MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187080	CCA	2	6	23	28	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187080	A	6	6	33	38	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187080	T	6	6	54	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187080	GGCGA	2	10	149	158	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187080	CCA	2	6	180	185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187080	GGC	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187080	TGCGC	2	10	270	279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187080	CGC	2	6	329	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187080	ATT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187080	TTA	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187080	T	6	6	445	450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187080	G	6	6	1537	1542	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187080	T	7	7	1553	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187080	TC	3	6	1610	1615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187080	ACT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187080	T	6	6	1692	1697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187080	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187080	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187080	GCC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187080	CAAA	2	8	1818	1825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187080	GCTG	2	8	1852	1859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NT_187080	ATGGC	2	10	1875	1884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187080	TG	3	6	1893	1898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187080	TGA	2	6	1912	1917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187080	AT	3	6	1922	1927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187080	CG	3	6	1951	1956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NT_187080	ATG	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187080	GAT	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187080	TGA	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187080	GTG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187080	TTTGC	2	10	2142	2151	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NT_187080	GC	3	6	2230	2235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187080	CG	4	8	2248	2255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NT_187080	TCA	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187080	CAT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187080	T	6	6	3302	3307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187080	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187080	GTCA	2	8	3754	3761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187080	CGC	3	9	3790	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NT_187080	GCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187080	AAT	2	6	3824	3829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187080	T	7	7	3895	3901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187080	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187080	AGAT	2	8	3963	3970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187080	CATT	2	8	3982	3989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NT_187080	AGGA	2	8	6640	6647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187080	TTA	2	6	6660	6665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187080	TAG	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187080	TTA	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187080	TA	3	6	8554	8559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187080	ACAG	2	8	8573	8580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NT_187080	ATT	2	6	8594	8599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187080	GTT	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187080	TTCT	2	8	8675	8682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NT_187080	ATTA	2	8	8691	8698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187080	TTG	2	6	8731	8736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187080	GTT	2	6	8761	8766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187080	TAA	2	6	8776	8781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187080	ATT	2	6	10092	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187080	TAT	2	6	10111	10116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187080	CGT	2	6	10391	10396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187080	CCA	2	6	10409	10414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NT_187080	TGC	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187080	CGA	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187080	A	6	6	10575	10580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187080	TGC	3	9	10606	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187080	GTG	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187080	CG	3	6	10677	10682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187080	GCC	2	6	10746	10751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NT_187080	CT	3	6	10794	10799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187080	ACC	2	6	10803	10808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187080	CA	3	6	10816	10821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187080	CTGG	2	8	10832	10839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NT_187080	GCT	2	6	10853	10858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187080	GGC	2	6	10916	10921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187080	A	6	6	10944	10949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187080	CCTGCA	2	12	10964	10975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187080	CCA	2	6	10984	10989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NT_187080	GCT	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187080	TCC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NT_187080	TGG	2	6	11101	11106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187080	CGC	2	6	11165	11170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.