MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GGA	2	6	27	32	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187076	TATT	2	8	33	40	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187076	A	6	6	1146	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187076	TTG	2	6	1152	1157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187076	GCG	2	6	5432	5437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187076	CA	3	6	5817	5822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187076	GCGCT	2	10	7147	7156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187076	TCA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187076	CGC	2	6	7206	7211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187076	CGG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187076	G	6	6	8259	8264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187076	CTG	2	6	8271	8276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187076	TGA	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187076	G	6	6	9257	9262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187076	CAGGT	2	10	9410	9419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NT_187076	GGAA	2	8	9422	9429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187076	CCCA	2	8	9477	9484	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NT_187076	CTG	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187076	GCC	2	6	11205	11210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187076	TGTTA	2	10	11268	11277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187076	AAC	2	6	11595	11600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187076	A	7	7	11690	11696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187076	A	7	7	11703	11709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187076	AGGG	2	8	11738	11745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187076	T	6	6	11753	11758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187076	GTA	2	6	12263	12268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187076	A	6	6	12299	12304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187076	CG	3	6	12900	12905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187076	TGG	2	6	12913	12918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187076	AAT	2	6	12938	12943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187076	TTA	2	6	13015	13020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187076	GAG	2	6	13029	13034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187076	TAA	2	6	13315	13320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187076	AACT	2	8	13753	13760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187076	A	6	6	13809	13814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187076	TCG	2	6	13894	13899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187076	TTGT	2	8	13925	13932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187076	T	6	6	13951	13956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187076	TTAA	2	8	14022	14029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187076	TTA	2	6	14095	14100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187076	A	6	6	14108	14113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187076	AATC	2	8	14115	14122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187076	A	6	6	14154	14159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187076	TGC	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187076	TAT	2	6	18630	18635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187076	CGT	2	6	18636	18641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187076	TACA	2	8	18649	18656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NT_187076	ATGT	2	8	18664	18671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187076	TGTT	2	8	19399	19406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187076	ATT	2	6	19432	19437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187076	GC	3	6	22849	22854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187076	GC	3	6	22864	22869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187076	TTG	2	6	23823	23828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187076	TTCAA	2	10	24586	24595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NT_187076	AT	3	6	25181	25186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187076	AG	3	6	25770	25775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187076	AG	5	10	27815	27824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187076	GGC	2	6	28772	28777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187076	TTG	2	6	28855	28860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187076	ACGG	2	8	30798	30805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NT_187076	ACGG	2	8	30856	30863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NT_187076	AGCGCC	2	12	31001	31012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NT_187076	T	6	6	31021	31026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187076	ATA	2	6	31027	31032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187076	GGC	2	6	31077	31082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187076	TGG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187076	A	6	6	31128	31133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187076	T	6	6	31808	31813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187076	GGC	2	6	32029	32034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187076	A	6	6	33997	34002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187076	TCG	2	6	34025	34030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187076	CGTC	2	8	34050	34057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187076	GC	3	6	34058	34063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187076	GC	3	6	35445	35450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187076	A	6	6	37221	37226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187076	A	7	7	37241	37247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187076	ACGGA	2	10	37271	37280	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NT_187076	ATG	2	6	37309	37314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187076	TAG	2	6	38618	38623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187076	ATT	2	6	38632	38637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187076	GAAG	2	8	38668	38675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187076	TAT	2	6	38701	38706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187076	GA	3	6	38747	38752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187076	GC	3	6	40437	40442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NT_187076	CTG	2	6	40467	40472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187076	CTT	2	6	41012	41017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187076	A	6	6	41062	41067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187076	ATA	3	9	41149	41157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187076	TCGG	2	8	42077	42084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NT_187076	A	7	7	42936	42942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187076	ATTTTT	2	12	42958	42969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187076	TA	4	8	42993	43000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187076	TAA	2	6	43026	43031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187076	TGC	2	6	43048	43053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187076	TCA	2	6	45593	45598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187076	CCT	2	6	47470	47475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187076	C	6	6	47545	47550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NT_187076	TTA	2	6	47551	47556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187076	AAC	2	6	47590	47595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187076	GAT	2	6	49062	49067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187076	GAC	2	6	49094	49099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187076	GC	3	6	49115	49120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NT_187076	AG	3	6	49130	49135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187076	CT	3	6	50000	50005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NT_187076	GC	3	6	50040	50045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NT_187076	CGTT	2	8	50898	50905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NT_187076	GCC	2	6	50952	50957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NT_187076	GCT	2	6	51714	51719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187076	GTTTT	2	10	51833	51842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187076	GCT	2	6	51948	51953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187076	AAC	2	6	51956	51961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187076	ACC	2	6	51983	51988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NT_187076	CGG	2	6	52005	52010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187076	CAG	2	6	52015	52020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187076	GC	4	8	52033	52040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187076	CAC	2	6	52152	52157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187076	GGC	2	6	52188	52193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187076	GC	3	6	52192	52197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NT_187076	CGG	2	6	52204	52209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187076	AGG	3	9	52235	52243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187076	ACA	2	6	54768	54773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187076	TTA	2	6	54792	54797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187076	CTAT	2	8	54824	54831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187076	AC	3	6	56051	56056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NT_187076	GCCT	2	8	56065	56072	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NT_187076	AC	3	6	56086	56091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NT_187076	CAT	2	6	56099	56104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187076	AAT	2	6	56107	56112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187076	CAG	2	6	56121	56126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187076	ATC	2	6	59924	59929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187076	CCT	2	6	60909	60914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NT_187076	AGT	2	6	60957	60962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187076	ATA	2	6	60968	60973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187076	CTT	2	6	61619	61624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187076	CGCT	2	8	62515	62522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NT_187076	T	6	6	62533	62538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187076	AAT	2	6	65168	65173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187076	T	7	7	65185	65191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187076	GAA	2	6	66197	66202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187076	AAT	2	6	67453	67458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187076	TTTAT	2	10	67474	67483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187076	ATTT	2	8	67484	67491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187076	AAC	2	6	67513	67518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NT_187076	CGT	2	6	70461	70466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187076	ACG	2	6	70468	70473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187076	A	7	7	72974	72980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187076	AGG	2	6	73032	73037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187076	CCG	2	6	73043	73048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NT_187076	A	7	7	132474	132480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NT_187076	TAA	2	6	186996	187001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NT_187076	GTC	2	6	187005	187010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NT_187076	GCA	2	6	187013	187018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NT_187076	GCTC	2	8	187019	187026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
434	NT_187076	TCAT	2	8	187042	187049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
435	NT_187076	GCA	2	6	187079	187084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NT_187076	GTG	2	6	187173	187178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NT_187076	GCC	2	6	187201	187206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NT_187076	GCA	3	9	187232	187240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
439	NT_187076	CGCA	2	8	187269	187276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
440	NT_187076	GC	3	6	187292	187297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
441	NT_187076	GTT	2	6	187301	187306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NT_187076	TCC	2	6	187919	187924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NT_187076	AGT	2	6	190520	190525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NT_187076	GGT	2	6	190561	190566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
445	NT_187076	GCATA	2	10	190577	190586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
446	NT_187076	GCA	2	6	192291	192296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
447	NT_187076	CGG	2	6	193288	193293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
448	NT_187076	ACG	2	6	193304	193309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
449	NT_187076	TAT	3	9	195333	195341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NT_187076	ATT	2	6	195850	195855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.