187091	TCA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187091	T	7	7	2310	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187091	CT	3	6	2317	2322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187091	TTC	2	6	2330	2335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187091	T	6	6	2814	2819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187091	GAT	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187091	ATC	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187091	CATC	2	8	2852	2859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187091	A	7	7	2916	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187091	TGT	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187091	TAA	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187091	ATA	2	6	4276	4281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187091	CAA	2	6	4306	4311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187091	A	6	6	4352	4357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187091	T	6	6	4406	4411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187091	ATA	2	6	4412	4417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187091	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187091	AT	4	8	4440	4447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187091	T	6	6	4461	4466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187091	TTTGA	2	10	4484	4493	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187091	T	6	6	4519	4524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187091	A	8	8	4559	4566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187091	ATAAA	2	10	4597	4606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187091	TAA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187091	TAA	2	6	4648	4653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187091	GTT	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187091	CAG	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187091	ACA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187091	TAAT	2	8	4866	4873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187091	GTG	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187091	TAA	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187091	AG	3	6	5289	5294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187091	ATT	2	6	6046	6051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187091	TCAC	2	8	8862	8869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187091	ATT	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187091	CGC	2	6	8963	8968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187091	AGA	2	6	9010	9015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187091	AGG	2	6	10012	10017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187091	GTC	2	6	10254	10259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187091	TGA	2	6	10310	10315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187091	CGG	2	6	12903	12908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187091	AAG	2	6	12944	12949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187091	GCA	2	6	12986	12991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187091	TCAT	2	8	13036	13043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NT_187091	A	6	6	13046	13051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187091	A	7	7	13068	13074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187091	CTT	2	6	13130	13135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187091	T	7	7	13173	13179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187091	AGG	2	6	13533	13538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187091	CTCA	2	8	14410	14417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187091	ATC	2	6	14553	14558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187091	TAAAG	2	10	14560	14569	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187091	AT	3	6	14618	14623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187091	T	6	6	14635	14640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187091	ATTT	2	8	14644	14651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187091	CGA	2	6	15587	15592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187091	TCATT	2	10	15614	15623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NT_187091	CGA	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187091	GCG	2	6	15686	15691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187091	CAT	3	9	15729	15737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187091	TCG	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187091	CCT	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NT_187091	CTG	2	6	25480	25485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187091	A	6	6	25489	25494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187091	ACA	2	6	25837	25842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187091	GCG	2	6	25879	25884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187091	GACGC	2	10	25888	25897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NT_187091	T	6	6	25930	25935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187091	GC	3	6	25941	25946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NT_187091	TTG	2	6	25974	25979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187091	TTA	2	6	25987	25992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187091	CATT	2	8	26021	26028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NT_187091	CTA	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187091	AT	3	6	26086	26091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187091	ATA	2	6	26103	26108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187091	TTA	2	6	26122	26127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187091	TA	3	6	26160	26165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187091	AGAC	2	8	26257	26264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NT_187091	AAT	2	6	26271	26276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187091	AAT	2	6	26286	26291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187091	T	6	6	26300	26305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187091	CTG	2	6	26312	26317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187091	ATAA	2	8	26321	26328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187091	ATC	2	6	26329	26334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187091	ATA	2	6	26398	26403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187091	ATT	2	6	26404	26409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187091	CAAA	2	8	26450	26457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NT_187091	TA	3	6	26475	26480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187091	GAC	2	6	26505	26510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187091	CCG	2	6	26569	26574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NT_187091	AAG	2	6	28067	28072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187091	TAC	2	6	28079	28084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187091	TAA	2	6	28110	28115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187091	GGC	2	6	28163	28168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187091	TCT	2	6	28198	28203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187091	GCC	2	6	28655	28660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187091	GAA	2	6	30199	30204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187091	GATT	2	8	34166	34173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187091	T	6	6	34214	34219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187091	CTT	2	6	35552	35557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187091	GGCA	2	8	37932	37939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NT_187091	GCC	2	6	37944	37949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187091	T	6	6	38004	38009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187091	ATA	2	6	38031	38036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187091	AC	3	6	38043	38048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NT_187091	AAT	2	6	40545	40550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187091	ATT	2	6	40570	40575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187091	TA	4	8	40647	40654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187091	ATA	2	6	40686	40691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187091	TATCAA	2	12	40697	40708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NT_187091	T	6	6	41508	41513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187091	GGC	2	6	41789	41794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187091	GTT	2	6	41830	41835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187091	T	6	6	41834	41839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187091	TGC	2	6	41877	41882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187091	AT	3	6	41890	41895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187091	TTC	2	6	41897	41902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187091	TTA	2	6	41912	41917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187091	ATT	2	6	41936	41941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187091	AGC	2	6	42011	42016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187091	ACG	2	6	42063	42068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187091	ACA	2	6	42070	42075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187091	ACA	2	6	44722	44727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187091	CGC	2	6	45300	45305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NT_187091	GTGA	2	8	45324	45331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187091	GCA	2	6	45387	45392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187091	GCTG	2	8	45548	45555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NT_187091	A	8	8	45562	45569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187091	TGG	2	6	45665	45670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187091	AAT	2	6	45758	45763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187091	ACC	2	6	45788	45793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NT_187091	T	7	7	45803	45809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NT_187091	CA	3	6	92913	92918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
293	NT_187091	TG	3	6	95251	95256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
294	NT_187091	T	6	6	95262	95267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NT_187091	TG	3	6	95272	95277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NT_187091	CAG	2	6	95320	95325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.