MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187087	ATT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187087	ATT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187087	AAT	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187087	GAG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187087	ATA	2	6	202	207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187087	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187087	TGT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187087	ATT	3	9	283	291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187087	ATTA	2	8	298	305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187087	TTG	2	6	328	333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187087	TTG	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187087	TATTG	2	10	378	387	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187087	TAAATG	2	12	430	441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187087	TAA	2	6	467	472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187087	TAA	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187087	TA	3	6	690	695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187087	TGTC	2	8	719	726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187087	TG	3	6	831	836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187087	ATGG	2	8	841	848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187087	ATCTCG	2	12	896	907	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187087	T	6	6	1086	1091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187087	ACA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187087	CG	3	6	1131	1136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NT_187087	T	7	7	3761	3767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187087	TATT	2	8	3825	3832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187087	ATA	2	6	3869	3874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187087	GTT	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187087	TAT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187087	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187087	GA	3	6	5078	5083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187087	CAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187087	T	7	7	14386	14392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187087	GTT	2	6	14414	14419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187087	T	6	6	14430	14435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187087	TTTTC	2	10	14552	14561	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NT_187087	TTATT	2	10	15392	15401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187087	T	6	6	17215	17220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187087	TGT	2	6	17225	17230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187087	G	6	6	17235	17240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187087	TTCTT	2	10	17325	17334	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NT_187087	A	6	6	17344	17349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187087	A	6	6	17876	17881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187087	T	6	6	17897	17902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187087	A	7	7	19160	19166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187087	CAT	2	6	19182	19187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187087	GAT	2	6	19200	19205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187087	A	8	8	19255	19262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187087	A	8	8	19293	19300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187087	AATC	2	8	19835	19842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NT_187087	AAAAAT	2	12	19945	19956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187087	T	7	7	23310	23316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187087	GCGG	2	8	25443	25450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NT_187087	CCCG	2	8	25459	25466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NT_187087	TGC	2	6	25982	25987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187087	A	7	7	25999	26005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187087	TAA	2	6	26720	26725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187087	TACA	2	8	27313	27320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187087	ATA	2	6	28945	28950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187087	CCAG	2	8	28954	28961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NT_187087	GA	3	6	29001	29006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187087	TTC	2	6	29068	29073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187087	GAA	2	6	29108	29113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187087	CCA	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NT_187087	ACGG	2	8	31155	31162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NT_187087	A	6	6	31172	31177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187087	CT	3	6	31885	31890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187087	TAAT	2	8	31902	31909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187087	AAT	2	6	31917	31922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187087	GAA	2	6	32152	32157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187087	T	6	6	32397	32402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187087	A	6	6	32448	32453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.